一种青稞千粒重相关分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种青稞千粒重相关分子标记及其应用，涉及分子育种技术领域；通过检测青稞基因组中如SEQ ID NO.1所示序列第243bp位点的多态性，以实现育种早期对青稞的千粒重性状进行鉴定或辅助鉴定。本发明专利技术为青稞的分子标记辅助选择育种提供了一个新方法，在培育高产青稞品种的理论研究和实践应用中均具有重要意义。要意义。要意义。

【技术实现步骤摘要】
一种青稞千粒重相关分子标记及其应用


[0001]本专利技术属于分子育种
，尤其涉及一种与青稞千粒重相关的分子标记及其应用。

技术介绍

[0002]大麦（Hordeum vulgare L.）是最古老的作物之一，在世界范围内广泛种植，特别是在高海拔、高纬度、沿海滩涂等一些极端生态条件下，是适应范围最广的谷类作物之一。大麦根据麸皮的有无可分为皮大麦和裸大麦，其中裸大麦又称作青稞，其含有的营养成分高于水稻、小麦、玉米，主要作为饲料、啤酒麦芽、粮食、医药保健食品和其他工业原料。选育高产青稞品种一直是育种家关注的重点，其中千粒重是影响青稞产量的重要因素之一，由粒长、粒宽、粒厚和籽粒体积等因素决定，尤其粒宽对千粒重的直接作用最大。因此，利用千粒重及其相关性状的遗传变异来选育或改良现有品种，是提高青稞产量的有效途径。
[0003]青稞千粒重性状是复杂的数量性状，受多个数量性状基因位点（Quantitative trait locus，QTL）控制，具有遗传力较低、选择难度高的特性，传统的育种方法存在时间长、成本高的问题。而分子标记辅助育种是一种采用与目标性状相关联的分子标记作为辅助手段进行育种的有效方法，能快速有效地选择具有优良性状的品系，缩短育种进程。因此，发掘控制青稞千粒重的优异等位基因并将其利用于育种中，有助于培育产量突出的青稞新品种。

