一种鉴定高粱抗或感丝黑穗病的分子标记、引物组、试剂盒及应用制造技术

技术编号:36745979 阅读:14 留言:0更新日期:2023-03-04 10:28
本发明专利技术适用于高粱丝黑穗病鉴定技术领域,提供了一种鉴定高粱抗或感丝黑穗病的分子标记,包括分子标记6Sam72772和/或Tx430508;分子标记6Sam72772可为126bp的DNA片段和122bp的DNA片段,所述126bp的DNA片段,其核苷酸序列如SEQ ID:5所示,所述122bp的DNA片段,其核苷酸序列如SEQ ID:6所示;所述分子标记Tx430508为720bp的DNA片段,其核苷酸序列如SEQ ID:7所示。本发明专利技术还提供了相关的引物组、试剂盒、鉴定高粱抗或感丝黑穗病的方法。本发明专利技术提供了分子标记6Sam72772和Tx430508,可准确鉴定或辅助鉴定高粱抗或感丝黑穗病。鉴定高粱抗或感丝黑穗病。鉴定高粱抗或感丝黑穗病。

【技术实现步骤摘要】
一种鉴定高粱抗或感丝黑穗病的分子标记、引物组、试剂盒及应用


[0001]本专利技术属于高粱丝黑穗病鉴定
,尤其涉及一种鉴定高粱抗或感丝黑穗病的分子标记、引物组、试剂盒及应用。

技术介绍

[0002]高粱是世界上仅次于玉米、小麦、水稻、大麦的第五大禾谷类粮食作物,具有独特的抗逆性和广泛的适应性。高粱广泛地用作食用、酿造用和饲用等的原料,对世界干旱和半干旱地区的粮食生产有着举足轻重的作用。中国高粱每年大约种植0.6
×
107hm2,每年总产量为0.3
×
107吨,丝黑穗病是影响中国高粱产区的主要病害,病害严重时产量损失达80%以上,防治丝黑穗是中国高粱安全生产的主要任务。
[0003]高粱丝黑穗病是由孢堆黑粉菌引起的真菌性土传病害,孢子萌发后通过幼苗芽鞘基部侵染到达生长点细胞或细胞间隙,并随着植物生长向顶端分生组织发展,植株进入开花阶段后,菌丝生长至穗部,形成高粱“乌米”。不同国家高粱丝黑穗抗性资源比例不同,中国高粱抗性种质资源较少,很多中国抗性种质源于外引品种,但由于高粱丝黑穗病源菌变异快,如BTx623等种质引进到中国几年后就丧失抗性。
[0004]在生产中,培育抗丝黑穗品种是控制丝黑穗最为经济和有效的方法。相比传统技术,分子标记辅助育种技术将大大提高改良抗性品种的育种效率,但目前高粱抗丝黑穗病的抗性遗传位点不明确,因此,挖掘抗感丝黑穗病基因和开发分子标记对鉴定待测高粱抗或感丝黑穗病具有重要意义。

