一种与奶山羊产奶性状和产羔性状相关的SNP分子标记、液相芯片检测试剂盒和应用制造技术

本发明专利技术提供了一种与奶山羊产奶性状和产羔性状相关的SNP分子标记、液相芯片检测试剂盒和应用，属于分子标记技术领域。本发明专利技术利用奶山羊全血为材料，提取DNA，经重测序、程序质控和后续验证后，在奶山羊全基因组中确定了20个产奶相关的SNP标记位点(14个产奶性状SNP位点和6个产羔性状SNP位点)，利用这些SNP位点定位其所在的基因及扩增位点引物序列信息，进而制成液相芯片检测试剂盒。利用含有这些SNP位点的液相芯片试剂盒可以快速定性鉴定奶山羊产奶量及产羔率。本发明专利技术提供的分子标记有利于快速准确筛选奶山羊，且大大降低了单个SNP检测成本，缩短检测时间，进而达到既快又准的目的。的。的。

【技术实现步骤摘要】
一种与奶山羊产奶性状和产羔性状相关的SNP分子标记、液相芯片检测试剂盒和应用


[0001]本专利技术属于分子标记
，具体涉及一种与奶山羊产奶性状和产羔性状相关的SNP分子标记、液相芯片检测试剂盒和应用。

技术介绍

[0002]在现代社会，随着经济的增长和社会的进步，人们生活水平稳步上升，人们逐渐开始有了食物消化吸收和营养平衡的健康保健意识。肉蛋奶是人们必不可少的日常食物来源，其中奶类多以牛奶为主。有研究发现，羊奶中还有蛋白质、脂肪、钙元素、磷元素、铁元素、钾元素、维生素B1、维生素B2、尼克酸等营养物质，还含有丰富的蛋白质，能够增强免疫力，促进伤口愈合。酪蛋白和乳清蛋白在总蛋白中占大多数，且致敏源α
‑
S1酪蛋白含量低，因此，羊奶比牛奶更易消化吸收，不会产生过敏反应。羊奶中丰富的钙、磷元素高于牛奶，能够更好的补充钙质，促进骨骼发育，提高骨密度，预防骨质酥松。目前制约羊奶推广的主要原因之一就是羊奶产量与牛奶相比相对较低，双羔率低，提高羊奶产量和产羔率可以极大的改善我国国民体质，增强抵抗力。
[0003]单核苷酸多态性(SNP)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种，占所有已知多态性的90％以上，SNP在人类基因中广泛存在，平均每300个碱基对中就有1个，估计其总数可达300万个甚至更多。近十几年来有许多科学家利用SNP来定位分析基因。SNP是一种二态的标记，由单个碱基的转化或颠换所引起，也可由碱基的插入或缺失所致。SNP既可能在基因序列内，也可能在基因以外的非编码序列上。分子标记辅助选择(MAS，molecular marker
‑
assisted selection)是随着现代分子生物学技术的迅速发展而产生的新技术，它可以从分子水平上快速准确的分析个体的遗传组成，从而实现对基因型的直接选择，进行分子育种。分子标记是以DNA多态性为基础的遗传标记，其特点是1)传多态性高；2)在基因组中大量存在且均匀分布；3)稳定性、重现性好；4)信息量大，分析效率高。MAS技术应用主要集中在基因聚合(Gene pyramiding)、基因渗透(Gene transgression)、根据育种计划构建基因系等方面。利用传统方法对奶山羊产奶性状和产羔性状进行选择鉴定，耗时长，准确度差，成本高。目前鲜有关于奶山羊产奶量和产羔率相关的SNP分子标记的报道，因此，急需一种能够准确快速鉴定奶山羊产奶量性状和产羔率性状的SNP分子标记。

技术实现思路

[0004]有鉴于此，本专利技术的目的在于提供一种与奶山羊产奶性状和产羔性状相关的SNP分子标记，具有快速准确，检测成本低的特点。
[0005]本专利技术的目的还在于提供一种液相芯片检测试剂盒和应用，能够实现快速检测。
[0006]本专利技术提供了一种与奶山羊产奶性状和产羔性状相关的SNP分子标记，包括SMS001～SMS020；所述SMS001～SMS020的核苷酸序列为SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:20所示
或SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:20的互补序列。
[0007]本专利技术提供了一种液相芯片检测试剂盒，包括扩增所述SNP分子标记的引物对；
[0008]SMS001上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：15所示，SMS001下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：16所示；
[0009]SMS002上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：17所示；SMS002下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：18所示；
[0010]SMS003上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：19所示，SMS003下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：20所示；
[0011]SMS004上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：21所示；SMS004下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：22所示；
[0012]SMS005上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：23所示，SMS005下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：24所示；
[0013]SMS006上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：25所示；SMS006下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：26所示；
[0014]SMS007上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：27所示，SMS007下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：28所示；
[0015]SMS008上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：29所示；SMS008下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：30所示；
[0016]SMS009上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：31所示，SMS009下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：32所示；
[0017]SMS010上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：33所示；SMS010下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：34所示；
[0018]SMS011上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：35所示，SMS011下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：36所示；
[0019]SMS012上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：37所示；SMS012下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：38所示；
[0020]SMS013上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：39所示，SMS01下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：40所示；
[0021]SMS014上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：41所示；SMS014下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：42所示；
[0022]SMS015上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：43所示，SMS001下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：44所示；
[0023]SMS016上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：45所示；SMS002下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：46所示；
[0024]SMS017上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：47所示，SMS003下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：48所示；
[0025]SMS018上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：49所示；SMS004下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：50所示；
[0026]SMS019上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：51所示，SMS005下游引物的核苷酸序
列如SEQ ID NO：52所示；
[0027]SMS020上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：53所示；SMS006下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：54所示。
[0028]优选的，还包括以下一种或几种试剂：DNA片段修饰用试剂、杂交探针、片段化buffer和杂交buffer。
[0029]优选的，所述DNA片段修饰本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与奶山羊产奶性状和产羔性状相关的SNP分子标记，其特征在于，包括SMS001～SMS020；所述SMS001～SMS020的核苷酸序列为SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:20所示或SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:20的互补序列。2.一种液相芯片检测试剂盒，其特征在于，包括扩增权利要求1所述SNP分子标记的引物对；SMS001上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：15所示，SMS001下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：16所示；SMS002上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：17所示；SMS002下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：18所示；SMS003上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：19所示，SMS003下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：20所示；SMS004上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：21所示；SMS004下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：22所示；SMS005上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：23所示，SMS005下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：24所示；SMS006上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：25所示；SMS006下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：26所示；SMS007上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：27所示，SMS007下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：28所示；SMS008上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：29所示；SMS008下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：30所示；SMS009上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：31所示，SMS009下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：32所示；SMS010上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：33所示；SMS010下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：34所示；SMS011上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：35所示，SMS011下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：36所示；SMS012上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：37所示；SMS012下游引物的核...

【专利技术属性】
技术研发人员：安小鹏，宋宇轩，曹斌云，张磊，李广，李富，
申请(专利权)人：西北农林科技大学，
类型：发明
国别省市：