信息处理程序、信息处理方法以及信息处理装置制造方法及图纸

技术编号:37296871 阅读:21 留言:0更新日期:2023-04-21 22:43
信息处理装置获取作为特定的个人的基因组信息的被断开为多个的断开基因组数据。信息处理装置基于将密码子和代码建立对应的密码子变换表,生成将多个断开基因组数据分别以密码子为单位进行编码的多个断开密码子数据。信息处理装置基于将成为基准的基准基因组数据以密码子为单位进行编码的基准密码子数据、和多个断开密码子数据的每一个断开密码子数据,确定出现在多个断开密码子数据中的代码中的与出现在基准密码子数据中的代码不同的基因变异出现的位置和种类。信息处理装置生成将基因变异和基因变异出现的位置及种类建立对应的基因变异转置索引。的基因变异转置索引。的基因变异转置索引。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】信息处理程序、信息处理方法以及信息处理装置


[0001]本专利技术涉及信息处理程序、信息处理方法以及信息处理装置。

技术介绍

[0002]近年来,通过分析构成人类、生物的DNA(Deoxyribonucleic Acid:脱氧核糖核酸)以及RNA(Ribonucleic Acid:核糖核酸)的基因组,预测新型病毒的影响力,开发了疫苗等。另外,根据基因组,进行检测癌等的突变(点突变)、基因变异的基因的异常,或预防诊断疾病的研究。
[0003]具体而言,已知有将人类基因组的碱基序列与位置建立对应地存储,将个体间的差异作为有益的意义信息提供的技术。例如,获取与基因组的分析服务等的请求信息相应的碱基序列的位置信息,响应与获取到的位置信息相对应的碱基序列信息。
[0004]专利文献1:日本特开2012

234558号公报;
[0005]专利文献2:日本特开2012

157283号公报。
[0006]另外,从定序器输出的碱基序列每隔数百B(Byte)被断开。并且,人类基因组的碱基序列的本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种信息处理程序,其特征在于,使计算机执行如下处理:获取作为特定的个人的基因组信息的被断开为多个的断开基因组数据;基于将密码子和代码建立对应的密码子变换表,生成将多个断开基因组数据分别以密码子为单位进行编码后的多个断开密码子数据;基于将成为基准的基准基因组数据以密码子为单位进行编码后的基准密码子数据、和所述多个断开密码子数据的每一个断开密码子数据,确定出现在所述多个断开密码子数据中的所述代码中的与出现在所述基准密码子数据中的所述代码不同的基因变异出现的位置和种类;生成将所述基因变异和所述基因变异出现的位置及种类建立对应的基因变异转置索引。2.根据权利要求1所述的信息处理程序,其特征在于,在所述确定的处理中,从将所述基准密码子数据中的所述密码子的代码和所述密码子的代码的出现位置建立对应的基准转置索引,确定作为搜索对象的基准密码子序列的位置,将与确定的所述位置对应的所述基准密码子数据内的代码和与所述位置对应的所述多个断开密码子数据内的代码进行比较,确定所述基因变异出现的位置和种类。3.根据权利要求1所述的信息处理程序,其特征在于,使所述计算机执行如下处理:生成与患者的所述断开基因组数据对应的所述基因变异转置索引;生成通过不同的加密方法对识别所述患者的标识、所述基因变异转置索引、所述密码子变换表分别进行加密而结合的数据;输出所述数据。4.根据权利要求1所述的信息处理程序,其特征在于,使所述计算机执行如下处理:在所述获取的处理中,获取作为癌患者的基因组信息的被断开为多个的所述断开基因组数据,在所述生成的处理中,生成与所述癌患者对应的所述多个断开密码子数据,在所述确定的处理中,基于健康的人的所述基准密码子数据、和与所述癌患者对应的所述多个断开密码子数据,确定所述基因变异出现的位置和种类,在所述生成的处理中,使用所确定的所述基因变异的位置和种类,生成与所述癌患者对应的所述基因变异转置索引。5.根据权利要求4所述的信息处理程序,其特征在于,使所述计...

【专利技术属性】
技术研发人员:片冈正弘松村量茂栉薰
申请(专利权)人:富士通株式会社
类型:发明
国别省市:

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