一种评估5-FU治疗胃癌癌敏感性的探针引物组及其试剂盒制造技术

本发明专利技术公开了一种评估5

【技术实现步骤摘要】
一种评估5
‑
FU治疗胃癌癌敏感性的探针引物组及其试剂盒


[0001]本专利技术涉及生物医药
，具体地涉及一种评估5
‑
FU治疗胃癌癌敏感性的的探针引物组及其试剂盒。

技术介绍

[0002]胃癌是一种起源于胃黏膜上皮的恶性肿瘤，居于我国恶性肿瘤发病率的首位，早期胃癌多数患者无明显症状，使得早期诊断率较低，从而影响治疗效果。胃癌的发生发展机制目前尚未完全明确，尽管当前医疗技术水平不断发展，对于胃癌的早期诊断、治疗及预后的判断方法层不不穷，但对于生长迅速及高转移的进展期胃癌临床治疗效果仍然较差，仅有约20％的5年生存率。从分子机制的角度探索胃癌的潜在治疗靶点对临床治疗具有重要意义，故寻找胃癌组织的相关生物标志物对诊治胃癌具有重要意义，对早期胃癌诊治具有重要的价值。临床上，早期胃癌以手术治疗为主，进展期及晚期胃癌治疗以化疗为主。
[0003]5‑
氟尿嘧啶(5
‑
FU)为当前联合化疗中最常用的药物之一，但在治疗过程中癌细胞对5
‑
FU耐药性的产生严重阻碍了其临床应用的开展。因此，探索耐药产生的机制、寻找克服耐药的对策成为改善5
‑
FU治疗胃癌效果及预后的关键。AGPS、FAR1、GNPAT和Peds1基因或相关蛋白表达在胃癌组织中呈现异常情况，但尚无关于这4个基因联合检测对胃癌耐药相关性的研究或报道。

