一种非诊断目的的HPV病毒的检测方法技术

本发明专利技术涉及病毒检测的技术领域，尤其是涉及一种非诊断目的的HPV病毒的检测方法，包括以下几个步骤：S1准备样品，将样品放入比色皿中；S2打开近红外光谱设备，调整设备参数，进行光谱采集；S3对异常样品进行剔除，截取正常样品合适的波长点；S4使用SIMCA方法建立定性模型。通过近红外设备对HPV病毒进行检测，5s完成检测，检测时间短，快速识别出HPV的阴性和阳性结果，可以快速初步识别HPV病毒，在医学的HPV的诊断上起到辅助作用。的诊断上起到辅助作用。的诊断上起到辅助作用。

【技术实现步骤摘要】
一种非诊断目的的HPV病毒的检测方法


[0001]本专利技术涉及病毒检测的
，尤其是涉及一种非诊断目的的HPV病毒的检测方法。

技术介绍

[0002]HPV是人乳头瘤病毒的名称缩写，是一种小的DNA病毒，人类是HPV唯一的宿主，能引起人类皮肤和黏膜的多种良性乳头状瘤或疣，HPV进入机体皮肤粘膜后，主要潜伏于表皮内基底细胞间，一旦时机成熟它就会致病，HPV病毒是引起宫颈癌的主要病因，宫颈癌属于妇科恶性肿瘤，其在女性群体中出现率比较高，原位癌高发年龄范围在30到35岁之间，浸润癌高发年龄范围为45岁到55岁，HPV检测是对付人乳头瘤病毒的一种手段。近年来该疾病已经出现了年轻化的变动趋势。通过早期治疗可降低其死亡率，因此预防宫颈癌显得非常必要。
[0003]现在的HPV宫颈癌筛查普及率不高,像农村、山区等地方因为交通等因素的原因，做不到大面积的普及。目前HPV的检查通过取组织和局部组织粘液、分泌物进行HPV
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DNA检测。PCR技术具有特异性强、灵敏度高、操作简便、省时，对待检原始材料质量要求低等特点。该项技术已在医学领域以及在皮肤病检查中广泛应用。目前PCR技术是检测HPV
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DNA及分型的最好方法，但是该方法检测时间长，短则3天，长则10天左右，对患者来说需要较长的等待时间，导致部分患者不能尽早的采取有效的治疗手段，造成治疗时间的贻误，因此我们亟需寻找一种可以在前期进行快速检测出HPV阳性阴性的非诊疗目的的检测方法。

