病理学明场像中的自动化染色查找制造技术

病理学明场像中的自动化染色查找。在一个实施方案中，接收包括一种或多种染色的样本的图像。针对所述图像中的多个像素中的每一个，确定所述像素的光密度矢量。所述光密度矢量包括所述一种或多种染色中的每一种的值，并且表示光密度空间中的点，所述光密度空间具有等于所述一种或多种染色的数目的维数。将所述光密度矢量从所述光密度空间变换成更低维空间中的表示。所述更低维空间具有等于所述光密度空间的所述维数减一的维数。基于所述表示来识别与所述一种或多种染色中的每一种相对应的光密度矢量。密度矢量。密度矢量。

【技术实现步骤摘要】
病理学明场像中的自动化染色查找
[0001]本申请是申请人为徕卡生物系统公司、申请日为2016年9月16日、申请号为201680053670.7、专利技术名称为“病理学明场像中的自动化染色查找”的分案申请。


[0002]本文描述的实施方案总体涉及自动化染色查找，并且更具体地，涉及病理学明场像中的染色查找。

技术介绍

[0003]为了产生准确的结果，量化图像中染色的量的数字病理学算法需要每种染色的光密度值。传统上，光密度值是从用单染色着色的载片获得，由用户通过颜色挑选工具手动选择多染色图像中的每种染色的最纯像素来获得，或者从参考数据库选择每种染色的光密度值来获得。这些方法中的每一种都具有显著的缺点。
[0004]例如，单染色法要求分离地对来自同一组织的另外的样本进行着色(例如，针对三种分离的染色具有三个另外的样本)。这大大增加了所要求的劳动和时间的量。
[0005]使用颜色挑选工具(例如，新墨西哥州Corrales的Indica实验室的ImageScope Eyedropper Tool
TM<br/>)手动选择单本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于分析从一图像采集设备获得的一组织样本的一图像的系统，所述图像包括多个像素且所述组织样本具有一种或多种染色，所述系统包括：一存储器经配置以存储从所述图像采集设备获得的所述组织样本的所述图像；以及至少一个硬件处理器联接到所述存储器，且经配置以：接收所述组织样本的所述图像，所述图像包括造成不准确的光密度的离群像素，针对所述图像中的多个像素中的每一个：将所述像素的一颜色值与第一阀值进行比较，所述第一阀值朝向亮度频谱的纯黑色端，将所述像素的所述颜色值与第二阀值进行比较，所述第二阀值朝向所述亮度频谱的纯白色端，所述第二阀值大于所述第一阀值，确定所述像素的所述颜色值是否小于所述第一阀值或大于所述第二阀值，以及将所述颜色值小于所述第一阀值或大于所述第二阀值的每一像素从进一步分析中排除；确定未被排除的每一像素的光密度，其中所述光密度包括所述一种或多种染色中的每一种的光密度值，根据未被排除的每一所述像素的所述光密度，识别所述一种或多种染色中的每一种的光密度；对未被排除的每一所述像素的所述光密度进行归一化；计算所述光密度的均值，其中，当所述一种或多种染色的数目是大于等于二，所述至少一个硬件处理器还经配置以：针对未被排除的每一所述像素的所述光密度，通过从所述光密度减去所计算均值来对所述光密度进行中心化；以及根据所述一种或多种染色的识别光密度，量化所述一种或多种染色中的每一种的量。2.如权利要求1所述的系统，其中，当所述一种或多种染色的所述数目是二，每一所述像素的所述光密度表示光密度空间中的点，所述光密度空间是二维的，所述至少一个硬件处理器还经配置以：将所述归一化且中心化的未被排除的每一所述像素的所述光密度变换成一维空间中的线段；以及识别与所述线段的每个端点相对应的光密度；其中，识别所述一种或多种染色中的每一种的光密度还根据与所述线段的每个端点相对应的所述光密度。3.如权利要求1所述的系统，其中，当所述一种或多种染色的所述数目是三，每一所述像素的所述光密度表示光密度空间中的点，所述光密度空间是三维的，所述至少一个硬件处理器还经配置以：将所述归一化且中心化的未被排除的每一所述像素的所述光密度变换成二维空间中的三角形；以及识别与所述三角形的每个顶点相对应的光密度；其中，识别所述一种或多种染色中的每一种的光密度还根据与所述三角形的每个顶点相对应的所述光密度。4.如权利要求3所述的系统，其中，所述至少一个硬件处理器还经配置以：
将所述归一化且中心化的未被排除的每一所述像素的所述光密度变换成所述二维空间中的点；计算所述二维空间中的所述点的凸包；以及确定所述三角形为以最小面积的界定所述凸包的三角形。5.如权利要求3所述的系统，其中，所述至少一个硬件处理器还经配置以：将所述归一化且中...

【专利技术属性】
技术研发人员：华特，
申请(专利权)人：徕卡生物系统公司，
类型：发明
国别省市：