一种PRLR基因的SNP突变位点及应用制造技术

本发明专利技术涉及基因工程技术领域，尤其涉及一种PRLR基因的SNP突变位点及应用。本发明专利技术提供了一种PRLR基因的SNP突变位点，所述突变位点包括：位点1～位点7。本发明专利技术以边鸡为研究对象，采用飞行时间质谱法检测PRLR基因在该品种中的遗传多样性分布，并与开产日龄、开产体重、开产蛋重和300日龄蛋数进行关联分析，筛选影响边鸡产蛋性状的关键位点，为开展标记辅助选择，提高边鸡产蛋性能、增加经济效益提供理论依据。依据。依据。

【技术实现步骤摘要】
一种PRLR基因的SNP突变位点及应用


[0001]本专利技术涉及基因工程
，尤其涉及一种PRLR基因的SNP突变位点及应用。

技术介绍

[0002]边鸡是山西省唯一的优良地方家禽品种，具有蛋大、蛋黄比率高的优势，然而地方品种普遍存在产蛋量低的问题，严重制约了边鸡的规模化生产。产蛋性状是家禽主要的经济性状之一，如何提高边鸡的产蛋性能是边鸡育种的一项重要工作。有研究表明，就巢性可能是地方家禽产蛋量低的重要因素之一。就巢性受下丘脑
‑
垂体
‑
卵巢轴内分泌系统调节，由多基因表达调控，PRLR基因与就巢性密切相关，在禽类生长、发育和繁殖等方面发挥重要作用。研究发现PRLR基因的多态性与鸡产蛋性状显著相关，关于PRLR基因多态性与边鸡产蛋性状的相关性未见报道。