技术实现思路

[0004]为了解决上述技术问题，本专利技术提供一种非诊疗目的的HPV病毒的检测方法。
[0005]本专利技术提供的一种非诊疗目的的HPV病毒的检测方法，采用如下技术方案：
[0006]一种非诊疗目的的HPV病毒的检测方法，包括以下几个步骤：
[0007]S1准备样品，将样品放入比色皿中；
[0008]S2打开近红外光谱设备，调整设备参数，进行光谱采集；
[0009]S3对异常样品进行剔除，截取正常样品合适的波长点；
[0010]S4使用SIMCA方法建立定性模型；
[0011]S5结果显示。
[0012]优选的，S1中的比色皿为5mm的比色皿。
[0013]优选的，S2中的近红外光谱设备为GSA近红外光谱分析仪,该设备不是成像设备。
[0014]优选的，在S3中根据全波长的波峰波谷截取有用的波长点。
[0015]综上所述，本专利技术具有如下的有益技术效果：
[0016]1.通过近红外设备对HPV病毒进行检测，5s完成检测，检测时间短，快速识别出HPV的阴性和阳性结果，可以快速初步识别HPV病毒，在医学的HPV的诊断上起到辅助作用。
[0017]2.此方法操作简单，自动识别，识别准确率较高。
附图说明
[0018]图1是实施例1原始样品数据光谱图；
[0019]图2是实施例1剔除异常样品后的光谱图；
[0020]图3是实施例1剔除异常样品截取的光谱图。
具体实施方式
[0021]实施例1
[0022]准备263个已知HPV阴性和阳性的样品，将样品分别放入5mm比色皿中，打开GSA近红外设备，调整设备参数，进行光谱采集，一个样品采集一张光谱，一共采集263张光谱，样品光谱图如图1，然后对异常样品进行剔除，截取正常样品合适的波长点，使用SIMCA方法建立定性建模，SIMCA方法有两个主要步骤，第一步是先建立每一类的主成分分析模型，第二步是将未知样本逐一去拟合各类的主成分模型，从而进行判别归类。每个类模型中的最佳主成分数可通过交互验证进行确定，每一个独立的模型可以选取不同的主成分数。
[0023]1.对样品进行光谱预处理MSC+SNV。
[0024]MSC多元散射校正，主要是消除颗粒分布不均匀及颗粒大小产生的散射影响，由于样品主要为浆状粘稠状样品，部分含有小颗粒状物质，采用M$C可以降低颗粒物对光谱造成的影响。
[0025]SNV标推正态变换，主要是消除固体颗粒大小、表面散射以及光程变化对近红外产生的影响，此次采样过程中使用了光纤探头及比色皿，SV可以降低重复装样时比色皿和光纤探头对光谱的影响，提高信噪比。
[0026]2.异常样本剔除
[0027]异常样本也称界外样本、奇异点或异常点等，会对近红外模型产生很大的影响，不仅会误导近红外光谱变量的选择，而且这些奇异点还会给模型的参数估计产生偏离影响，降低模型的预测准确性与稳健性。
[0028]异常样本的识别在近红外光谱分析中主要用于两个方面，一是模型建立过程中界外样本的识别，另一方面是预测分析时需要判断待测样本是否为模型的界外样本。通常通过光谱阵的主成分分析(PCA)得分或PLS交互验证过程的主因子得分，与马氏距离(MD)相结合(PCA
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MD或PLS
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MD)的方法来检测这类异常样本。
[0029]剔除异常样品后的光谱图如图2。
[0030]3.1.1模型内部验证
[0031]数据预处理方法：
[0032]1.MSC预处理(预处理第一步)；
[0033]2.SNV处理
[0034]3.放大倍数：1
[0035]4.异常样本处理：PCA
‑
MD
[0036]建模方法：ANN
[0037]BP网络结构：输入层：401，隐含层：10，输出层：2。
[0038]训练次数：1800
[0039]建模样品采集波长通道：401个
[0040]参与建模样品数：229个
[0041]误判个数：1
[0042]误判样品编号：223
[0043]分类正确率：99.56％
[0044]3.1.2模型外部验证
[0045]数据预处理方法：
[0046]1.MSC预处理(预处理第一步)；
[0047]2.SNV处理
[0048]3.放大倍数：1
[0049]建模方法：ANN
[0050]BP网络结构：输入层：401，隐含层：10，输出层：2。
[0051]训练次数：4700
[0052]建模样品采集波长通道：401个
[0053]参与建模样品数：196个
[0054]误判个数：1
[0055]误判样品编号：156
[0056]外部验证结果如下表1，其中实际类别和预测类别中的1代表阳性，2代表阴性。
[0057]表1
[0058][0059][0060]3.2截取1200nm
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1900nm之间的光谱进行建模
[0061]3.2.1截取内部验证结果
[0062]数据预处理方法：
[0063]1.MSC预处理(预处理第一步)；
[0064]2.SNV处理
[0065]3.放大倍数：1
[0066]4.异常本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种非诊疗目的的HPV病毒的检测方法，其特征在于：包括以下几个步骤：S1准备样品，将样品放入比色皿中；S2打开近红外设备，调整设备参数，进行光谱采集；S3对异常样品进行剔除，截取正常样品合适的波长点；S4使用SIMCA方法建立定性模型；S5结果显示。2.根据权利要求1所述的一种非诊疗目的的HPV病毒的...

【专利技术属性】
技术研发人员：邹振民，孙茂，朱传港，杨炳健，靳铸成，
申请(专利权)人：山东金璋隆祥智能科技有限责任公司，
类型：发明
国别省市：