小麦株高相关SNP位点及其在辅助筛选不同株高小麦中的应用制造技术

本发明专利技术公开了小麦株高相关SNP位点及其在辅助筛选不同株高小麦中的应用，所述SNP位点位于SEQ ID NO.1所示序列自5

【技术实现步骤摘要】
小麦株高相关SNP位点及其在辅助筛选不同株高小麦中的应用


[0001]本专利技术属于分子生物学
，涉及TaNUP85
‑
3B基因中的C7186T SNP位点在辅助筛选不同株高小麦中的应用。

技术介绍

[0002]小麦(Triticum aestivum L.)是我国最主要的粮食作物之一。提升小麦单产是满足粮食需求不断提高的重要方式，同时也是保证粮食安全的战略目标。降低小麦株高可以增加抗倒伏能力，进而小麦产量增加。因此株高性状对于实现小麦的高产、稳产极其重要。
[0003]目前，研究者已经定位了大量调控株高的QTL：Gao等利用周842B
×
中国春的重组自交系群体鉴定到位于染色体2A、4A、4B、4D和5A的5个株高QTL；Zhang等在染色体1D、2B、3A、3D、4A、4B、5A和6B鉴定到8个与株高相关QTL；Guo等基于芯片标记技术对215个小麦品种进行关联分析，关联到11个与株高相关的QTL位点，分别被定位3A、3B、5B、6A、6B和7B染色体上；Yu等利用包含有110株系ITMI的RIL群体为材料，对小麦株高进行定位，共检测到10个控制株高的QTL位点，分别被定位3B、5A、5B、6A和7D染色体上；Bai等利用双单倍体材料(Avalon x Cadenza)，对小麦株高性状进行定位，共5个QTLs被检测到，分别被定位在2D、4D、3A、3B和6A。尽管已经定位了大量的与小麦株高相关的QTL，但由于绝大多数QTL的表型贡献率较小，且在不同年际及环境间重复性差，所以这些QTL难以应用于小麦株高的遗传改良。
[0004]CAPS标记又称为PCR
‑
RFLP(限制性片段长度多态性聚合酶链反应)，是一类以PCR为基础的共显性分子标记，揭示的是特异PCR片段的限制性长度变异信息，其基本原理是用PCR扩增目的DNA，扩增产物再用特异性内切酶消化切割成不同大小片段，直接在凝胶电泳上分辨。不同等位基因的限制性酶切位点分布不同，产生不同长度的DNA片段条带。优点是避免了RFLP分析中繁琐的转移、杂交步骤，又能保持RFLP分析的精确度。然而，SNP恰好位于限制性酶切位点的情况比较少，因此，提出了dCAPS标记，即在CAPS标记的基础上通过在扩增引物中引入错配碱基，结合SNP位点引入新的限制性内切酶作用位点，产生和CAPS标记类似的多态性。
[0005]可见，对于小麦株高相关SNP位点的开发和应用具有重要的科研和实用价值。

