与小麦多小穗基因相连锁的分子标记、及其特异性引物和应用制造技术

本发明专利技术涉及遗传育种领域，具体涉及与小麦多小穗基因相连锁的分子标记、及其特异性引物和应用。本发明专利技术获得的与多小穗基因紧密连锁的分子标记，是在对我国多小穗的小麦种质10

【技术实现步骤摘要】
与小麦多小穗基因相连锁的分子标记、及其特异性引物和应用


[0001]本专利技术涉及遗传育种领域，具体涉及与小麦多小穗基因相连锁的分子标记、及其特异性引物和应用。

技术介绍

[0002]提高小麦产量是实现全球粮食和营养安全的紧迫任务。小麦产量通常由三个主要性状构成，即单位面积穗数、每穗粒数和千粒重。育种家通过对这三个产量性状的改良来实现产量的提高。小穗数通过影响每个小穗的穗粒数量从而影响小麦的产量。因此，多小穗数材料对小麦产量育种工作具有重要意义。
[0003]小麦小穗数是由多个基因控制的复杂数量性状，因此为了在育种实践中获得最佳基因型，需要确定这些多基因的数目、染色体定位和遗传效应。由于小麦基因组的复杂性，目前只有少数与小穗数相关的基因通过同源克隆的方法被克隆出来。对小麦小穗数产生作用的基因主要集中在小麦穗发育的相关3个时期，第一个时期为穗分生组织的起始和发育时期，即生长锥到单棱期。在这期间主要影响穗发育的基因有FT/VRN3、Ppd
‑
1、TB1、Q、VRN1、VRN4、VRN2。其中TB1、VRN2为负调节基因，其余基因都是正调剂基因。第二阶段为小穗分生组织发育阶段时期，即单棱期到护颖原基分化期。在这期间主要影响穗发育的基因有WAPO1、TaSPL14、WFZP、TaAGL6，都是正调节基因。第三阶段为小花分化阶段，即护颖原基分化期到药隔分化期。主要影响小穗发育的基因为GN11、FUL。其中GN11为负调节基因，FUL为正向调节基因。穗部发育萎缩突变体sda1(spike development atrophy 1)，该基因可能是转化利用植株中同化产物的关键基因，同时还影响小麦花器官发育和抽穗期。虽然报道了一些基因，还远远不足以了解小穗数的发育，这也极大地限制了小麦育种中小穗数基础分子机制的剖析和小穗数的提高。因此，鉴定和验证新的小穗数基因是至关重要的。
[0004]利用分子标记对多小穗基因进行精确定位，将有助于多小穗基因材料的有效利用。利用分子标记进行基因定位具有简单、快速、精确等优点。单核苷酸多态性(SNP)标记比早期基于DNA杂交和聚合酶链反应的分子标记种类丰富得多。基于微阵列的大量单核苷酸多态性探针基因分型阵列现在可作为Illumina Infinium BeadChip或AffymetrixAxiom阵列使用，允许对育种材料进行强大且经济高效的基因分型。SNP标记技术与DNA微阵列和芯片技术的结合，使SNP标记技术成为继RFLP和SSR标记之后最有前途的第三代分子标记。并在遗传图谱构建、种质资源分析和生物多样性检测、连锁不平衡的关联分析等农作物育种领域发挥着重要作用。

