一种预测头颈部鳞癌化疗药效的试剂盒及其应用制造技术

本发明专利技术涉及检测脂代谢基因表达量的试剂在制备预测头颈部鳞癌化疗药效预后模型的试剂盒中的应用，所述的脂代谢基因基因选自如下8个基因的组合：ACSBG2、APOB、IKBKB、MAPK9、MOGAT2、PLA2G10、PIK3R3和SREBF1。本发明专利技术还提供了一种预测头颈部鳞癌化疗药效预后的模型和试剂盒，根据8个基因表达量并结合临床信息构建了预测模型，提供了适当的评估和选择标准，模型的风分数＝(

【技术实现步骤摘要】
一种预测头颈部鳞癌化疗药效的试剂盒及其应用


[0001]本专利技术涉及试剂盒
，具体地说，是关于一种预测头颈部鳞癌化疗药效的试剂盒及其应用。

技术介绍

[0002]头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)是一组发生于头颈部的恶性肿瘤，约占头颈部肿瘤的90％。HNSCC包含颈部肿瘤、口腔颌面部肿瘤及耳鼻喉科肿瘤，多发生于女性。在每年确诊的患者中，约有60％为局部晚期阶段，在世界范围内，有超过85万人被诊断为头HNSCC，每年有44万人因此死亡，虽然HPV(Human Papilloma virus,人乳头瘤病毒)阳性的HNSCC患者预后较好，OS(Overall Survival,总体生存率)为70％，但III
‑
IV期患者仍存在广泛的局部侵袭和治疗失败，5年预后不良的OS约为40％。HNSCC的治疗根据病理特征或临床分期不同而不同，包括手术治疗、同步放化疗、靶向治疗和免疫治疗。然而，因广泛的组织切除、重建以及放化疗的副作用引起的吞咽和呼吸功能受损严重影响了HNSCC患者的生活质量和生存率。
[0003]随着免疫检查抑制剂的出现，全身系统性治疗在头颈部肿瘤中的作用也在不断增加，HNSCCs的总生存率得到了较大大的提高。对化疗(顺铂为主要用药的一线化疗药物)敏感的患者不仅拥有保住喉器官的机会，更能获得更好的总体生存和生活质量。然而，大多数HNSCCs患者是在晚期才被诊断出来的，即使制定了个性化的综合治疗方案，仍然会出现治疗失败的情况。治疗失败最常见的原因便是对药物产生了耐药性。现有的治疗手段在铂类耐药后选择有限，除PD
‑
1/PD
‑
L1(Programmed Cell Death 1/Programmed Cell Death 1Ligand 1,程序性死亡受体1/细胞程序性死亡
‑
配体1)、EGFR(Epidermal growth factor receptor,表皮生长因子受体)外，可选择的靶向药物寥寥无几。因此，在明确诊断后能较早地预测以化疗为基础的系统性治疗在HNSCC中的疗效具有重要的价值。识别潜在的关键耐药分子和机制也将为HNSCC患者综合治疗方案的制定和新药研发提供重要的参考基础。
[0004]由于代谢重塑是癌症的重要特征之一，其在HNSCC中的也发挥着越来越重要的作用。除了Warburg效应和谷氨酰胺代谢外，脂代谢重塑对HNSCC肿瘤细胞的增殖、转移和复发的也有很大影响。大多数脂质代谢酶在HNSCC中表达升高，并与不良预后相关。但是其对HNSCC全身系统性用药的影响和潜在作用仍缺乏研究。所以本专利技术针对脂质代谢重塑对HNSCC全身系统性用药的影响进行分析并构建了一个脂代谢特征预后模型(LMRS模型)。
[0005]而目前关于如本专利技术构建的脂代谢特征预后模型还未见报道。

