通过分析甲基化DNA来检测肺肿瘤制造技术

技术编号:37506063 阅读:35 留言:0更新日期:2023-05-07 09:42
本文提供用于肺肿瘤筛选的技术,并且具体地而非排他地是用于检测肺癌的存在的方法、组合物和相关用途。合物和相关用途。

【技术实现步骤摘要】
通过分析甲基化DNA来检测肺肿瘤
[0001]本申请是申请日为2017年3月28日,申请号:201780031660.8,专利技术名称为“通过分析甲基化DNA来检测肺肿瘤”的中国专利申请的分案申请。
[0002]本申请要求2016年5月5日提交的美国临时申请序列号62/332,295和2017年2月23日提交的美国临时申请序列号62/462,677的优先权,所述申请各自以引用方式并入本文。


[0003]本文提供与检测肿瘤相关的技术,并且具体地而非排他地是与用于检测肿瘤诸如肺癌的方法、组合物和相关用途相关的技术。

技术介绍

[0004]肺癌在美国仍为排行第一的癌症杀手,并且极度需要有效筛选方法。仅肺癌就每年造成221,000例死亡。DNA甲基化特征已在癌症的情况下在DNA启动子区域中显示独特的模式并且具有用于检测肺部恶性肿瘤的潜在应用。然而,需要最佳辨别的标记和标记小组。

技术实现思路

[0005]本文提供一种对组织测定的甲基化的甲基化标记的集合,所述集合对于所有类型的肺癌实现极高的辨别,同时在正常肺组织和良性结节本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种处理样品的方法,所述方法包括:a)测定来自受试者的样品的至少一种选自由以下组成的组的甲基化标记的量:BARX1、LOC100129726、SPOCK2、TSC22D4、MAX.chr8.124、RASSF1、ZNF671、ST8SIA1、NKX6_2、FAM59B、DIDO1、MAX_Chr1.110、AGRN、SOBP、MAX_chr10.226、ZMIZ1、MAX_chr8.145、MAX_chr10.225、PRDM14、ANGPT1、MAX.chr16.50、PTGDR_9、ANKRD13B、DOCK2、MAX_chr19.163、ZNF132、MAX chr19.372、HOXA9、TRH、SP9、DMRTA2、ARHGEF4、CYP26C1、ZNF781、PTGDR、GRIN2D、MATK、BCAT1、PRKCB_28、ST8SIA_22、FLJ45983、DLX4、SHOX2、EMX1、HOXB2、MAX.chr12.526、BCL2L11、OPLAH、PARP15、KLHDC7B、SLC12A8、BHLHE23、CAPN2、FGF14、FLJ34208、B3GALT6、BIN2_Z、DNMT3A、FERMT3、NFIX、S1PR4、SKI、SUCLG2、TBX15、ZDHHC1以及ZNF329;b)测定所述样品的参考标记的量;c)比较所述样品中所述至少一种甲基化标记的量与参考标记的量以确定所述样品中所述至少一种甲基化标记的甲基化状态;以及任选地d)生成报告所述样品中所述至少一种甲基化标记的所述甲基化状态的记录。2.如权利要求1所述的方法,其中所述测定包括从受试者获得包含DNA的样品并用选择性修饰所获得DNA中的未甲基化胞嘧啶残基的试剂处理从所述样品中获得的DNA以产生修饰的残基。3.如权利要求1或权利要求2所述的方法,其中所述至少一种甲基化标记包括选自由以下组成的组的甲基化标记:SLC12A8、KLHDC7B、PARP15、OPLAH、BCL2L11、MAX.chr12.526、HOXB2、EMX1 ...

【专利技术属性】
技术研发人员:H阿拉维GP利德加德M吉亚科莫普洛斯DA阿尔奎斯特WR泰勒D马奥尼
申请(专利权)人:梅奥医疗教育与研究基金会
类型:发明
国别省市:

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