一种大豆皂苷相关的KASP标记及其应用制造技术

本发明专利技术提供了一种大豆皂苷相关的KASP标记及其应用，属于分子育种技术领域，所述KASP标记包括S07_43139773G/T和S07_43139033A/G中的一种或两种，所述S07_43139773G/T为大豆基因组第7号染色体43139773bp位置上的碱基为G/T，所述S07_43139033A/G为大豆基因组第7号染色体43139033bp位置上的碱基为A/G。本发明专利技术的KASP标记能够用于大豆高大豆皂苷含量种质的选育，且本发明专利技术的KASP标记不仅准确度高、成本较低，而且操作简单、快捷，只需要提取植物叶片基因组DNA，就可以进行PCR扩增。本发明专利技术为今后对于大豆皂苷有关基因的深入研究和大豆高皂苷含量的筛选以及大豆分子标记辅助育种奠定基础。定基础。定基础。

【技术实现步骤摘要】
一种大豆皂苷相关的KASP标记及其应用


[0001]本专利技术属于分子育种
，尤其涉及一种大豆皂苷相关的KASP标记及其应用。

技术介绍

[0002]大豆皂苷，又称大豆皂甙，是由大豆及其它豆类植物种子中提取出来的，其分子是由低聚糖及齐墩果烯三萜缩合形成的一类化合物。目前使用化学法研究大豆皂苷，确认大豆皂苷元有5个种类，即大豆皂苷元A、大豆皂苷元B、大豆皂苷元C、大豆皂苷元D、大豆皂苷元E，天然存在的大豆皂苷有3种，即大豆皂苷元A、大豆皂苷元B、大豆皂苷元E。研究表明，大豆皂苷具有抗脂质氧化、抗自由基、增强免疫调节、抗肿瘤、抗病毒等多种生理功能，以应用于食品、药品、化妆品等领域，具有广阔的市场前景。
[0003]虽然大豆皂苷对人类健康发挥着重要作用，但目前对大豆资源的利用程度较低，专用型大豆品种少，培育专用型大豆具有很好的发展前景。大豆皂苷受多基因控制，容易受到土壤环境，气候变化等外界环境因素的影响。在常规的筛选中，每个大豆种质的皂苷都进行测定，存在鉴定周期长、成本高、费时费力的问题，不能满足稳定高效的筛选需求。

