一种胰腺癌预后风险评估的lncRNA标记物、模型及其应用制造技术

本发明专利技术提供了一种胰腺癌预后风险评估的lncRNA标记物、模型及其应用，属于生物医学技术领域。本发明专利技术提供的胰腺癌预后风险评估的lncRNA标记物，包括CASC19、UCA1、AC079313.1和AC245041.2。本发明专利技术首次结合TCGA肿瘤样本和GTEx正常人样本，充分均衡了患者和健康人群的数量，减少纳入数据的偏移，使最终获得的lncRNA标记物能够更加准确的对胰腺癌预后的风险进行评估。本发明专利技术构建的胰腺癌预后风险评估模型仅包含4条lncRNA，检测工作量较小，给后续的临床转化提供便利，而且本发明专利技术所选择的lncRNA具有普适性。lncRNA具有普适性。lncRNA具有普适性。

【技术实现步骤摘要】
一种胰腺癌预后风险评估的lncRNA标记物、模型及其应用


[0001]本专利技术属于生物医学
，尤其涉及一种胰腺癌预后风险评估的lncRNA标记物、模型及其应用。

技术介绍

[0002]胰腺癌是一种高度致死性的恶性肿瘤，是预后最差的恶性肿瘤之一，手术切除是胰腺癌的唯一治疗选择。然而，超过80％的患者被诊断为晚期和无法手术。尽管目前在基因、蛋白、细胞等多层次领域取得的研究进展，在诊断和提示胰腺癌方面有一定的价值，但是在胰腺癌预后评估方面并不出色，对于胰腺癌预后的评估一直缺乏有效的指标。目前CA19
‑
9已被用于预测个别胰腺癌患者的预后。但是CA19
‑
9在Lewis阴性基因型患者中没有表达，只有65％的可切除胰腺导管癌患者血清水平升高，同时在其他良性和恶疾病中CA19
‑
9的表达量也会有所增加，所以采用CA19
‑
9作为胰腺癌预后的评价指标其敏感性和特异有限。因此，本领域目前迫切需要开发新的生物标志物或模型来对胰腺癌患者的预后进行判断。长链非编码RNA(Long non
‑
coding RNA，lncRNA)是长度大于200个核苷酸的非编码RNA。目前本领域关于铁死亡相关的lncRNA与胰腺癌预后的关系，鲜有报道。