技术实现思路

[0005]本专利技术实施例的目的在于提供一种鉴定高粱抗或感丝黑穗病的分子标记,旨在解决上述
技术介绍
中提出的问题。
[0006]本专利技术实施例是这样实现的,一种鉴定高粱抗或感丝黑穗病的分子标记,包括分子标记6Sam72772和/或Tx430508;
[0007]其中,所述分子标记6Sam72772可为126bp的DNA片段和122bp的DNA片段,所述126bp的DNA片段,其核苷酸序列如SEQ ID:5所示,所述122bp的DNA片段,其核苷酸序列如SEQ ID:6所示;
[0008]所述分子标记Tx430508为720bp的DNA片段,其核苷酸序列如SEQ ID:7所示。
[0009]本专利技术实施例还提供了一种鉴定高粱抗或感丝黑穗病分子标记的引物组,包括针对分子标记6Sam72772的引物和/或针对分子标记Tx430508的引物;
[0010]其中,所述针对分子标记6Sam72772的引物:
[0011]引物6Sam72772F:5
’‑
GTAGAGAAGAGAATTGGGAGC
‑3’
(SEQ ID NO:1);
[0012]引物6Sam72772R:5
’‑
AATGTGGTGAAGTTTGCTCT
‑3’
(SEQ ID NO:2);
[0013]所述针对分子标记Tx430508的引物:
[0014]引物Tx430508F:5
’‑
ATGTTTCAAACTGCTATGGT
‑3’
(SEQ ID NO:3);
[0015]引物Tx430508R:5
’‑
TTACCTATCAACTATGGTGAC
‑3’
(SEQ ID NO:4)。
[0016]本专利技术实施例还提供了一种鉴定高粱抗或感丝黑穗病的试剂盒,包括上述分子标记的引物组。
[0017]本专利技术实施例还提供了一种鉴定高粱抗或感丝黑穗病的方法,包括以下步骤:
[0018]1)提取待检测高粱的基因组DNA;
[0019]2)以所述高粱的基因组DNA为模板,采用上述的引物对6Sam72772F/6Sam72772R或Tx430508F/Tx430508R进行PCR扩增,得到扩增产物;
[0020]3)对PCR扩增产物进行检测:
[0021]采用引物对6Sam72772F/6Sam72772R进行PCR扩增,得到PCR扩增产物时,当所述PCR扩增产物中具有DNA片段大小在126bp,核苷酸序列如SEQ IDNO:5所示时,待测高粱感丝黑穗病或疑似感丝黑穗病;当所述PCR扩增产物中具有DNA片段大小在122bp,核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示时,待测高粱抗丝黑穗病或疑似抗丝黑穗病;
[0022]采用引物对Tx430508F/Tx430508R进行PCR扩增,得到扩增产物时,当所述PCR扩增产物中具有一个DNA片段大小在720bp,核苷酸序列如SEQ IDNO:7所示时,待测高粱抗丝黑穗病或疑似抗丝黑穗病;当所述PCR扩增产物中不含有720bp的DNA片段时,待测高粱感丝黑穗病或疑似感丝黑穗病。
[0023]本专利技术实施例还提供了一种上述分子标记在鉴定或辅助鉴定高粱抗或感丝黑穗病、筛选或辅助筛选抗丝黑穗病或疑似抗丝黑穗病高粱品种、培育抗丝黑穗病或疑似抗丝黑穗病高粱品种上的应用。
[0024]本专利技术实施例还提供了一种上述引物组在鉴定或辅助鉴定高粱抗或感丝黑穗病、筛选或辅助筛选抗丝黑穗病或疑似抗丝黑穗病高粱品种、培育抗丝黑穗病或疑似抗丝黑穗病高粱品种上的应用。
[0025]本专利技术实施例还提供了一种上述试剂盒在鉴定或辅助鉴定高粱抗或感丝黑穗病、筛选或辅助筛选抗丝黑穗病或疑似抗丝黑穗病高粱品种、培育抗丝黑穗病或疑似抗丝黑穗病高粱品种上的应用。
[0026]本专利技术实施例开发了与高粱抗丝黑随病相关的分子标记6Sam72772和分子标记Tx430508,实验证明,这两个分子标记均可以准确鉴定或辅助鉴定高粱抗或感丝黑穗病,具有快速、低成本以及限制少等特点,可供提高育种效率,具有重大的应用价值。
附图说明
[0027]图1为本专利技术实施例提供的采用分子标记6Sam72772鉴定59个高粱自然群体种质的聚丙烯酰胺凝胶凝胶电泳结果(第一泳道13

9未点上);
[0028]图2为本专利技术实施例提供的采用分子标记Tx430508鉴定59个高粱自然群体种质的琼脂糖凝胶电泳结果;
[0029]图3为本专利技术实施例提供的采用分子标记6Sam72772鉴定部分回交后代F2的聚丙烯酰胺凝胶电泳结果。
具体实施方式
[0030]为了使本专利技术的目的、技术方案及优点更加清楚明白,以下结合附图及实施例,对本专利技术进行进一步详细说明。应当理解,此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本专利技术,并不用于限定本专利技术。
[0031]以下结合具体实施例对本专利技术的具体实现进行详细描述。
[0032]下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法,按照本领域内的文献所描述的技术或条件或者按照产品说明书进行,下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到;
[0033]下述实施例中的2
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种鉴定高粱抗或感丝黑穗病的分子标记,其特征在于,包括分子标记6Sam72772和/或Tx430508;其中,所述分子标记6Sam72772可为126bp的DNA片段和122bp的DNA片段,所述126bp的DNA片段,其核苷酸序列如SEQ ID:5所示,所述122bp的DNA片段,其核苷酸序列如SEQ ID:6所示;所述分子标记Tx430508为720bp的DNA片段,其核苷酸序列如SEQ ID:7所示。2.一种鉴定高粱抗或感丝黑穗病分子标记的引物组,其特征在于,包括针对分子标记6Sam72772的引物和/或针对分子标记Tx430508的引物;其中,所述针对分子标记6Sam72772的引物:引物6Sam72772F:5
’‑
GTAGAGAAGAGAATTGGGAGC
‑3’
;引物6Sam72772R:5
’‑
AATGTGGTGAAGTTTGCTCT
‑3’
;所述针对分子标记Tx430508的引物:引物Tx430508F:5
’‑
ATGTTTCAAACTGCTATGGT
‑3’
;引物Tx430508R:5
’‑
TTACCTATCAACTATGGTGAC
‑3’
。3.一种鉴定高粱抗或感丝黑穗病的试剂盒,其特征在于,包括权利要求2所述的分子标记的引物组。4.一种鉴定高粱抗或感丝黑穗病的方法,其特征在于,包括以下步骤:1)提取待检测高粱的基因组DNA...

【专利技术属性】
技术研发人员:白春明陆晓春朱振兴王平李金红丛玲刘轶飞
申请(专利权)人:辽宁省农业科学院
类型:发明
国别省市:

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