小麦储藏蛋白、淀粉和粒重调控基因TaB3-2A1的分子标记及特异性引物和应用制造技术

本发明专利技术公开了一种小麦储藏蛋白、淀粉和粒重调控基因TaB3

【技术实现步骤摘要】
小麦储藏蛋白、淀粉和粒重调控基因TaB3
‑
2A1的分子标记及特异性引物和应用


[0001]本专利技术属于农业生物
，具体涉及小麦储藏蛋白、淀粉和粒重调控基因TaB3
‑
2A1的分子标记及特异性引物和应用。

技术介绍

[0002]小麦是世界上种植面积最大的主粮作物，也是我国最重要的主食来源。以前我国由于人多、地少、单产低等因素，一直将提高产量作为主要育种目标，忽视了品质改良。近年来随着人们生活水平的提高，优质小麦品种的培育也已成为重要育种目标，所以产量和品质的协同改良是我们所面临的重要课题。小麦籽粒中淀粉约占70％，蛋白质约占12
‑
14％，两者共同决定品质和产量。协同调控籽粒中淀粉和蛋白质含量和组分构成对于小麦品质和产量的协同改良至关重要。因此，挖掘小麦储藏蛋白、淀粉、粒重多性状调控基因遗传位点具有重要的实际应用价值。

