一种基于失调调控关系的个性化病前状态识别方法技术

本发明专利技术属于生物信息学领域，公开了一种基于失调调控关系的个性化病前状态识别方法，包括以下步骤：S1：计算每个时间点调控关系的调控强度；S2：计算调控关系每个时间点调控强度的变化分数；S3：计算每个时间点个体的调控变化分数；S4：确定特定疾病病前状态相关失调调控标志物；S5：基于疾病病前状态相关失调调控标志物识别疾病病前状态。本发明专利技术提供的技术方案在识别疾病病前状态方面有很高的精度，可以确定一组特定疾病固定的失调调控关系标志物，具有临床实施意义；计算过程简单，计算耗时少。计算耗时少。计算耗时少。

【技术实现步骤摘要】
一种基于失调调控关系的个性化病前状态识别方法


[0001]本专利技术属于生物信息学领域，具体涉及一种基于失调调控关系的个性化病前状态识别方法。

技术介绍

[0002]疾病的发生与发展遵循复杂系统中的分叉理论，会在一个时间点出现突然的恶化，所以疾病发展的过程可以被分为三个阶段：正常、病前、疾病。如果能够在健康恶化之前，识别出病前状态，然后给予正确的治疗，将会极大的促进现代医学的发展。但是，目前病前状态的识别还存在以下问题。首先，疾病的发生与发展往往是多个异常基因与生物分子相互作用的结果，同一疾病对于不同的个体在分子层面存在很大的异质性。其次，病前状态的识别需要观察一个个体时序发展的分子数据，成本较大。所以，目前相关临床数据稀少，且一个个体的时序数据在每个时间点只有一个样本。为了基于这些单样本的数据个性化识别病前状态，研究人员提出了一些解决方法。但是，当前方法主要关注的是基因表达的时序变化以及基因间共表达关系的变化。另外，现有的方法对于同一疾病不同的个体识别出的相关病前状态标志物是不一致的。

技术实现思路

[0003]鉴于现有问题，本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种基于失调调控关系的个性化病前状态识别方法，其特征在于，包括以下步骤：S1：计算每个时间点调控关系的调控强度；S2：计算调控关系每个时间点调控强度的变化分数；S3：计算每个时间点个体的调控变化分数；S4：确定特定疾病病前状态相关失调调控标志物；S5：基于疾病病前状态相关失调调控标志物识别疾病病前状态。2.根据权利要求1所述的基于失调调控关系的个性化病前状态识别方法，其特征在于，所述步骤S1具体为：根据一时间点每个调控关系包含的两个基因的表达值，该时间点调控关系的调控强度为：其中，g
i
和g
j
为该时间点每个调控关系包含的两个基因的表达值。3.根据权利要求2所述的基于失调调控关系的个性化病前状态识别方法，其特征在于，所述步骤S2通过公式：d
ij
(t)＝|r
ij
(t)
‑
r
ij
(t0)|计算所述调控关系每个时间点调控强度的变化分数；其中，d
ij
(t)表示时间点t时刻包含基因i与基因j的调控关系的调控强度相对于正常状态的变化分数；r
ij
(t)与r
ij
(t0)分别表示该调控关系在t时刻与正常...

【专利技术属性】
技术研发人员：许鹏，霍彦好，鲍振申，李先彬，刘文斌，
申请(专利权)人：广州大学，
类型：发明
国别省市：