技术实现思路

[0005]为了解决上述问题，本申请的专利技术人提出并完成了本专利技术。
[0006]本专利技术的目的是提供及与小麦多小穗基因相连锁的分子标记。
[0007]本专利技术的再一目的是提供上述与小麦多小穗基因相连锁的分子标记的应用。
[0008]本专利技术的再一目的是提供一种鉴定小麦多小穗品种的方法。
[0009]根据本专利技术的与小麦多小穗基因相连锁的分子标记，通过使用KASP引物KASP
‑
AX
‑
111956072分型而得，其定位在小麦2D短臂上，物理距离为1.46Mb，
[0010]所述KASP引物KASP
‑
AX
‑
111956072由以下引物组成：
[0011]正向引物A:5
’‑
CATGCTGCATGATAGTAGTAGCCCCCG
‑3’
,正向引物B:5
’‑
TTGCATGATAGTAGTAGCCCCCA
‑3’
,反向引物:5
’‑
GACCAATCGCGG
‑3’
。
[0012]根据本专利技术的具体实施方式，以10
‑
A/B39的F
2:8
群体为作图群体，通过SNP标记鉴定结果和田间表型数据间的连锁分析，获得了与小麦多小穗基因连锁的标记KASP
‑
AX
‑
111956072，通过检测分子标记KASP
‑
AX
‑
111956072的分型结果，结合田间小穗数表型数据，该标记可应用于小麦多小穗品种的辅助选择育种。
[0013]根据本专利技术的鉴定小麦多小穗基因的方法，所述方法包括使用KASP引物扩增待检测材料的步骤，其中，所述KASP引物包括：
[0014]正向引物A:5
’‑
CATGCTGCATGATAGTAGTAGCCCCCG
‑3’
,正向引物B:5
’‑
TTGCATGATAGTAGTAGCCCCCA
‑3’
,反向引物:5
’‑
GACCAATCGCGG
‑3’
，FAM信号标记与正向引物A相连，HEX信号与正向引物B相连，结果中，橙黄色荧光为母本10
‑
A型，即携带多小穗基因，蓝色荧光为父本B39型，不携带多小穗基因，绿色荧光为杂合型。
[0015]本专利技术的积极性效果及应用如下：
[0016]本专利技术获得的与多小穗基因紧密连锁的分子标记，是在对我国多小穗的小麦种质10
‑
A及其遗传作图群体中获得的新标记，该标记与多小穗基因遗传距离近，重复性好，稳定性强，可以用于小麦多小穗品种鉴定和小麦多小穗后代的分子辅助选择，进而加快多小穗品种的育种进程。
附图说明
[0017]图1显示KASP
‑
AX
‑
111956072在“10
‑
A
×
B39”F 2:8
重组自交系群体中不同类型间的差异，其中，+：10
‑
A类型，
‑
：B39类型；
[0018]图2显示KASP
‑
AX
‑
111956072在“10
‑
A
×
BE89”F 2:8
重组自交系群体中不同类型间的差异，其中A：KASP分型图，橙黄色为10
‑
A类型，蓝色为B39类型，绿色为杂合型，黑色为空白对照，B：不同类型间小穗数的差异，group1：10
‑
A类型，group2：B39类型，group3：杂合型；
[0019]图3显示KASP
‑
AX
‑
111956072在“10
‑
A
×
川农16”F 2:5
重组自交系群体中不同类型间的差异，其中，A：为KASP分型图，橙黄色为10
‑
A类型，蓝色为B39类型，绿色为杂合型，黑色为空白对照，B：为不同类型间小穗数的差异，group1：10
‑
A类型，group2：本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.与小麦多小穗基因相连锁的分子标记，其特征在于，通过使用KASP引物分型而得，其定位在小麦2D短臂上，物理距离为1.46Mb，所述KASP引物由以下引物组成：正向引物A:5
’‑
CATGCTGCATGATAGTAGTAGCCCCCG
‑3’
,正向引物B:5
’‑
TTGCATGATAGTAGTAGCCCCCA
‑3’
,反向引物:5
’‑
GACCAATCGCGG
‑3’
。2.权利要求1所述与小麦多小穗基因相连锁的分子标记用于鉴定小麦多小穗性状的应用。3.一种鉴定小麦多小穗基因的方法，其特征在于，所述方法包括使用KASP引物扩增待检测材料的步骤，其中，所述KASP引物由以下引物组成：正向引物A:5
’‑
CAT...

【专利技术属性】
技术研发人员：李伟，易晓余，李震，叶映彤，彭远英，马建，蒲至恩，刘亚西，祁鹏飞，江千涛，陈国跃，王际睿，魏育明，郑有良，
申请(专利权)人：四川农业大学，
类型：发明
国别省市：