一种KASP标记及其在小麦灌浆后期冠层持绿且偏冷型鉴定中的应用制造技术

本发明专利技术公开了一种KASP标记及其在小麦灌浆后期冠层持绿且偏冷型鉴定中的应用。本发明专利技术提供了检测小麦染色体1B上SNP位点AX

【技术实现步骤摘要】
一种KASP标记及其在小麦灌浆后期冠层持绿且偏冷型鉴定中的应用


[0001]本专利技术属于生物
，涉及一种KASP标记及其在小麦灌浆后期冠层持绿且偏冷型鉴定中的应用。

技术介绍

[0002]叶片是植物进行光合作用的主要场所，对维持植株生长发育、产量品质有重要作用。在小麦中，籽粒产量主要由旗叶衰老时期的光合作用所贡献，(因此为达到最大产量就必须维持在灌浆期间叶片的光合)。要获得高产，既要求光合源(特别是旗叶)有较强的光合物质生产能力，又要求叶片中的光合产物较多地分配到籽粒中去，从而提高粒重和产量。
[0003]持绿型小麦品种叶功能期长、叶绿素含量高于非持绿品种，对穗数、千粒重等产量构成影响显著，能够减轻灌浆期干旱胁迫引起的负效应。在叶片衰老过程中，光合作用是变化最大和最明显的生理过程，叶绿素降解与合成引起含量变化是叶片衰老可见的表型性状，持绿可以修复或减缓这种性状发生。研究表明，具有持绿基因的小麦植株冠温较低，易获得更多生物量和产量，且这种性状可以遗传给后代，通过与其他小麦材料杂交，能对后代冠层温度状态产生较好影响。因此，持绿不仅仅能延迟衰老，或许存在没有被发现的功能，充分利用持绿型小麦材料创建具有更好的生物学性状和高产优良品种是可行的。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的是提供了2个与小麦灌浆后期(花后21天)冠层持绿和偏冷性状相关的SNP位点，基于上述位点开发了2个KASP标记专用引物，这些KASP标记引物可以用来鉴定或辅助鉴定小麦衰老相关性状。
[0005]第一方面，本专利技术提供了如下B，A和B，在如下任一种中的应用：
[0006]1)鉴定或辅助鉴定待测小麦冠层灌浆后期持绿且偏冷型特性；
[0007]2)鉴定或辅助鉴定待测小麦冠层灌浆后期持绿性；
[0008]3)鉴定或辅助鉴定待测小麦冠层灌浆后期的温度；
[0009]4)鉴定或辅助鉴定待测小麦灌浆后期的衰老程度；
[0010]5)选育冠层灌浆后期持绿偏冷型小麦；
[0011]6)选育衰老程度低的小麦；
[0012]7)选育产量高的小麦；
[0013]8)小麦遗传育种；
[0014]所述A为检测小麦染色体1B上SNP位点AX
‑
86174278位点的基因型的物质；
[0015]所述B为检测小麦染色体4B上SNP位点AX
‑
109381183位点的基因型的物质；
[0016]所述SNP位点AX
‑
86174278位点为SEQ ID NO:7第36位；
[0017]所述SNP位点AX
‑
109381183位点为SEQ ID NO:8第36位。
[0018]上文所述应用中，
[0019]所述SNP位点AX
‑
86174278位点的基因型为TT、CC或CT；
[0020]所述SNP位点AX
‑
109381183位点的基因型为AA、GG或AG。
[0021]上文所述应用中，
[0022]所述检测小麦染色体1B上SNP位点AX
‑
86174278位点的基因型的物质为A1)或A2)：
[0023]A1)成套引物1；
[0024]A2)含有所述成套引物1的PCR试剂或试剂盒；
[0025]所述成套引物1包括引物F1
‑
1、引物F1
‑
2及引物1
‑
R；
[0026]所述引物F1
‑
1的核苷酸序列包括SEQ ID NO:1第22
‑
42位所示的序列；
[0027]所述引物F1
‑
2的核苷酸序列包括SEQ ID NO:2第22
‑
42位所示的序列；
[0028]所述引物1
‑
R的核苷酸序列为SEQ ID NO:3；
[0029]所述检测小麦染色体4B上SNP位点AX
‑
109381183位点的基因型的物质为B1)或B2)：
[0030]B1)成套引物2；
[0031]B2)含有所述成套引物2的PCR试剂或试剂盒；
[0032]所述成套引物3包括引物F2
‑
1、引物F2
‑
2及引物2
‑
R；
[0033]所述引物F2
‑
1的核苷酸序列包括SEQ ID NO:4第22
‑
39位所示的序列；
[0034]所述引物F2
‑
2的核苷酸序列包括SEQ ID NO:5第22
‑
39位所示的序列；
[0035]所述引物2
‑
R的核苷酸序列为SEQ ID NO:6。
[0036]上文所述应用中，
[0037]所述引物F1
‑
1的核苷酸序列为SEQ ID NO:1；
[0038]所述引物F1
‑
2的核苷酸序列为SEQ ID NO:2；
[0039]或，所述引物F2
‑
1的核苷酸序列为SEQ ID NO:4；
[0040]所述引物F2
‑
2的核苷酸序列为SEQ ID NO:5。
[0041]上述每组所述成套引物组还包括荧光探针A、荧光探针B、淬灭探针A、淬灭探针B；
[0042]所述荧光探针A、荧光探针B、淬灭探针A、淬灭探针B的核苷酸序列依次为SEQ ID NO:9
‑
