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用于检测数据中的异质性的分辨率指数及其使用方法技术

技术编号:37041379 阅读:31 留言:0更新日期:2023-03-29 19:20
提供了用于检测数据(例如流式细胞仪数据、核酸序列数据)中的异质性的方法。在一些实例中,方法包括:基于生物样本的样本中的分析物(例如细胞、粒子、核酸)的已确定的参数生成一个或更多个群簇。在实施例中,方法包括:通过计算任意给定数量的成对的第一数据群和第二数据群的差异量度与间隔距离之间的比率而计算分辨率指数。当需要时,方法还包括:通过计算分辨率分数而使数据群之间的分辨率最大化,所述分辨率分数考虑分辨率指数、群的数量、参数的数量和细胞的数量总和。还提供了用于确定数据群之间的异质性以及当需要时使数据群之间的分辨率最大化的系统及计算机可读介质。的分辨率最大化的系统及计算机可读介质。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】Applications(临床流式细胞术:原理与应用),Williams&Wilkins(1993);Ormerod(编),Flow Cytometry:Practical Approach(流式细胞术:实际方法),牛津大学出版社(1994);Jaroszeski等(编),Flow Cytometry Protocols,Methods in Molecular Biology(流式细胞术方案,分子生物学中的方法),第91期,Humana出版社(1997);以及Practical Shapiro,Flow Cytometry(流式细胞术),第4版,Wiley

Liss(2003);都通过引用并入本文。荧光成像显微术在以下文件中进行了描述:例如,Pawley(编),Handbook of Biological Confocal Microscopy(生物共焦显微术手册),第2版,Plenum出版社(1989),其通过引用并入本文。
[0009]核酸测序方法包括桑格“双脱氧”法,其依赖于使用双脱氧核苷三磷酸作为链终止子(chain termina本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种检测数据中的异质性的方法,所述方法包括:分别获得第一数据群和第二数据群的差异量度;从获得的差异量度确定所述第一数据群和所述第二数据群的间隔距离;以及通过将所述第一数据群和所述第二数据群的相应的差异量度与所述间隔距离进行比较而计算所述第一数据群和所述第二数据群的分辨率指数。2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述数据是流式细胞仪数据。3.根据权利要求1或2所述的方法,其中,所述数据是核酸测序数据。4.根据权利要求1、2或3所述的方法,其中,所述分辨率指数是所述第一数据群和所述第二数据群之间的间隔的量化。5.根据前述权利要求中的任一项所述的方法,其中,第一群包括对于给定参数为阳性的数据,并且第二群包括对于给定参数为阴性的数据。6.根据前述权利要求中的任一项所述的方法,其中,获得差异量度包括分别计算所述第一数据群和所述第二数据群的平均质心位置和标准差。7.根据前述权利要求中的任一项所述的方法,其中,计算所述分辨率指数包括:计算所述第一数据群和所述第二数据群的相应的差异量度与所述间隔距离之间的比率。8.根据权利要求7所述的方法,其中,所述比率根据等式A来被计算,其中:是所述第一数据群的平均质心位置;是所述第二数据群的平均质心位置;SD
clust01
是所述第一数据群的标准差;以及SD
...

【专利技术属性】
技术研发人员:伊恩
申请(专利权)人:贝克顿
类型:发明
国别省市:

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