本发明专利技术提供进行基于第1设施取得的核酸序列数据，在第2设施中使用同一受试者的多个核酸序列数据的解析的计算机的控制方法等。控制在基因组合检查中将使用读取核酸序列的测序仪2得到解析委托方设施10的核酸序列数据由第2设施解析的计算机。从解析委托方设施10经网络11接收与含从同一受试者的受试体调制的第1及第2库的多个库试样的各自相对应的含使用测序仪2得到的多个核酸序列数据的序列数据集和表示第1及第2库试样从同一受试者的受试体调制的关联信息。对与第1及第2库试样的各自相对应的第1及第2核酸序列数据进行解析，输出基于第1及第2序列数据的解析结果的解析信息。第1及第2序列数据的解析结果的解析信息。第1及第2序列数据的解析结果的解析信息。
【技术实现步骤摘要】
控制方法及解析系统
[0001]本专利技术涉及控制用于在基因组合检查中将使用读取核酸序列的测序仪由第1设施得到的核酸序列数据由第2设施解析的计算机的控制方法。另外，本专利技术涉及在基因组合检查中将使用读取核酸序列的测序仪由第1设施得到的核酸序列数据由第2设施解析的解析系统。
技术介绍
[0002]伴随癌基因组医疗的进展，在医疗设施中，推进实施基因组合检查的体制的整备。在其中，为了活用于新的研究，积累了向检查室导入第二代测序仪(NGS)，通过基因组合检查而得到的见解的医疗设施也增加。
[0003]一方面，在基因组合检查中，必须由生物信息学家的数据解析。但是，生物信息学家的数少，有难确保人材的情况。因此，在基因组合检查之中，有想要向外部的专门机关委托用医疗设施取得的核酸序列数据的解析的需求。
[0004]在专利文献1中记载了，测序仪取得核酸序列数据，向云环境发送取得的核酸序列数据，由云环境解析核酸序列数据的系统。能根据上述专利文献1中记载的系统，将用测序仪取得的核酸序列数据由云环境解析。
[0005]【现有技术文献】
[0006]【专利文献】
[0007]【专利文献1】美国专利9,444,880号公报
[0008]【专利技术的概要】
[0009]【专利技术要解决的课题】
[0010]由于NGS通常同时综合测定多数(例如，16)的测定试样(库)，以1次的测定得到与从多个受试者采集的多个库的各自相对应的多个核酸序列数据。再者，有因基因组合检查的种类而需要组合解析与从同一受试者的受试体调制的多个库各自相对应的核酸序列数据的情况。
[0011]例如，在匹配的对检查中，对从同一受试者采集的肿瘤受试体的核酸序列数据和非肿瘤受试体的核酸序列数据进行组合解析。在这样的情况中，在向外部委托基因组合检查中的核酸序列数据的解析时，在外部的解析设施中，从用NGS取得的多个核酸序列数据之中提取与同一受试者的多个受试体相对应的各自的核酸序列数据的正确的组合，必需对其正确的组合的多个核酸序列数据进行解析。
[0012]但是，在上述专利文献1中未考虑，从作为解析委托方设施的医疗设施取得的多个核酸序列数据之中，在外部的解析设施中提取同一受试者的多个核酸序列数据，为了所述受试者执行使用多个核酸序列数据的解析。
[0013]从而，本专利技术的目的在于，提供基于第1设施取得的核酸序列数据，能正确并且迅速地在第2设施中进行使用同一受试者的多个核酸序列数据的解析的控制方法、及解析系统。
[0014]【用于解决课题的手段】
[0015]本专利技术的控制方法是控制用于在基因组合检查中将使用读取核酸序列的测序仪由第1设施得到的核酸序列数据由第2设施解析的计算机的控制方法，从上述第1设施经网络接收与含从同一受试者的受试体调制的第1库试样及第2库试样的多个库试样的各自相对应的含使用上述测序仪得到的多个核酸序列数据的序列数据集和表示上述第1库试样及上述第2库试样从上述同一受试者的受试体调制的关联信息，对与由上述关联信息关联的上述第1库试样及上述第2库试样的各自相对应的第1序列数据及第2序列数据进行解析，输出基于上述第1序列数据的解析结果和上述第2序列数据的解析结果的解析信息。
[0016]另外，本专利技术的解析系统是在基因组合检查中将使用读取核酸序列的测序仪由第1设施得到的核酸序列数据由第2设施解析的解析系统，具备从上述第1设施经网络接收与含从同一受试者的受试体调制的第1库试样及第2库试样的多个库试样的各自相对应的含使用上述测序仪得到的核酸序列数据的序列数据集和表示上述第1库试样及上述第2库试样从上述同一受试者的受试体调制的关联信息，向第2计算机发送从上述第1设施取得的上述序列数据集及上述关联信息的第1计算机和对由上述关联信息关联的上述第1序列数据及上述第2序列数据进行解析、输出基于上述第1序列数据的解析结果和上述第2序列数据的解析结果的解析信息的上述第2计算机。
[0017]另外，本专利技术的解析系统是在基因组合检查中将使用读取核酸序列的测序仪由第1设施得到的核酸序列数据由第2设施解析的解析系统，具备从上述第1设施经网络接收与含从同一受试者的受试体调制的第1库试样及第2库试样的多个库试样的各自相对应的含使用上述测序仪得到的核酸序列数据的序列数据集和表示上述第1库试样及上述第2库试样从上述同一受试者的受试体调制的关联信息，对由上述关联信息关联的上述第1序列数据及上述第2序列数据进行解析，输出基于上述第1序列数据的解析结果和上述第2序列数据的解析结果的解析信息的计算机。
[0018]【专利技术的效果】