SEQ ID NO:12；
[0043]所述荧光探针A和所述荧光探针B的末端标记不同的荧光基团；
[0044]所述淬灭探针A和所述淬灭探针B的末端标记不同的淬灭基团。
[0045]第二方面，本专利技术提供了如下任一物质：
[0046]第一方面中所述成套引物2；
[0047]或第一方面中所述成套引物1和所述成套引物2；
[0048]或含有第一方面中所述的成套引物的PCR试剂或试剂盒；
[0049]或SEQ ID NO:7所示DNA片段；
[0050]或SEQ ID NO:8所示DNA片段；
[0051]所述PCR试剂由PCR试剂1和PCR试剂2组成；
[0052]所述PCR试剂1包括所述引物F1
‑
1、所述引物F1
‑
2、所述引物1
‑
R、荧光探针A、荧光探针B、淬灭探针A和淬灭探针B；
[0053]所述PCR试剂2包括所述引物F2
‑
1、所述引物F2
‑
2、所述引物2
‑
R、所述荧光探针A、所述荧光探针B、所述淬灭探针A和所述淬灭探针B；
[0054]所述荧光探针A、荧光探针B、淬灭探针A、淬灭探针B的核苷酸序列依次为SEQ ID NO本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.如下B，A和B，在如下任一种中的应用：1)鉴定或辅助鉴定待测小麦冠层灌浆后期持绿且偏冷型特性；2)鉴定或辅助鉴定待测小麦冠层灌浆后期持绿性；3)鉴定或辅助鉴定待测小麦冠层灌浆后期的温度；4)鉴定或辅助鉴定待测小麦灌浆后期的衰老程度；5)选育冠层灌浆后期持绿偏冷型小麦；6)选育衰老程度低的小麦；7)选育产量高的小麦；8)小麦遗传育种；所述A为检测小麦染色体1B上SNP位点AX
‑
86174278位点的基因型的物质；所述B为检测小麦染色体4B上SNP位点AX
‑
109381183位点的基因型的物质；所述SNP位点AX
‑
86174278位点为SEQ ID NO:7第36位；所述SNP位点AX
‑
109381183位点为SEQ ID NO:8第36位。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述SNP位点AX
‑
86174278位点的基因型为TT、CC或CT；所述SNP位点AX
‑
109381183位点的基因型为AA、GG或AG。3.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于：所述检测小麦染色体1B上SNP位点AX
‑
86174278位点的基因型的物质为A1)或A2)：A1)成套引物1；A2)含有所述成套引物1的PCR试剂或试剂盒；所述成套引物1包括引物F1
‑
1、引物F1
‑
2及引物1
‑
R；所述引物F1
‑
1的核苷酸序列包括SEQ ID NO:1第22
‑
42位所示的序列；所述引物F1
‑
2的核苷酸序列包括SEQ ID NO:2第22
‑
42位所示的序列；所述引物1
‑
R的核苷酸序列为SEQ ID NO:3；所述检测小麦染色体4B上SNP位点AX
‑
109381183位点的基因型的物质为B1)或B2)：B1)成套引物2；B2)含有所述成套引物2的PCR试剂或试剂盒；所述成套引物3包括引物F2
‑
1、引物F2
‑
2及引物2
‑
R；所述引物F2
‑
1的核苷酸序列包括SEQ ID NO:4第22
‑
39位所示的序列；所述引物F2
‑
2的核苷酸序列包括SEQ ID NO:5第22
‑
39位所示的序列；所述引物2
‑
R的核苷酸序列为SEQ ID NO:6。4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于：所述引物F1
‑
1的核苷酸序列为SEQ ID NO:1；所述引物F1
‑
2的核苷酸序列为SEQ ID NO:2；或，所述引物F2
‑
1的核苷酸序列为SEQ ID NO:4；所述引物F2
‑
2的核苷酸序列为SEQ ID NO:5。5.如下任一物质：权利要求3或4中所述成套引物2；或权利要求3或4中所述成套引物1和所述成套引物2；
或含有权利要求3或4中所述的成套引物的PCR试剂或试剂盒；或SEQ ID NO:7所示DNA片段；或SEQ ID NO:8所示DNA片段；所述PCR试剂由PCR试剂1和PCR试剂2组成；所述PCR试剂1包括所述引物F1
‑
1、所述引物F1
‑
2、所述引物1
‑
R、荧光探针A、荧光探针B、淬灭探针A和淬灭探针B；所述PCR试剂2包括所述引物F2
‑
1、所述引物F2
‑
2、所述引物2
‑
R、所述荧光探针A、所述荧光探针B、所述淬灭探针A和所述淬灭探针B；所述荧光探针A、荧光探针B、淬灭探针A、淬灭探针B的核苷酸序列依次为SEQ ID NO:9
‑
SEQ ID NO:12；所述荧光探针A和所述荧光探针B的末端标记不同的荧光基团；所述淬灭探针A和所述淬灭探针B的末端标记不同的淬灭基团。6....

【专利技术属性】
技术研发人员：肖永贵，李雷，杨梦娇，夏先春，何中虎，
申请(专利权)人：中国农业科学院作物科学研究所，
类型：发明
国别省市：