技术实现思路

[0003]为了开发小麦低储藏蛋白含量和/或高淀粉含量和/或高千粒重的SNP分子标记，本专利技术提供如下技术方案：
[0004]本专利技术提供了检测小麦基因组中TaB3
‑
2A1基因的第523处SNP位点的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定待测小麦籽粒储藏蛋白含量和/或淀粉含量和/或千粒重中的应用；
[0005]所述SNP位点为序列表的序列4所示DNA分子的第523位核苷酸。
[0006]上述应用中，所述SNP位点的基因型为TT或AA。
[0007]或本专利技术提供了检测小麦基因组中TaB3
‑
2A1基因的第523处SNP位点的基因型的物质在选育籽粒低储藏蛋白含量和/或高淀粉含量和/或高千粒重小麦中的应用；
[0008]所述SNP位点为序列表的序列4所示DNA分子的第523位核苷酸。
[0009]上述应用中，所述检测小麦基因组中TaB3
‑
2A1基因的第523处SNP位点的基因型的物质如下1)或2)：
[0010]1)KASP成套引物，
[0011]所述KASP成套引物由序列表中序列1所示的单链DNA分子或其衍生物、序列表中序列2所示的单链DNA分子或其衍生物和序列表中序列3所示的单链DNA分子或其衍生物组成；
[0012]2)含有所述成套引物的PCR试剂或试剂盒。上述试剂盒中，KASP成套引物中的不同引物各自单独包装。
[0013]上述试剂盒中还可包括其他常规用于PCR扩增的试剂和其他常规用于基因组提取的试剂及相应的PCR程序。
[0014]上述PCR扩增的试剂还包括特异探针组。所述特异探针组包括荧光探针A和荧光探针B；荧光探针A如序列表的序列5所示，5
’
末端连接荧光基团；荧光探针B如序列表的序列6所示，5
’
末端连接荧光基团；荧光探针A和荧光探针B中的荧光基团不同；荧光探针A具体连
接FAM荧光基团；荧光探针B具体连接HEX荧光基团。
[0015]上述PCR扩增的试剂包括KASP 2
×
Master Mix。
[0016]利用KASP成套引物进行扩增，扩增时的PCR扩增的程序为：94℃15min；94℃20s、61
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55℃1min(每个循环降0.6℃)、10个循环；94℃20s、55℃60s、26个循环。通过酶标仪的FAM HEX ROM光束扫描和Kluster Caller分型软件对PCR扩增产物的荧光信号进行分型检测。
[0017]上述应用中，所述序列表中序列1所示的单链DNA分子的衍生物为序列1所示的单链DNA分子经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子；
[0018]所述序列表中序列2所示的单链DNA分子的衍生物为如下1)或2)：
[0019]1)序列2所示的单链DNA分子的5'端连接一种荧光序列或荧光基团；
[0020]2)序列2所示的单链DNA分子经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子的5'端连接一种荧光序列或荧光基团；
[0021]所述序列表中序列3所示的单链DNA分子的衍生物为如下3)或4)：
[0022]3)序列3所示的单链DNA分子的5'端连接另一种荧光序列或荧光基团；
[0023]4)序列3所示的单链DNA分子经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同功能的DNA分子的5'端连接另一种荧光序列或荧光基团；
[0024]所述荧光基团为FAM或HEX。
[0025]进一步地，上述检测小麦基因组中TaB3
‑
2A1基因的第523处SNP位点的基因型的物质为分子标记TaB3
‑
2A1
‑
KASP
523A/T
；该分子标记为上述1)KASP成套引物或2)含有所述成套引物的PCR试剂或试剂盒。
[0026]本专利技术还提供了一种鉴定或辅助鉴定待测小麦籽粒储藏蛋白含量和/或淀粉含量和/或千粒重的方法，为检测小麦基因组中TaB3
‑
2A1基因的第523处SNP位点的基因型是AA纯合型还是TT纯合型，TT纯合型小麦的籽粒储藏蛋白含量和/或淀粉含量和/或千粒重性状优于AA纯合型小麦；
[0027]其中TaB3
‑
2A1基因第532处SNP位点的基因型为TT纯合型的待测小麦籽粒淀粉含量和/或千粒重高于AA纯合型的待测小麦，TaB3
‑
2A1基因第532处SNP位点的基因型为TT纯合型的待测小麦籽粒储藏蛋白含量低于AA纯合型的待测小麦；
[0028]所述SNP位点为小麦基因组中的序列表的序列4所示DNA分子的第523位核苷酸。
[0029]或，本专利技术还提供了一种选育籽粒低储藏蛋白含量和/或高淀粉含量和/或高千粒重的小麦的方法，为检测小麦基因组中TaB3
‑
2A1基因的第523处SNP位点基因型是AA纯合型还是TT纯合型；
[0030]选育SNP位点基因型为TT纯合型的待测小麦，得到籽粒低储藏蛋白含量和/或高淀粉含量和/或高千粒重的小麦；
[0031]所述SNP位点为序列表的序列4所示DNA分子的第523位核苷酸。
[0032]上述方法中，所述检测小麦基因组中TaB3
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2A1基因的第523处SNP位点的基因型是AA纯合型还是TT纯合型的方法，为如下A)或B)：
[0033]A)直接测序；
[0034]B)用上述成套引物对所述待测小麦基因组DNA进行KASP检测，实现基因分型。
[0035]上述鉴定或辅助鉴定待测小麦籽粒储藏蛋白含量和/或淀粉含量和/或千粒重的方法具体包括如下步骤：
[0036](1)以待测小麦的基因组DNA为模板，采用上述成套引物进行KASP；
[0037](2)完成步骤(1)后，进行荧本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.检测小麦基因组中TaB3
‑
2A1基因的第523处SNP位点的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定待测小麦籽粒储藏蛋白含量和/或淀粉含量和/或千粒重中的应用；所述SNP位点为序列表的序列4所示DNA分子的第523位核苷酸。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述SNP位点基因型为TT或AA。3.检测小麦基因组中TaB3
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2A1基因的第523处SNP位点的基因型的物质在选育籽粒低储藏蛋白含量和/或高淀粉含量和/或高千粒重小麦中的应用；所述SNP位点为序列表的序列4所示DNA分子的第523位核苷酸。4.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述检测小麦基因组中TaB3
‑
2A1基因的第523处SNP位点的基因型的物质如下1)或2)：1)KASP成套引物，所述KASP成套引物由序列表中序列1所示的单链DNA分子或其衍生物、序列表中序列2所示的单链DNA分子或其衍生物和序列表中序列3所示的单链DNA分子或其衍生物组成；2)含有所述成套引物的PCR试剂或试剂盒。5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于：所述序列表中序列1所示的单链DNA分子的衍生物为序列1所示的单链DNA分子经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子；所述序列表中序列2所示的单链DNA分子的衍生物为如下1)或2)：1)序列2所示的单链DNA分子的5'端连接一种荧光序列或荧光基团；2)序列2所示的单链DNA分子经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子的5'端连接一种荧光序列或荧光基团；所述序列表中序列3所示的单链DNA分子的衍生物为如下3)或4)：3)序列3所示的单链DNA分子的5'端连接另一种荧光序列或荧光基团；4)序列3所示的单链DNA分子经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同功能的DNA分子的5'端连接另一种荧光序列或荧光基团。6.一种鉴定或辅助鉴定待测小麦籽粒储藏蛋白含量和/或淀粉含量和/或千粒重的方法，为检测小麦基因组中TaB3
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2A1基因的第523处SNP位点的基因型是AA纯合型还是TT纯合型，TT纯合型小麦的籽粒储藏蛋白含量和/或淀粉含量和/或千粒重性状优于AA纯合型小麦；其中SNP位点的基因型为TT纯合型的待测小麦籽粒淀粉含量和/或千粒重高于AA纯合型的待测小麦，SNP位点的基因型为TT纯合型的待测小麦籽粒储藏蛋白含量低于AA纯合型的待测...

【专利技术属性】
技术研发人员：曹双河，谢丽娜，张勇，夏先春，何中虎，
申请(专利权)人：中国农业科学院作物科学研究所，
类型：发明
国别省市：