一种PRLR基因的SNP突变位点及应用制造技术

技术编号:37392218 阅读:15 留言:0更新日期:2023-04-27 07:30
本发明专利技术涉及基因工程技术领域,尤其涉及一种PRLR基因的SNP突变位点及应用。本发明专利技术提供了一种PRLR基因的SNP突变位点,所述突变位点包括:位点1~位点7。本发明专利技术以边鸡为研究对象,采用飞行时间质谱法检测PRLR基因在该品种中的遗传多样性分布,并与开产日龄、开产体重、开产蛋重和300日龄蛋数进行关联分析,筛选影响边鸡产蛋性状的关键位点,为开展标记辅助选择,提高边鸡产蛋性能、增加经济效益提供理论依据。依据。依据。

【技术实现步骤摘要】
一种PRLR基因的SNP突变位点及应用


[0001]本专利技术涉及基因工程
,尤其涉及一种PRLR基因的SNP突变位点及应用。

技术介绍

[0002]边鸡是山西省唯一的优良地方家禽品种,具有蛋大、蛋黄比率高的优势,然而地方品种普遍存在产蛋量低的问题,严重制约了边鸡的规模化生产。产蛋性状是家禽主要的经济性状之一,如何提高边鸡的产蛋性能是边鸡育种的一项重要工作。有研究表明,就巢性可能是地方家禽产蛋量低的重要因素之一。就巢性受下丘脑

垂体

卵巢轴内分泌系统调节,由多基因表达调控,PRLR基因与就巢性密切相关,在禽类生长、发育和繁殖等方面发挥重要作用。研究发现PRLR基因的多态性与鸡产蛋性状显著相关,关于PRLR基因多态性与边鸡产蛋性状的相关性未见报道。

技术实现思路

[0003]本专利技术的目的在于提供一种PRLR基因的SNP突变位点及应用,本专利技术筛选得到PRLR基因共7个多态位点。本研究以边鸡为研究对象,采用飞行时间质谱法检测PRLR基因在该品种中的遗传多样性分布,并与开产日龄、开产体重、开产蛋重和300日龄蛋数进行关联分析,筛选影响边鸡产蛋性状的关键位点,为开展标记辅助选择,提高边鸡产蛋性能、增加经济效益提供理论依据。
[0004]为了实现上述专利技术目的,本专利技术提供以下技术方案:
[0005]本专利技术提供了一种PRLR基因的SNP突变位点,其特征在于,所述突变位点包括:
[0006]位点1:位于10641897碱基处,类型为T/A颠换;如SEQNO:1所示;
[0007]位点2:位于10632956碱基处,类型为A/G转换;如SEQNO:2所示;
[0008]位点3:位于10618162碱基处,类型为A/G转换;如SEQNO:3所示;
[0009]位点4:位于10611270碱基处,类型为G/A转换;
[0010]位点5:位于10611168碱基处,类型为A/C颠换;
[0011]位点6:位于10611109碱基处,类型为C/T转换;
[0012]位点7:位于10610562碱基处,类型为G/A转换;位点4~位点7的核苷酸序列如SEQNO:4所示;
[0013]2、根据权利要求1所述的PRLR基因的SNP突变位点,其特征在于,所述位点1对应的基因型为TT或TA;位点2对应的基因型为GA或AA;位点3对应的基因型为AG或GG;位点4对应的基因型为GG;位点5对应的基因型为AA;位点6对应的基因型为CC;位点7对应的基因型为GG或AA。
[0014]优选的,检测所述SNP突变位点的引物如SEQNO:5~25所示。
[0015]本专利技术还提供了所述的PRLR基因的SNP突变位点在提高鸡产蛋性能中的应用。
[0016]优选的,所述鸡为边鸡。
[0017]优选的,所述产蛋性能为开产日龄、开产蛋重或产蛋量。
[0018]7、根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述位点4、位点5和位点6与开产日龄相关;位点7与开产蛋重和产蛋量相关。
[0019]本专利技术还进一步提供了所述的PRLR基因的SNP突变位点在制备试剂盒中的应用。
[0020]本专利技术还进一步提供了所述的PRLR基因的SNP突变位点在鸡选育中的应用。
[0021]本专利技术还进一步提供了所述的PRLR基因的SNP突变位点在边鸡产蛋量标记辅助选择的遗传标记中的应用。
[0022]与现有技术相比,本专利技术具有如下的有益效果:
[0023]本专利技术旨在探究边鸡催乳素受体(PRLR)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与产蛋性状的相关性,为边鸡的高产性状选育提供新的分子标记。本专利技术应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(MALDI