技术实现思路

[0006]本专利技术要解决的技术问题是提供一种与小麦株高性状相关的SNP位点及其应用。
[0007]为解决上述技术问题，本专利技术所采取的技术方案如下。
[0008]用于检测与小麦株高相关的SNP位点的试剂盒，所述SNP位点位于SEQ ID NO.1所示序列自5
’
末端第7186位碱基；所述SNP位点的碱基为C或T，基因型CC相对于基因型TT具有或潜在具有更高的株高。
[0009]作为本专利技术的一种优选技术方案，所述试剂盒包含由SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3
组成的引物对F1、R1，以及由SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5组成的引物对F2、R2。
[0010]作为本专利技术的一种优选技术方案，所述试剂盒中还包含至少一种限制性内切酶；所述限制性内切酶为PvuII。
[0011]上述试剂盒的用途，在小麦分子标记辅助育种中用于在分子育种早期区分和/或筛选待测小麦的株高表型。
[0012]鉴定或辅助鉴定小麦株高的方法，包括如下步骤：
[0013]A、以待测小麦的基因组DNA为模板，采用由SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3组成的引物对F1、R1进行PCR扩增，得到PCR扩增产物P1；然后以所得PCR扩增产物P1为模板，采用由SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5组成的引物对F2、R2再次进行PCR扩增，得到PCR扩增产物P2；
[0014]B、将上步所得PCR扩增产物P2用限制性内切酶PvuII进行酶切得到酶切产物；
[0015]C、基于所得酶切产物鉴定或辅助鉴定小麦的株高：如果所得酶切产物为一条DNA片段，则待测小麦为基因型II；如果所得酶切产物为两条DNA片段，则待测小麦为基因型I；基因型I的小麦的株高＞基因型II的小麦的株高。
[0016]作为本专利技术的一种优选技术方案，步骤C中，按照如下标准基于所得酶切产物鉴定或辅助鉴定小麦的株高：如果所得酶切产物中只具有128bp的DNA片段，则待测小麦为基因型II；如果所得酶切产物中具有105bp的DNA片段和23bp的DNA片段，则待测小麦为基因型I；基因型I的小麦的株高＞基因型II的小麦的株高。
[0017]一种用于检测小麦株高的引物组合，包括由SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3组成的引物对F1、R1，以及由SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5组成的引物对F2、R2。
[0018]上述引物组合的用途，用于鉴定或辅助鉴定小麦的株高，以及在分子育种早期区分和/或筛选待测小麦的株高表型。
[0019]采用上述技术方案所产生的有益效果在于：
[0020]本专利技术公开了一种与小麦株高相关的SNP位点及其应用；降低小麦株高可以增加其抗倒伏能力，进而有效增加小麦的产量，因此株高性状对于实现小麦的高产、稳产十分重要。
[0021]经过试验验证，采用本专利技术所提供的方法检测待测小麦基于TaNUP85
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3B基因的基因型，可以筛选或辅助筛选小麦株高性状。当分子标记中的C7186T SNP位点的基因型为CC纯合型，则判定为基因型I的小麦；当分子标记中的C7186T SNP位点的基因型为TT纯合型，则判定为基因型II的小麦；所述C7186T SNP位点为小麦基因组中SEQ ID NO:1自5
’
末端起的第7186位核苷酸；基因型I的小麦的株高＞基因型II的小麦的株高。
[0022]综上所述，本专利技术开发的小麦株高相关SNP位点在小麦分子标记辅助育种等诸多领域均具有重要的科研和实用价值。
附图说明
[0023]图1为利用F1、R1对自然群体中16个品种小麦TaNUP85
‑
3B基因进行扩增得到的电泳图；图中展示的是对照和16个品种小麦的检测结果，1
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16的品种依次为rysdale、冀麦30、冀麦32、冀麦38、冀麦41、冀麦6号、冀麦9号、冀麦一号、冀审5099、鉴26、金光、晋2148
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7、晋麦13、晋麦17、晋麦33、晋麦39。
[0024]图2为自然群体中部分小麦TaNUP85
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3B基因的基因型检测电泳图；图中展示的是
对照和16个品种小麦的检测结果，1
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16的品种依次为Drysdale、冀麦30、冀麦32、冀麦38、冀麦41、冀麦6号、冀麦9号、本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.用于检测与小麦株高相关的SNP位点的试剂盒，所述SNP位点位于SEQ ID NO.1所示序列自5
’
末端第7186位碱基；所述SNP位点的碱基为C或T，基因型CC相对于基因型TT具有或潜在具有更高的株高。2.根据权利要求1所述的用于检测与小麦株高相关的SNP位点的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒包含由SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3组成的引物对F1、R1，以及由SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5组成的引物对F2、R2。3.根据权利要求1所述的用于检测与小麦株高相关的SNP位点的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒中还包含至少一种限制性内切酶；所述限制性内切酶为PvuII。4.权利要求1或2或3所述的试剂盒的用途，在小麦分子标记辅助育种中用于在分子育种早期区分和/或筛选待测小麦的株高表型。5.鉴定或辅助鉴定小麦株高的方法，其特征在于：该方法包括如下步骤：A、以待测小麦的基因组DNA为模板，采用由SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3组成的引物对F1、R1进行PCR扩增，得到PCR扩增产物P1；然后以所得PCR扩增产物P1为模板，采用由SEQ ID NO.4、S...

【专利技术属性】
技术研发人员：郑术芝，鲍菁培，赵伟双，白蛟腾，刘昕烨，
申请(专利权)人：河北师范大学，
类型：发明
国别省市：