技术实现思路

[0004]有鉴于此，本专利技术的目的在于提供一种大豆皂苷相关的KASP标记及其应用。
[0005]为了实现上述专利技术目的，本专利技术提供了以下技术方案：
[0006]本专利技术提供了一种大豆皂苷相关的KASP标记，所述KASP标记包括S07_43139773G/T和S07_43139033A/G中的一种或两种，所述S07_43139773G/T为大豆基因组第7号染色体43139773bp位置上的碱基为G/T，所述S07_43139033A/G为大豆基因组第7号染色体43139033bp位置上的碱基为A/G。
[0007]优选的，所述S07_43139773G/T处碱基是G的大豆为皂苷Aa含量低的大豆，碱基是T的大豆为皂苷Aa含量高的大豆。
[0008]优选的，所述S07_43139033A/G碱基是A的大豆皂苷Ab含量高的大豆，碱基是G的大豆皂苷Ab含量低的大豆。
[0009]本专利技术还提供了一种用于检测上述KASP标记的引物对，所述KASP标记的引物对包括S07_43139773G/T引物对和S07_43139033A/G引物对中的一种或两种；
[0010]所述S07_43139773G/T的上游引物F1的序列如SEQ ID No.1所示，上游引物F2的序列如SEQ ID No.2所示，下游引物R的序列如SEQ ID No.3所示；
[0011]所述S07_43139033A/G的上游引物F1的序列如SEQ ID No.4所示，上游引物F2的序列如SEQ ID No.5所示，下游引物R的序列如SEQ ID No.6所示。
[0012]本专利技术还提供了一种用于检测上述KASP标记的试剂盒，所述试剂盒包含上述的引物对。
[0013]本专利技术还提供了一种上述KASP标记、引物对或试剂盒在提高大豆皂苷种质育种中
的应用。
[0014]本专利技术还提供了一种筛选高皂苷含量大豆的方法，包括如下步骤：
[0015]以待测大豆基因组DNA为模板，利用上述的引物对分别进行PCR扩增反应，通过PCR扩增产物的荧光信号，进行基因分型。
[0016]优选的，选择大豆基因组中第7号染色体43139773bp位置上的基因型为TT和大豆基因组中第7号染色体43139033位置上的基因型为AA中的一种或两种，则待测大豆为高皂苷含量大豆。
[0017]相对于现有技术，本专利技术具有如下有益效果：
[0018]本专利技术提供了一种大豆皂苷相关的KASP标记及其应用，本专利技术对264份大豆种质自然群体大豆皂苷Aa、Ab、Bb含量进行了全基因组关联分析，并利用与两种皂苷组分显著相关的SNP位点进行KASP标记的开发，设计得到2个KASP标记，本专利技术的S07_43139773G/T检测大豆皂苷含量的准确率为93.2％，S07_43139033A/G检测大豆皂苷含量的准确率为93.2％，故本专利技术的KASP标记可准确对大豆皂苷含量性状进行基因分型，通过基因分型发现S07_43139773G/T基因型为TT大豆的大豆皂苷Aa含量高于GG的大豆皂苷Aa含量，S07_43139033A/G基因型为AA大豆的大豆皂苷Ab含量高于GG的大豆皂苷Ab含量。因此，本专利技术的KASP标记能够用于大豆高大豆皂苷含量种质的选育，且本专利技术的KASP标记不仅准确度高、成本较低，而且操作简单、快捷，只需要提取植物叶片基因组DNA，就可以进行PCR扩增。
附图说明
[0019]图1为自然群体重测序结果，其中A为进化树，B为主成分分析，C为连锁不平衡分析；
[0020]图2为3种大豆皂苷全基因组关联分析结果的曼哈顿图和QQ图，A、B分别是2020年海南大豆皂苷Aa、Ab；C、D分别是2021年南京大豆皂苷Aa、Ab；
[0021]图3为KASP标记对不同大豆种质基因分型，其中A、B分别是对S07_43139773、S07_43139033进行基因分型。
具体实施方式
[0022]本专利技术提供了一种大豆皂苷相关的KASP标记，所述KASP标记包括S07_43139773G/T和S07_43139033A/G中的一种或两种，所述S07_43139773G/T为大豆基因组第7号染色体43139773bp位置上的碱基为G/T，所述S07_43139033A/G为大豆基因组第7号染色体43139033bp位置上的碱基为A/G。
[0023]在本专利技术中，当KASP标记包括S07_43139773G/T和S07_43139033A/G中的一种或两种时，均与大豆皂苷含量相关。作为一优选的实施方式，本专利技术KASP标记优选的为S07_43139773G/T和S07_43139033A/G中的一种。作为另一优选的实施方式，本专利技术KASP标记优选为S07_43139773G/T和S07_43139033A/G。
[0024]在本专利技术中，所述S07_43139773G/T处碱基是G的大豆优选为皂苷Aa含量低的大豆，碱基是T的大豆为皂苷Aa含量高的大豆。所述S07_43139033A/G碱基是A的大豆皂苷Ab含量高的大豆，碱基是G的大豆皂苷Ab含量低的大豆。
[0025]本专利技术还提供了一种用于检测上述KASP标记的引物对，所述KASP标记的引物对包
括S07_43139773G/T引物对和S07_43139033A/G引物对中的一种或两种；
[0026]所述S07_43139773G/T的上游引物F1的序列如SEQ ID No.1所示，上游引物F2的序列如SEQ ID No.2所示，下游引物R的序列如SEQ ID No.3所示；
[0027]所述S07_43139033A/G的上游引物F1的序列如SEQ ID No.4所示，上游引物F2的序列如SEQ ID No.5所示，下游引物R的序列如SEQ ID No.6所示。
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种大豆皂苷相关的KASP标记，其特征在于，所述KASP标记包括S07_43139773G/T和S07_43139033A/G中的一种或两种，所述S07_43139773G/T为大豆基因组第7号染色体43139773bp位置上的碱基为G/T，所述S07_43139033A/G为大豆基因组第7号染色体43139033bp位置上的碱基为A/G。2.根据权利要求1所述的KASP标记，其特征在于，所述S07_43139773G/T处碱基是G的大豆为皂苷Aa含量低的大豆，碱基是T的大豆为皂苷Aa含量高的大豆。3.根据权利要求1所述的KASP标记，其特征在于，所述S07_43139033A/G碱基是A的大豆皂苷Ab含量高的大豆，碱基是G的大豆皂苷Ab含量低的大豆。4.一种用于检测权利要求1所述KASP标记的引物对，其特征在于，所述KASP标记的引物对包括S07_43139773G/T引物对和S07_43139033A/G引物对中的一种或两种；所述S07_43139773G/T的上游引物F1的序列如SEQ ID N...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈华涛，唐威，张红梅，张威，刘晓庆，王琼，许文静，崔晓艳，陈新，
申请(专利权)人：江苏省农业科学院，
类型：发明
国别省市：