TOF

MS)对158只边鸡的7个SNPs进行基因分型,用Excel进行Hardy

Weinberg群体遗传平衡检验,用SPSS26.0进行关联分析。结果显示,边鸡PRLR基因7个SNPs都处于中度多态(0.25<PIC<0.50),其中S1、S2、S3处于Hardy

Weinberg平衡状态(P>0.05)。
[0024]相关性分析结果显示PRLR基因S4~S6位点杂合基因型个体的开产日龄显著或极显著高于纯合基因型个体;S7位点GA基因型个体的开产蛋重显著高于GG和AA基因型个体(P<0.05),GG和AA基因型个体的300日龄蛋数极显著高于GA基因型个体(P<0.01);由此可知,PRLR基因S4~S7位点可成为边鸡开产日龄和产蛋数标记辅助选择的遗传标记。
附图说明
[0025]为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案,下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图仅仅是本专利技术的实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据提供的附图获得其他的附图。
[0026]图1为A分别代表PRLR基因S1SNPs位点的分型检测结果;
[0027]图2为B分别代表PRLR基因S2SNPs位点的分型检测结果;
[0028]图3为C分别代表PRLR基因S3SNPs位点的分型检测结果;
[0029]图4为D分别代表PRLR基因S6SNPs位点的分型检测结果。
具体实施方式
[0030]本专利技术涉及的SNP位点序列如下:
[0031]PRLR(ensgalg00000003446):转录本id:ensgalt00000097029.1
[0032]染色体:z
[0033]测序转录本序列:
[0034]acctaatattctctgctaatccatgcttgtgaagccatgtgctcgcctttgctgcacaatgagcatctctgtctttgcaaaatggatttcttcaattccttccctgacacatttcgtttgcccctgagggatgcacgtattacctgttagaagtacattcatcagtaagtgacacgatactgtcctcgcagtctgtaaggagaacaagtgagttaatgaatgaatgggttaatgaatgaatacattaataaatgtacctttaacctctggagattacagtgtaagttttaattcagtaaacaagtgcataaaagcctcacagtctacaacctcagggtcacttccttatacttacaaaacaaaagaaaaatccaaaacacagttcaccatgactgagaatctgctaggagttac(t/a)gcctgggatgaagatagggggtagatcag
gtcagtgctatacttcgctcagtttatacattcattgcggagaaattagaa本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种PRLR基因的SNP突变位点,其特征在于,所述突变位点包括:位点1:位于10641897碱基处,类型为T/A颠换;如SEQ NO:1所示;位点2:位于10632956碱基处,类型为A/G转换;如SEQ NO:2所示;位点3:位于10618162碱基处,类型为A/G转换;如SEQ NO:3所示;位点4:位于10611270碱基处,类型为G/A转换;位点5:位于10611168碱基处,类型为A/C颠换;位点6:位于10611109碱基处,类型为C/T转换;位点7:位于10610562碱基处,类型为G/A转换;位点4~位点7的核苷酸序列如SEQ NO:4所示。2.根据权利要求1所述的PRLR基因的SNP突变位点,其特征在于,所述位点1对应的基因型为TT或TA;位点2对应的基因型为GA或AA;位点3对应的基因型为AG或GG;位点4对应的基因型为GG;位点5对应的基因型为AA;位点...

【专利技术属性】
技术研发人员:李培峰张旗崔少华魏清宇叶红心李亚妮张丽张洁
申请(专利权)人:山西农业大学
类型:发明
国别省市:

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