[0019]由本专利技术可提供基于第1设施取得的核酸序列数据，能正确并且迅速地在第2设施中进行使用同一受试者的多个核酸序列数据的解析的控制方法、及解析系统。
[0020]【附图的简单的说明】
[0021]【图1】是第1实施方式涉及的设置于各设施的核酸信息发送接收系统的概略构成图。
[0022]【图2】是对于测序仪执行的处理进行说明的流程图。
[0023]【图3】是显示样品片的一例的图的【图4】是对于测序仪制成的序列运行数据的一例进行说明的图。
[0024]【图5】是显示变形例的样品片的图。
[0025]【图6】(A)是显示其他变形例的样品片的图，(B)是进一步显示其他变形例的样品片的图。
[0026]【图7】是对数据发送装置、接受装置、及核酸序列解析装置的各控制部执行的处理进行说明的流程图。
[0027]【图8】是显示数据发送装置的显示部中显示的病例注册画面的一例的图。
[0028]【图9】是对接受装置的控制部执行的匹配性验证处理的详细进行说明的流程图。
[0029]【图10】是显示核酸序列解析装置的控制部确定核酸序列时的处理程序的一例的流程图。
[0030]【图11】是显示单一的变异参照序列的生成方法的模式图。
[0031]【图12】是显示核酸序列解析装置的控制部检测体细胞变异的处理的流程图。
[0032]【图13】是显示核酸序列解析装置的控制部检测生殖细胞变异的处理的流程图。
[0033]【图14】(A)是显示体细胞变异的核酸序列的例的图，(B)是显示生殖细胞变异的核酸序列的例的图。
[0034]【图15】是显示解析报告书的报告的样式的一例的图。
[0035]【图16】是对于第2实施方式中测序仪执行的处理进行说明的流程图。
[0036]【图17】是显示第2实施方式的样品片的一例的图。
[0037]【图18】是显示第2实施方式中数据发送装置的显示部中显示的病例注册画面的一例的图。
[0038]【图19】是第2实施方式中，对接受装置的控制部执行的匹配性验证处理的详细内容进行说明的流程图。
[0039]【图20】是对于第3实施方式中测序仪执行的处理进行说明的流程图。
[0040]【图21】是显示第3实施方式的样品片的一例的图。
[00本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.控制计算机的控制方法，其中所述计算机用于在基因组合检查中将使用读取核酸序列的测序仪由第1设施得到的核酸序列数据由第2设施解析，其包括：从所述第1设施经网络接收与含从同一受试者的受试体调制的第1库试样及第2库试样的多个库试样的各自相对应的：含使用所述测序仪得到的多个核酸序列数据的序列数据集、和表示所述第1库试样及所述第2库试样从所述同一受试者的受试体调制的关联信息，对与由所述关联信息关联的所述第1库试样及所述第2库试样的各自相对应的第1序列数据及第2序列数据进行解析，及输出基于所述第1序列数据的解析结果和所述第2序列数据的解析结果的解析信息。2.权利要求1所述的控制方法，其中由第1计算机接收所述序列数据集及所述关联信息，向第2计算机发送接收的所述序列数据集及所述关联信息，由所述第2计算机解析所述第1序列数据及所述第2序列数据，及输出所述解析信息。3.权利要求1所述的控制方法，其中由计算机接收所述序列数据集及所述关联信息，对所述第1序列数据及所述第2序列数据进行解析，及输出所述解析信息。4.权利要求1～3之任一项所述的控制方法，其中所述第1库试样是由所述受试者的肿瘤受试体调制的试样，所述第2库试样是由所述受试者的非肿瘤受试体调制的试样，且所述解析信息含：基于所述第1序列数据的解析结果的体细胞变异的信息、和基于所述第2序列数据的解析结果的生殖细胞变异的信息。5.权利要求1～3之任一项所述的控制方法，其中所述第1库试样是由所述受试者的肿瘤受试体中所含的脱氧核糖核酸调制的试样，所述第2库试样是由所述肿瘤受试体中所含的核糖核酸调制的试样，所述解析信息含：基于所述第1序列数据的解析结果的体细胞变异的信息、和基于所述第2序列数据的解析结果的融合基因变异的信息。6.权利要求5所述的控制方法，其中所述序列数据集还含与从所述同一受试者的非肿瘤受试体调制的第3库试样相对应的第3序列数据，所述关联信息是除了所述第1库试样及所述第2库试样之外，表示所述第3库试样由所述同一受试者的受试体调制的信息，除了所述第1序列数据及所述第2序列数据的解析之外，对所述第3序列数据进一步进行解析，且所述解析信息除了基于所述第1序列数据的解析结果的体细胞变异的信息及基于所述第2序列数据的解析结果的融合基因变异的信息之外，还含基于所述第3序列数据的解析结
果的生殖细胞变异的信息。7.权利要求4或6所述的控制方法，其中所述非肿瘤受试体是从所述受试者采集的血液受试体。8.权利要求1～7之任一项所述的控制方法，其中从所述第1设施经所述网络还接收含下列之中的至少1个解析委托信息：所述受试者的病例信息、所述基因组合检查的类别信息、及所述第1设施的信息。9.权利要求1～8之任一项所述的控制方法，其中取得人操作所述第1设...
【专利技术属性】
技术研发人员：脇元立，田中克则，鹫尾尊规，
申请(专利权)人：株式会社理真思，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。