技术实现思路

[0004]有鉴于此，为了克服现有技术中的不足之处，本专利技术的所解决的技术问题在于提供一种评估5
‑
FU治疗胃癌癌敏感性的的探针引物组及其试剂盒。
[0005]为了实现上述目的，本专利技术是通过以下方案予以实现的：
[0006]检测AGPS基因、FAR1基因、GNPAT基因和Peds1基因的试剂在制备评估5
‑
氟尿嘧啶治疗胃癌敏感性的试剂盒中的应用，所述AGPS基因在GenBank上的登录号为NM_003659.4，所述FAR1基因在GenBank上的登录号为NM_032228.6，所述GNPAT基因在GenBank上的登录号为NM_001316350，所述Peds1基因在GenBank上的登录号为NM_001162505。
[0007]一种检测试剂，所述检测试剂包括：分别检测AGPS基因、FAR1基因、GNPAT基因和Peds1基因的中一个或几个的上下游引物和探针的组合；
[0008]所述扩增AGPS基因的上下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2所示，所述检测AGPS基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO：11所示，所述AGPS基因在GenBank上的登录号为NM_003659.4；
[0009]所述扩增FAR1基因的上下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：3和SEQ ID NO：4所示，所述检测FAR1基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO：12所示，所述FAR1基因在GenBank上的登录号为NM_032228.6；
[0010]所述扩增GNPAT基因的上下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：5和SEQ ID NO：6所示，所述检测GNPAT基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO：13所示，所述GNPAT基因在
GenBank上的登录号为NM_001316350；
[0011]所述扩增Peds1基因的上下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：7和SEQ ID NO：8所示，所述检测Peds1基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO：14所示，所述Peds1基因在GenBank上的登录号为NM_001162505。
[0012]优选地，所述检测试剂包括：权利要求2中所述检测AGPS基因、FAR1基因、GNPAT基因和Peds1基因的上下游引物和探针的组合。
[0013]优选地，所述检测试剂还含有扩增GAPDH基因的引物组和探针，所述扩增GAPDH基因的引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO：9和SEQ ID NO：10所示，所述检测GAPDH基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO：15所示，所述GAPDH基因在GenBank上的登录号为NM_001256799.3。
[0014]优选地，所述探针分别标记有荧光基团。
[0015]更优选地，所述探针的5
’
端标记FAM、VIC或HEX荧光基团中的任何一种。
[0016]更优选地，所述AGPS基因、FAR1基因、GNPAT基因和/或Peds1基因的探针的5
’
端标记FAM荧光基团，所述GAPDH基因的探针的5
’
端标记VIC荧光基团。
[0017]优选地，探针分别标记有淬灭基团。
[0018]优选地，所述探针的3
’
端标记BHQ1、BHQ2或Tamara淬灭基团中的任何一种。
[0019]更优选地，所述探针的3
’
端标记BHQ1淬灭基团。
[0020]所述检测试剂在制备评估5
‑
氟尿嘧啶治疗胃癌敏感性的试剂盒中的应用。
[0021]一种评估5
‑
氟尿嘧啶治疗胃癌敏感性的试剂盒，所述试剂盒中含有所述的检测试剂。
[0022]优选地，所述试剂盒中还含有扩增内参基因的引物组和探针，所述内参基因为GAPDH基因，所述扩增GAPDH基因的引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO：9和SEQ ID NO：10所示，所述检测GAPDH基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO：15所示，所述GAPDH基因在GenBank上的登录号为NM_001256799.3。
[0023]更优选地，所述试剂盒通过综合评估值评估5
‑
氟尿嘧啶治疗胃癌敏感性，所述综合评估值计算公式为Logit(P)＝
‑
4.971
‑
2.878
×
ΔCt(Ct值AGPS
‑
Ct值内参)
‑
6.24
×
ΔCt(Ct值FAR1
‑
Ct值内参)
‑
0.73
×
ΔCt(Ct值GNPAT
‑
Ct值内参)
‑
9.024
×
ΔCt(Ct值Peds1
‑
Ct值内参)，
[0024]所述Ct值AGPS为AGPS基因的PCR荧光信号Ct值，所述Ct值FAR1为FAR1基因的PCR荧光信号Ct值，所述Ct值GNPAT为GNPAT基因的PCR荧光信号Ct值，所述Ct值Peds1为Peds1基因的PCR荧光信号Ct值，所述Ct值内参为GAPDH基因的PCR荧光信号Ct值，所述Logit(P)为综合评估值；
[0025]综合评估值小于0.5表示胃癌对5
‑
氟尿嘧啶治疗不敏感，综合评估值大于或等于0.5本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种评估5
‑
FU治疗胃癌癌敏感性的探针引物组，其特征在于，所述探针引物组包括：分别检测AGPS基因、FAR1基因、GNPAT基因或Peds1基因的中一个或几个的上下游引物和探针的组合；所述扩增AGPS基因的上下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2所示，所述检测AGPS基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO：11所示，所述AGPS基因在GenBank上的登录号为NM_003659.4；所述扩增FAR1基因的上下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：3和SEQ ID NO：4所示，所述检测FAR1基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO：12所示，所述FAR1基因在GenBank上的登录号为NM_032228.6；所述扩增GNPAT基因的上下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：5和SEQ ID NO：6所示，所述检测GNPAT基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO：13所示，所述GNPAT基因在GenBank上的登录号为NM_001316350；所述扩增Peds1基因的上下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：7和SEQ ID NO：8所示，所述检测Peds1基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO：14所示，所述Peds1基因在GenBank上的登录号为NM_001162505。2.根据权利要求1所述的探针引物组，其特征在于，所述探针引物组包括：权利要求1中所述检测AGPS基因、FAR1基因、GNPAT基因和Peds1基因的上下游引物和探针的组合。3.根据权利要求1所述的探针引物组，其特征在于，所述检测试剂还含有扩增GAPDH基因的引物组和探针，所述扩增GAPDH基因的引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO：9和SEQ ID NO：10所示，所述检测GAPDH基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO：15所示，所述GAPDH基因在GenBank上的登录号为NM_001256799.3。4.根据权利要求1到3任一所述的探针引物组，其特征在于，所述探针3
’
端标记有淬灭基团，所述探针5
’
端标记有荧光基团。5.权利要求1到4任一所述探针引物组在制备评估5
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FU治疗胃癌癌敏感性的试剂盒。6.检测AGPS基因、FAR1基因、GNPAT基因和/或Peds1基因的试剂在制备评估5
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氟尿嘧啶治疗胃癌敏感性的试剂盒中的应用，其特征在于，所述AGPS基因在GenBank上...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵丽瑛，马强，
申请(专利权)人：南方医科大学，
类型：发明
国别省市：