技术实现思路

[0003]本专利技术的目的在于提供一种PRLR基因的SNP突变位点及应用，本专利技术筛选得到PRLR基因共7个多态位点。本研究以边鸡为研究对象，采用飞行时间质谱法检测PRLR基因在该品种中的遗传多样性分布，并与开产日龄、开产体重、开产蛋重和300日龄蛋数进行关联分析，筛选影响边鸡产蛋性状的关键位点，为开展标记辅助选择，提高边鸡产蛋性能、增加经济效益提供理论依据。
[0004]为了实现上述专利技术目的，本专利技术提供以下技术方案：
[0005]本专利技术提供了一种PRLR基因的SNP突变位点，其特征在于，所述突变位点包括：
[0006]位点1：位于10641897碱基处，类型为T/A颠换；如SEQNO：1所示；
[0007]位点2：位于10632956碱基处，类型为A/G转换；如SEQNO：2所示；
[0008]位点3：位于10618162碱基处，类型为A/G转换；如SEQNO：3所示；
[0009]位点4：位于10611270碱基处，类型为G/A转换；
[0010]位点5：位于10611168碱基处，类型为A/C颠换；
[0011]位点6：位于10611109碱基处，类型为C/T转换；
[0012]位点7：位于10610562碱基处，类型为G/A转换；位点4～位点7的核苷酸序列如SEQNO：4所示；
[0013]2、根据权利要求1所述的PRLR基因的SNP突变位点，其特征在于，所述位点1对应的基因型为TT或TA；位点2对应的基因型为GA或AA；位点3对应的基因型为AG或GG；位点4对应的基因型为GG；位点5对应的基因型为AA；位点6对应的基因型为CC；位点7对应的基因型为GG或AA。
[0014]优选的，检测所述SNP突变位点的引物如SEQNO：5～25所示。
[0015]本专利技术还提供了所述的PRLR基因的SNP突变位点在提高鸡产蛋性能中的应用。
[0016]优选的，所述鸡为边鸡。
[0017]优选的，所述产蛋性能为开产日龄、开产蛋重或产蛋量。
[0018]7、根据权利要求6所述的应用，其特征在于，所述位点4、位点5和位点6与开产日龄相关；位点7与开产蛋重和产蛋量相关。
[0019]本专利技术还进一步提供了所述的PRLR基因的SNP突变位点在制备试剂盒中的应用。
[0020]本专利技术还进一步提供了所述的PRLR基因的SNP突变位点在鸡选育中的应用。
[0021]本专利技术还进一步提供了所述的PRLR基因的SNP突变位点在边鸡产蛋量标记辅助选择的遗传标记中的应用。
[0022]与现有技术相比，本专利技术具有如下的有益效果：
[0023]本专利技术旨在探究边鸡催乳素受体(PRLR)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与产蛋性状的相关性，为边鸡的高产性状选育提供新的分子标记。本专利技术应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(MALDI
‑
TOF
‑
MS)对158只边鸡的7个SNPs进行基因分型，用Excel进行Hardy
‑
Weinberg群体遗传平衡检验，用SPSS26.0进行关联分析。结果显示，边鸡PRLR基因7个SNPs都处于中度多态(0.25＜PIC＜0.50)，其中S1、S2、S3处于Hardy
‑
Weinberg平衡状态(P＞0.05)。
[0024]相关性分析结果显示PRLR基因S4～S6位点杂合基因型个体的开产日龄显著或极显著高于纯合基因型个体；S7位点GA基因型个体的开产蛋重显著高于GG和AA基因型个体(P＜0.05)，GG和AA基因型个体的300日龄蛋数极显著高于GA基因型个体(P＜0.01)；由此可知，PRLR基因S4～S7位点可成为边鸡开产日龄和产蛋数标记辅助选择的遗传标记。
附图说明
[0025]为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本专利技术的实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据提供的附图获得其他的附图。
[0026]图1为A分别代表PRLR基因S1SNPs位点的分型检测结果；
[0027]图2为B分别代表PRLR基因S2SNPs位点的分型检测结果；
[0028]图3为C分别代表PRLR基因S3SNPs位点的分型检测结果；
[0029]图4为D分别代表PRLR基因S6SNPs位点的分型检测结果。
具体实施方式
[0030]本专利技术涉及的SNP位点序列如下：
[0031]PRLR(ensgalg00000003446):转录本id:ensgalt00000097029.1
[0032]染色体：z
[0033]测序转录本序列：
[0034]acctaatattctctgctaatccatgcttgtgaagccatgtgctcgcctttgctgcacaatgagcatctctgtctttgcaaaatggatttcttcaattccttccctgacacatttcgtttgcccctgagggatgcacgtattacctgttagaagtacattcatcagtaagtgacacgatactgtcctcgcagtctgtaaggagaacaagtgagttaatgaatgaatgggttaatgaatgaatacattaataaatgtacctttaacctctggagattacagtgtaagttttaattcagtaaacaagtgcataaaagcctcacagtctacaacctcagggtcacttccttatacttacaaaacaaaagaaaaatccaaaacacagttcaccatgactgagaatctgctaggagttac(t/a)gcctgggatgaagatagggggtagatcag
gtcagtgctatacttcgctcagtttatacattcattgcggagaaattagaa本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种PRLR基因的SNP突变位点，其特征在于，所述突变位点包括：位点1：位于10641897碱基处，类型为T/A颠换；如SEQ NO：1所示；位点2：位于10632956碱基处，类型为A/G转换；如SEQ NO：2所示；位点3：位于10618162碱基处，类型为A/G转换；如SEQ NO：3所示；位点4：位于10611270碱基处，类型为G/A转换；位点5：位于10611168碱基处，类型为A/C颠换；位点6：位于10611109碱基处，类型为C/T转换；位点7：位于10610562碱基处，类型为G/A转换；位点4～位点7的核苷酸序列如SEQ NO：4所示。2.根据权利要求1所述的PRLR基因的SNP突变位点，其特征在于，所述位点1对应的基因型为TT或TA；位点2对应的基因型为GA或AA；位点3对应的基因型为AG或GG；位点4对应的基因型为GG；位点5对应的基因型为AA；位点...

【专利技术属性】
技术研发人员：李培峰，张旗，崔少华，魏清宇，叶红心，李亚妮，张丽，张洁，
申请(专利权)人：山西农业大学，
类型：发明
国别省市：