一种利用SETX基因单核苷酸遗传标记鉴定虎斑云岭牛品种的方法技术

本发明专利技术公开了一种利用SETX基因单核苷酸遗传标记鉴定虎斑云岭牛品种的方法。本发明专利技术利用全基因组关联分析方法，对云岭牛的全基因组SNP进行分析，发现了云岭牛的11号染色体上一个使SETX基因密码子改变的特有突变，为虎斑云岭牛实现品种鉴定提供了依据。同时根据该突变所在SNP位点可以在DNA水平上对云岭牛的虎斑毛色性状进行筛选，从而快速建立遗传资源优良的云岭牛种群。的云岭牛种群。

【技术实现步骤摘要】
一种利用SETX基因单核苷酸遗传标记鉴定虎斑云岭牛品种的方法


[0001]本专利技术涉及云岭牛(Yunling cattle)引种和育种中的分子标记，具体涉及在DNA水平上检测与云岭牛虎斑毛色性状密切相关的单核苷酸遗传标记(SNP标记)，以及利用SETX基因SNP标记鉴定虎斑云岭牛。

技术介绍

[0002]单核苷酸多态(SNP，single nucleotide polymorphism)是同一物种不同个体基因组DNA的等位序列上单个核苷酸存在差别的现象。相同长度的单链DNA因其顺序不同或单个碱基差异，所形成的构象就会不同。SNP是生物体基因组中存在最为广泛的一类变异，它是由于单个核苷酸的插入、缺失、转换和颠换而引起的。
[0003]某些SNP的存在导致个体基因组相应基因位点保留了与表型相关的错义突变等不同形式的变异。错义突变是编码某种氨基酸的密码子经碱基替换以后变成编码另一种氨基酸的密码子，从而使多肽链的氨基酸种类和序列发生改变。
[0004]云岭牛的毛色一般为黑色、黄色和灰色。除此之外，在云岭牛群体中还存在具有不同于普通云岭本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种利用单核苷酸遗传标记鉴定云岭牛品种的方法，其特征在于：该鉴定云岭牛品种的方法包括以下步骤：对云岭牛个体候选基因组区域内的单核苷酸突变位点进行检测，若检测出该云岭牛个体在所述候选基因组区域中位于牛参考基因组第11号染色体第102388841位的SNP位点存在导致SETX基因发生错义突变的等位基因，则将所述云岭牛个体的品种确定为虎斑云岭牛。2.根据权利要求1所述一种利用单核苷酸遗传标记鉴定云岭牛品种的方法，其特征在于：所述候选基因组区域位于牛参考基因组第11号染色体的98.7Mb至102.4Mb。3.根据权利要求1所述一种利用单核苷酸遗传标记鉴定云岭牛品种的方法，其特征在于：所述牛参考基因组为ARS
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UCD1.2。4.根据权利要求1所述一种利用单核苷酸遗传标记鉴定云岭牛品种的方法，其特征在于：所述第102388841位的SNP位点为T>C突变，该SNP位点的突变等位基因C为导致SETX基因发生错义突变的等位基因。5.根据权利要求1所述一种利用单核苷酸遗传标记鉴定云岭牛品种的方法，其特征在于：所述鉴定云岭牛品种的方法还包括以下步骤：对以下与所述第102388841位的SNP位点连锁的位于牛参考基因组第11号染色体的一个或多个SNP位点进行突变等位基因检测：第98712522位、第98732751位、第98764247位、第99015162位、第99095070位、第99205610位、第99300951位、第99890654位、第100401425位、第102226280位、第102336227位、第102...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈宁博，张俸伟，雷初朝，夏小婷，亐开兴，党瑞华，黄永震，蓝贤勇，陈宏，
申请(专利权)人：西北农林科技大学，
类型：发明
国别省市：