技术实现思路

[0003]有鉴于此，本专利技术的目的在于提供一种胰腺癌预后风险评估的lncRNA标记物和模型，提高胰腺癌预后风险评估的准确性和普适性。
[0004]为了实现上述专利技术目的，本专利技术提供了以下技术方案：
[0005]本专利技术提供了一种胰腺癌预后风险评估的lncRNA标记物，所述标记物包括CASC19、UCA1、AC079313.1和AC245041.2。
[0006]本专利技术还提供了一种上述lncRNA标记物在制备胰腺癌预后风险评估产品中的应用。
[0007]优选的，所述产品的种类包括胰腺癌预后风险评估模型或试剂盒。
[0008]本专利技术还提供了一种胰腺癌预后风险评估的模型，所述模型包括输入模块、计算模块和结果输出模块，所述计算模块为Risk Score＝0.279
×
CASC19的表达量+0.205
×
UCA1的表达量+0.941
×
AC079313.1的表达量+0.458
×
AC245041.2的表达量。
[0009]优选的，所述输入模块为输入上述CASC19、UCA1、AC079313.1和AC245041.2共4个胰腺癌预后相关lncRNA标记物的表达量。
[0010]优选的，所述结果输出模块为根据Risk Score的值进行预后风险高低评估，若Risk Score值在0.928以上，则输出预后情况不好，若Risk Score值小于0.928，则输出预后情况良好。
[0011]本专利技术还提供了一种胰腺癌预后风险评估的试剂盒，所述试剂盒包括用于检测上述lncRNA标记物的基因或蛋白表达水平的试剂。
[0012]优选的，所述用于检测lncRNA标记物的基因表达水平的试剂是与所述基因特异性
结合的引物和/或探针。
[0013]优选的，所述用于检测lncRNA标记物的蛋白表达水平的试剂是与所述lncRNA标记物基因编码的蛋白特异结合的抗体。
[0014]本专利技术的有益效果：
[0015]本专利技术首次结合了TCGA肿瘤样本和GTEx正常人样本，充分均衡了患者和健康人群的数量，减少纳入数据的偏移，使最终获得的lncRNA标记物能够更加准确的对胰腺癌预后的风险进行评估。
[0016]本专利技术构建的胰腺癌预后风险评估模型仅包含4条lncRNA，检测工作量较小，给后续的临床转化提供便利，而且本专利技术所选择的lncRNA具有普适性。
附图说明
[0017]图1为单因素COX回归森林图；
[0018]图2为K
‑
M生存分析；
[0019]图3为TCGA训练集ROC曲线；
[0020]图4为ICGC验证集ROC曲线。
具体实施方式
[0021]本专利技术提供了一种胰腺癌预后风险评估的lncRNA标记物，所述标记物包括CASC19、UCA1、AC079313.1和AC245041.2。
[0022]本专利技术对于lncRNA标记物CASC19、UCA1、AC079313.1和AC245041.2的具体来源没有特殊限定。
[0023]本专利技术还提供了一种上述lncRNA标记物在制备胰腺癌预后风险评估产品中的应用。在本专利技术中，所述产品的种类优选的包括胰腺癌预后风险评估模型或试剂盒。
[0024]本专利技术还提供了一种胰腺癌预后风险评估的模型，所述模型包括输入模块、计算模块和结果输出模块，所述计算模块为Risk Score＝0.279
×
CASC19的表达量+0.205
×
UCA1的表达量+0.941
×
AC079313.1的表达量+0.458
×
AC245041.2的表达量。
[0025]在本专利技术中，所述输入模块优选的为输入上述CASC19、UCA1、AC079313.1和AC245041.2共4个胰腺癌预后相关lncRNA标记物的表达量。本专利技术对于所述lncRNA标记物表达量的具体检测方法没有特殊限定，采用本领域常规基因表达量检测的方法均可。本专利技术所述结果输出模块优选的为根据Risk Score的值进行预后风险高低评估，若Risk Score值在0.928以上，则输出预后情况不好，表示为高风险，若Risk Score值小于0.928，则输出预后情况良好，表示为低风险。
[0026]本专利技术还提供了一种胰腺癌预后风险评估的试剂盒，所述试剂盒包括用于检测上述lncRNA标记物的基因或蛋白表达水平的试剂。
[0027]在本专利技术中，所述用于检测lncRNA标记物的基因表达水平的试剂优选的是与所述基因特异性结合的引物和/或探针，所述与标记物基因的核酸序列杂交的探针可以是DNA、RNA、DNA
‑
RNA嵌合体、PNA或其它衍生物。本专利技术所述用于检测lncRNA标记物的蛋白表达水平的试剂优选的是与所述lncRNA标记物基因编码的蛋白特异结合的抗体。
[0028]下面结合实施例对本专利技术提供的技术方案进行详细的说明，但是不能把它们理解
为对本专利技术保护范围的限定。
[0029]下述实施例中，如无特殊说明，均为常规方法。
[0030]下述实施例中所用的材料、试剂等，如无特殊说明，均可从商业途径得到。
[0031]实施例1
[0032]从TCGA(The cancer genome atlas，癌症基因组图谱)数据库获得178例胰腺癌样本信息和4例正常样本信息，从GTEx(Genotype
‑
Tissue Expression)数据库获得168例正本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种胰腺癌预后风险评估的lncRNA标记物，其特征在于，所述标记物包括CASC19、UCA1、AC079313.1和AC245041.2。2.权利要求1所述lncRNA标记物在制备胰腺癌预后风险评估产品中的应用。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述产品的种类包括胰腺癌预后风险评估模型或试剂盒。4.一种胰腺癌预后风险评估的模型，其特征在于，所述模型包括输入模块、计算模块和结果输出模块，所述计算模块为Risk Score＝0.279
×
CASC19的表达量+0.205
×
UCA1的表达量+0.941
×
AC079313.1的表达量+0.458
×
AC245041.2的表达量。5.根据权利要求4所述的模型，其特征在于，所述输入模块为输入权利要求1所述C...

【专利技术属性】
技术研发人员：吴兴，陈琼，
申请(专利权)人：中南大学湘雅三医院，
类型：发明
国别省市：