一种环状RNA分子翻译的蛋白质及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种环状RNA分子hsa_circ_0000563所编码的蛋白质circBTBD7

【技术实现步骤摘要】
一种环状RNA分子翻译的蛋白质及其应用


[0001]本专利技术属于分子标志物
，特别涉及一种环状RNA分子hsa_circ_0000563编码的蛋白质circBTBD7
‑
420aa，及其检测制剂在制备冠状动脉粥样硬化诊断试剂中的应用。

技术介绍

[0002]环状RNA(circular RNAs，circRNAs)是由特定外显子或(和)内含子环化产生的一大类特别稳定的RNA，在体内，circRNAs由剪接体通过反向剪切产生：下游外显子的3
’
端与上游外显子的5
’
端共价连接，大多数circRNAs起源于编码蛋白质的基因，并且包含完整的外显子。circRNAs在哺乳动物神经元和肌肉组织中大量存在，并且在进化上是保守的，迄今为止，只有少数circRNAs的功能得到了阐明。在分子水平上，circRNAs可以作为海绵，吸附microRNA(miRNA)，从而调节下游靶基因水平；circRNAs还可以与蛋白结合调节其功能。然而，仍有大量circRNAs的功能是未知的。
[0003]尽管circRNAs曾经被认为是非编码RNA，但近年来有证据提示circRNAs可以编码多肽或者蛋白质，并且参与不同疾病的发生发展，这将在很大程度上拓宽对circRNAs功能的理解。circRNAs可以以cap
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independent的方式翻译。目前已发现两种cap
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independent的方式来介导circRNAs的翻译：内部核糖体进入位点(internal ribosome entry site，IRES)介导及N6
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甲基腺苷(N6
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methyladenosines，m6A)介导。研究表明，circRNAs编码的蛋白质在不同的器官和疾病中发挥着重要的作用。
[0004]值得注意的是，circRNAs编码蛋白质在冠心病中的研究尚未见报道。

技术实现思路

[0005]本专利技术在既往研究中分别从组织标本、临床外周血标本及细胞模型三个维度证实了hsa_circ_0000563参与了冠心病的发生与发展。进一步研究发现hsa_circ_0000563具有一定的翻译功能，可以翻译一个包含420个氨基酸的蛋白质：circBTBD7
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420aa，并通过实验证实了该蛋白质的内源性存在与部分功能。经文献检索与数据库比对，该蛋白质系人类首次发现，为本课题组原创性成果，为了进一步探究该蛋白质在冠心病发病中的作用和治疗靶点的潜在价值，现亟需对circBTBD7
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420aa在冠心病发生、发展中的功能与机制进行深入系统的研究。
[0006]本专利技术的目的是提供一种环状RNA分子hsa_circ_0000563编码的蛋白质及其应用，及其检测制剂在制备冠状动脉粥样硬化诊断试剂中的应用。
[0007]为了实现上述目的，本专利技术采用以下技术方案：一种环状RNA分子hsa_circ_0000563，所述hsa_circ_0000563的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述hsa_circ_0000563所编码的多肽circBTBD7
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420aa的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
[0008]检测circBTBD7
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420aa表达量的制剂在制备冠状动脉粥样硬化诊断试剂中的应用，所述circBTBD7
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420aa的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
[0009]进一步的，检测制剂通过检测被试者PBMC细胞中circBTBD7
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420aa的表达，与健康对照组相比较表达显著下调，以此来判断被试者有冠状动脉粥样硬化。
[0010]一种冠状动脉粥样硬化的诊断试剂，包括：检测circBTBD7
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420aa表达量的制剂，所述circBTBD7
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420aa的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
[0011]一种冠状动脉粥样硬化的诊断试剂盒，所述诊断试剂盒中包括上述的诊断试剂。
[0012]本专利技术首次发现circRNA在冠心病中发挥了一定生物学功能，聚焦于circBTBD7
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420aa三维结构与HCASMCs增值迁移模型的关系，有望拓展HIF
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1通路与冠心病关系的思路，且基础实验与临床分析相结合，凸显应用价值。
附图说明
[0013]图1是实施例HCASMCs中hsa_circ_0000563的鉴定及特征。
[0014]图2是实施例hsa_circ_0000563在HCASMCs增殖迁移模型的生物学功能。
[0015]图3是实施例hsa_circ_0000563编码的蛋白circ
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BTBD7
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420aa信息。
[0016]图4是实施例circBTBD7
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420aa的定量及定位。
[0017]图5是实施例circBTBD7
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420aa的预测特征。
[0018]图6是实施例circBTBD7和SLC3A2的相互结合。
[0019]图7是实施例circBTBD7
‑
420aa下游差异蛋白KEGG富集分析。
具体实施方式
[0020]为了使本
的人员更好地理解本申请方案，下面将结合本申请实施例中的附图，对本申请实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本申请一部分的实施例，而不是全部的实施例。基于本申请中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都应当属于本申请保护的范围。
[0021]需要说明的是，本申请的说明书和权利要求书及上述附图中的术语“包括”和“具有”以及他们的任何变形，意图在于覆盖不排他的包含，例如，包含了一系列步骤或单元的过程、方法、系统、产品或设备不必限于清楚地列出的那些步骤或单元，而是可包括没有清楚地列出的或对于这些过程、方法、产品或设备固有的其它步骤或单元。
[0022]申请人长期致力于冠心病表观遗传学方向的研究，自2004年，申请人获得了四项国家自然科学基金及三项江苏省课题资助，已发表多篇非编码RNA与冠心病相关的SCI论文。本课题组既往研究检测了冠心病患者与正常人血浆中microRNA表达，发现miR
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155与miR
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130a在冠心病患者中表达水平显著降低，且miR
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155与miR
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130a表达可以较好用于冠心病的早期诊断，之后课题组通过starbase预测发现hsa_circ_0000563同时含有miRNA
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155和miRNA
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130a的结合位点，至此，hsa_circ_0000563进入了本课题组的研究范围本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种环状RNA分子hsa_circ_0000563，其特征在于：所述hsa_circ_0000563的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述hsa_circ_0000563所编码的多肽circBTBD7
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420aa的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。2.检测circBTBD7
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420aa表达量的制剂在制备冠状动脉粥样硬化诊断试剂中的应用，其特征在于，所述circBTBD7
‑
420aa的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。3.根据...

【专利技术属性】
技术研发人员：贾恩志，甘雄康，王彦君，任梦梦，张鑫，
申请(专利权)人：江苏省人民医院南京医科大学第一附属医院，
类型：发明
国别省市：