技术实现思路

[0006]本专利技术的第一个目的是，针对现有技术中的不足，提供一种预测头颈部鳞癌化疗药效的试剂盒。
[0007]本专利技术的第二个目的是，提供检测脂代谢基因表达量的试剂在制备预后模型试剂盒中的应用。
[0008]本专利技术的第三个目的是，提供一种预测头颈部鳞癌化疗药效的预后模型系统。
[0009]为实现上述第一个目的，本专利技术采取的技术方案是：
[0010]一种预测头颈部鳞癌化疗药效预后模型的试剂盒，所述试剂盒包括检测脂代谢基因表达量的试剂和脂代谢特征风险评分。
[0011]更优选地，所述脂代谢基因为以下8个基因的组合：ACSBG2、APOB、IKBKB、MAPK9、MOGAT2、PLA2G10、PIK3R3、SREBF1。
[0012]更优选地，所述试剂盒为包含脂代谢特征的风险评分：风险分数＝(
‑
2.7486)*ACSBG2+(1.7158)*APOB+(
‑
0.3216)*IKBKB+(0.4612)*MAPK9+(
‑
0.8421)*MOGAT2+(0.6413)*PLA2G10+(
‑
0.2157)*PIK3R3+(
‑
0.2355)*SREBF1。
[0013]为实现上述第二个目的，本专利技术采取的技术方案是：
[0014]检测脂代谢基因表达量的试剂在制备预测头颈部鳞癌化疗药效预后模型的试剂盒中的应用，所述的脂代谢基因为以下8个基因的组合：ACSBG2、APOB、IKBKB、MAPK9、MOGAT2、PLA2G10、PIK3R3、SREBF1，所述的预后模型为包含脂代谢特征的风险评分：风险分数＝(
‑
2.7486)*ACSBG2+(1.7158)*APOB+(
‑
0.3216)*IKBKB+(0.4612)*MAPK9+(
‑
0.8421)*MOGAT2+(0.6413)*PLA2G10+(
‑
0.2157)*PIK3R3+(
‑
0.2355)*SREBF1。
[0015]为实现上述第三个目的，本专利技术采取的技术方案是：
[0016]一种预测头颈部鳞癌化疗药效的预后模型系统，所述的系统包括信息获取、计算风险评分以及预后评估。
[0017]更优选地，所述的信息获取为获取各头颈部鳞癌患者的基因表达信息。
[0018]更优选地，所述的风险评分是将脂代谢mRNA表达量代入预后模型公式计算出风险分数值。
[0019]更优选地，所述的预后评估是根据风险分数对患者进行分组，低评分组中值为
‑
2.15128，高评分组中值为
‑
1.09682。
[0020]更优选地，所述的预后模型系统还可用于预测免疫细胞浸润度和免疫检查点表达。
[0021]本专利技术优点在于：
[0022]1、更好地了解HNSCC中异质性来源及其相互关系是头颈部肿瘤学的关键目标，对诊断与治疗具有广泛的意义。
[0023]2、我们的专利技术进一步支持脂质代谢重塑，尤其是脂肪酸相关代谢对HNSCC患者的生存预后，尤其是对全身系统性治疗的反应具有重要参考价值，综合危险评分、年龄、性别、肿瘤分期、病理分型和吸烟情况，模型获得令人满意的效果。其兼具短期和中期的诊断价值，相较常用的临床指标，如性别、年龄表现出更好的诊断阈值。
[0024]3、本专利技术建立的模型检测面板提供了适当的评估和选择标准，以尽可能地筛选出可以从全身系统性治疗获得最大好处的患者，并允许不太可能受益的患者快速过度到其他疗法。
附图说明
[0025]附图1为本方法的的设计流程图。
[0026]附图2为CRISPR/cas9文库筛选后脂质相关基因显著富集结果。
[0027]附图3为利用脂质代谢基因分类HNSCC全身治疗患者预后结果。
[0028]附图4为8个脂质相关基因的诊断预后模型建立及评价。
[0029]附图5为各基因预后及DCA诊断曲线评估结果。
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种预测头颈部鳞癌化疗药效预后模型的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括检测脂代谢基因表达量的试剂和脂代谢特征风险评分。2.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，所述脂代谢基因为以下8个基因的组合：ACSBG2、APOB、IKBKB、MAPK9、MOGAT2、PLA2G10、PIK3R3和SREBF1。3.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，所述脂代谢特征风险评分的风险分数＝(
‑
2.7486)*ACSBG2+(1.7158)*APOB+(
‑
0.3216)*IKBKB+(0.4612)*MAPK9+(
‑
0.8421)*MOGAT2+(0.6413)*PLA2G10+(
‑
0.2157)*PIK3R3+(
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0.2355)*SREBF1。4.检测脂代谢基因表达量的试剂在制备预测头颈部鳞癌化疗药效预后模型的试剂盒中的应用，其特征在于，所述的脂代谢基因为以下8个基因的组合：ACSBG2、APOB、IKBKB、MAPK9、MOGAT2、PLA2G10、PIK3R3和SREBF1，所述预后模型为包含脂代谢特征的风险评分：风险分数＝(
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【专利技术属性】
技术研发人员：苗湘琬，向明亮，叶斌，范翠，丁锐，
申请(专利权)人：上海交通大学医学院附属瑞金医院，
类型：发明
国别省市：