技术实现思路

[0004]本专利技术要解决的技术问题是提供一种青稞千粒重相关的分子标记及其应用。
[0005]为解决上述技术问题，本专利技术所采取的技术方案如下。
[0006]一种用于鉴定或辅助鉴定青稞千粒重性状的试剂盒，用于检测青稞基因组中如SEQ ID NO.1所示序列第243bp位点的多态性，所述位点处的核苷酸为G或C。
[0007]作为本专利技术的一种优选技术方案，所述试剂盒中包含序列表中SEQ ID NO.2和/或SEQ ID NO.3和/或SEQ ID NO.4组成的引物。
[0008]作为本专利技术的一种优选技术方案，所述试剂盒中还包含 ddH2O、dNTP、Taq Master Mix、其他常规组件当中的一种或几种组合。
[0009]一种用于鉴定或辅助鉴定青稞千粒重性状的引物，包括引物STARP
‑
2022
‑
F1、引物STARP
‑
2022
‑
F2、引物STARP
‑
2022
‑
R；其核苷酸序列依次如SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4所示。
[0010]作为本专利技术的一种优选技术方案，所述引物STARP
‑
2022
‑
F1与引物STARP
‑
2022
‑
F2构成竞争性关系，引物STARP
‑
2022
‑
R作为公共反向引物。
[0011]一种用于鉴定或辅助鉴定青稞千粒重性状的分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
[0012]作为本专利技术的一种优选技术方案，所述分子标记第243bp位点处的核苷酸为G或C。
[0013]所述试剂盒的用途，在分子育种过程中用于鉴定或辅助鉴定青稞的千粒重性状。
[0014]所述的引物的用途，在分子育种过程中用于鉴定或辅助鉴定青稞的千粒重性状。
[0015]所述分子标记的用途，在分子育种过程中用于鉴定或辅助鉴定青稞的千粒重性状。
[0016]一种鉴定或辅助鉴定青稞千粒重性状的方法，检测青稞基因组中如SEQ ID NO.1所示序列第243bp位点的多态性，以实现育种早期对青稞的千粒重性状进行鉴定或辅助鉴定。
[0017]作为本专利技术的一种优选技术方案，采用SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4所示序列为引物，以被检测青稞基因组DNA为模板进行扩增；如果PCR扩增产物中具有168bp的单独特异DNA片段，待测青稞候选为具有高千粒重性状的青稞；如果PCR扩增产物中具有158bp和168bp两条DNA片段，待测青稞候选为具有低千粒重性状的青稞。
[0018]采用上述技术方案所产生的有益效果在于：本专利技术公开了一种与青稞千粒重相关的基因分子标记，并进一步开发了相关的引物对，采用所开发的引物以被检测青稞基因组DNA为模板进行扩增，如果PCR扩增产物中具有168bp的单独特异DNA片段，待测青稞候选为具有高千粒重性状的青稞；如果PCR扩增产物中具有158bp和168bp两条DNA片段，待测大麦候选为具有低千粒重性状的青稞。应用本专利技术开发的技术体系对青稞进行分子标记辅助选择育种（MAS），对青稞高产品种的选育具有重要的理论和实践意义。
附图说明
[0019]图1为本专利技术实施例1中不同遗传背景的青稞品种的HvNAM
‑
1基因的基因序列差异比对结果图。
[0020]图2为本专利技术实施例3中STARP
‑
2022在不同千粒重青稞品种中的凝胶电泳检测图谱；图中，M为2000bp DNA Ladder。
[0021]图3为本专利技术实施例3中不同青稞品种基于中STARP
‑
2022的千粒重的单标记分析结果图；图中，A表示含有HvNAM
‑
1等位基因，B表示不含有HvNAM
‑
1等位基因，***表示差异显著水平（P＜0.001）。
具体实施方式
[0022]以下实施例详细说明了本专利技术。本专利技术所使用的各种原料及各项设备均为常规市售产品，均能够通过市场购买直接获得。
[0023]应当理解，当在本申请说明书和所附权利要求书中使用时，术语“包括”指示所描述特征、整体、步骤、操作、元素的存在，但并不排除一个或多个其它特征、整体、步骤、操作、元素的存在或添加。还应当理解，在本申请说明书和所附权利要求书中使用的术语“和/或”是指相关联列出的项中的一个或多个的任何组合以及所有可能组合，并且包括这些组合。
[0024]如在本申请说明书和所附权利要求书中所使用的那样，术语“如果”可以依据上下文被解释为“当...时”或“一旦”或“响应于确定”或“响应于检测到”。类似地，短语“如果确定”或“如果检测到[所描述条件或事件]”可以依据上下文被解释为意指“一旦确定”或“响应于确定”或“一旦检测到[所描述条件或事件]”或“响应于检测到[所描述条件或事件]”。另外，在本申请说明书和所附权利要求书的描述中，术语“第一”、“第二”、“第三”等仅用于
区分描述，而不能理解为指示或暗示相对重要性。在本申请说明书中描述的参考“一个实施例”或“一些实施例”等意味着在本申请的一个或多个实施例中包括结合该实施例描述的特定特征、结构或特点。由此，在本说明书中的不同之处出现的语句“在一个实施例中”、“在一些实施例中”、“在其他一些实施例中”、“在另外一些实施例中”等不是必然都参考相同的实施例，而是意味着“本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于鉴定或辅助鉴定青稞千粒重性状的试剂盒，用于检测青稞基因组中如SEQ ID NO.1所示序列第243bp位点的多态性，所述位点处的核苷酸为G或C。2.根据权利要求1所述的用于鉴定或辅助鉴定青稞千粒重性状的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒中包含序列表中SEQ ID NO.2和/或SEQ ID NO.3和/或SEQ ID NO.4组成的引物。3.根据权利要求1所述的用于鉴定或辅助鉴定青稞千粒重性状的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒中还包含 ddH2O、dNTP、Taq Master Mix、其他常规组件当中的一种或几种组合。4.一种用于鉴定或辅助鉴定青稞千粒重性状的引物，包括引物STARP
‑
2022
‑
F1、引物STARP
‑
2022
‑
F2、引物STARP
‑
2022
‑
R；其核苷酸序列依次如SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4所示。5.根据权利要求4所述的引物，其特征在于：所述引物STARP
‑
2022
‑
F1与引物STARP...

【专利技术属性】
技术研发人员：王会芳，张玉梅，崔树宾，陈海龙，卫喜瑞，杨棒棒，赵欣雨，付晓凤，
申请(专利权)人：青岛农业大学，
类型：发明
国别省市：