用于捕获分子靶标的液滴内表面工程制造技术

技术编号:35680867 阅读:15 留言:0更新日期:2022-11-23 14:23
本发明专利技术涉及用于捕获分子靶标的液滴内表面工程。具体地,本发明专利技术涉及一种用于捕获存在于油包水乳液的水相中的分子靶标的方法,所述方法基于使用结合系统,所述结合系统包含(a)在亲水头部基团上带有功能性组成部分的表面活性剂,和(b)充当所述功能化的表面活性剂与所述分子靶标之间的分子订书钉的化学探针,所述化学探针包含至少两个不同结构域,即(i)至少一个捕获组成部分,其能够特异性结合所述分子靶标,和(ii)至少一个结合结构域,其能够通过共价或非共价相互作用直接地或通过结合中间体与所述表面活性剂的功能基团相互作用。间体与所述表面活性剂的功能基团相互作用。间体与所述表面活性剂的功能基团相互作用。

【技术实现步骤摘要】
用于捕获分子靶标的液滴内表面工程
[0001]本申请是国际申请日2017年4月4日、国际申请号 PCT/EP2017/058035于2018年11月8日进入中国国家阶段、申请号 201780028636.9、专利技术名称“用于捕获分子靶标的液滴内表面工程”的申请的分案申请。


[0002]本专利技术涉及基于液滴的系统中、优选是微流体系统中的界面化学,更具体来说涉及允许目标分子的特异性相互作用和捕获的界面。

技术介绍

[0003]微流体技术中的微液滴提供了在其中物质或反应可以被分开的区室。通常,利用微流体两相流中的毛细不稳定性,将一个相的微液滴产生在另一个不混溶相中。向任一或两个所述相添加表面活性剂使所述微液滴对聚结稳定,并允许它们作为分立的微型反应器起作用。
[0004]范围广泛的化学和生物反应可以在水性微液滴内部进行,包括例如DNA/RNA扩增(Mazutis等,A.D.Lab Chip,2009,9,2665

2672; Mazutis等,Anal.Chem.,2009,81(12),4813

4821)、体外转录/翻译 (Courtois等,Chembiochem.,2008,9(3),439

446)、酶催化(Baret 等,Lab Chip,2009,9(13),1850

1858)和基于细胞的测定法 (Clausell

Tormos等,Chem.Biol.,2008,15(8),427
>‑
437;Brouzes等, Proc.Natl.Acad.Sci.USA,2009,106(34),14195

14200)。微液滴的微小尺寸——体积为1皮升至1纳升——便于极高的通量(104个样品/ 秒)和大大减少的试剂消耗。
[0005]最近,已设计了功能化的表面活性剂,用于将目标分子集中在液滴界面处。已执行了His标签结合化学,以设计允许蛋白质特异性吸附在液滴内界面处的功能化的表面活性剂(Kreutz等,2009,J.Am.Chem. Soc.131,6042

6043)。然而,这种方法限于捕获带有His标签的重组蛋白。
[0006]此外,即使在吸附之后,液滴内部的反应或物质的表征也可以受到所述液滴中存在的分子的多样性以及它们的潜在相互作用的限制。
[0007]因此,对用于从复杂介质捕获目标分子靶标并适合于微流体技术的新方法,存在着需求。

技术实现思路

[0008]本专利技术提供了一种新的方法,所述方法在使用包含(a)在亲水头部基团上带有功能性组成部分的表面活性剂和(b)化学探针的结合系统的基础上,用于捕获存在于油包水乳液的水相中的分子靶标。
[0009]第一方面,本专利技术涉及一种用于捕获分子靶标的方法,所述方法包括:
[0010]a)提供油包水乳液液滴,所述乳液液滴在所述液滴的界面处包含功能化的表面活性剂,所述功能化的表面活性剂包含连接到功能化的亲水头部的至少一个亲脂尾部;
[0011]b)将所述功能化的表面活性剂与存在于或添加到所述液滴的水相中的化学探针接触,所述化学探针包含至少(i)一个能够特异性结合到分子靶标的捕获组成部分,和至少(ii)一个能够直接或间接结合到所述功能化的表面活性剂的结合结构域;以及
[0012]c)将所述功能化的表面活性剂与存在于或添加到所述液滴的水相中的所述分子靶标接触,
[0013]由此将所述分子靶标捕获在所述乳液液滴的内界面处,并且其中步骤b)和c)同时或以任何次序顺序进行。
[0014]通过(i)所述化学探针与所述功能化的表面活性剂的直接或间接结合和(ii)所述化学探针与所述分子靶标的特异性结合,将所述分子靶标捕获在所述乳液液滴的内界面处。所述功能化的表面活性剂可以在亲水头部基团上包含一个或多个功能性组成部分。所述化学探针可以与存在于所述功能化的表面活性剂的亲水头部中的一个或多个所述功能性组成部分直接或间接地相互作用。
[0015]优选地,本专利技术的方法使用微流体系统来执行。
[0016]所述方法还可以包括反转所述油包水乳液液滴的相,由此产生水包油乳液液滴并将被捕获的分子靶标暴露在所述乳液液滴的外表面处。
[0017]所述方法也可以进一步包括回收、检测和/或定量被捕获的分子靶标的步骤。
[0018]优选地,所述分子靶标是蛋白质或核酸。
[0019]优选地,所述化学探针的捕获组成部分选自所述分子靶标的抗体、镜像异构适体(spiegelmer)、肽适体、适体、配体或底物,能够杂交所述分子靶标的核酸,以及能够结合所述分子靶标的受体片段。
[0020]在优选实施方式中,所述功能化的表面活性剂是二嵌段或三嵌段表面活性剂。
[0021]所述化学探针可以通过共价或非共价相互作用、优选地通过共价相互作用结合所述功能化的表面活性剂。
[0022]所述化学探针可以通过共价相互作用直接结合所述功能化的表面活性剂。优选地,所述表面活性剂的功能化的亲水头部和所述化学探针的结合结构域各自带有能够通过点击反应或生物偶联反应来一起反应的反应性化学组成部分。
[0023]或者,所述化学探针可以通过结合中间体结合所述功能化的表面活性剂。优选地,所述表面活性剂的功能化的亲水头部和所述结合中间体各自带有能够通过点击反应或生物偶联反应来一起反应的反应性化学组成部分。
[0024]特别地,所述点击反应可以选自铜催化的叠氮化物

炔烃偶极环加成(CuAAC)、环张力促进的炔烃

叠氮化物环加成(SPAAC)、使用四嗪和具有环张力的炔烃或烯烃的狄尔斯

阿尔德反应、四嗪

异腈环加成、硫醇

烯烃点击反应例如马来酰亚胺

半胱氨酸环加成、以及悉尼酮
ꢀ‑
炔烃环加成,优选为环张力促进的炔烃

叠氮化物环加成(SPAAC)。
[0025]所述化学探针可以通过非共价相互作用直接地或通过结合中间体结合所述功能化的表面活性剂。特别地,所述化学探针与所述功能化的表面活性剂之间的非共价相互作用可以依赖于亲和系统或蛋白质标签。
[0026]在一些实施方式中,所述分子靶标来自于包封在所述液滴内的生物实体,并且所述方法任选地包括裂解所述实体以释放出所述分子靶标。
[0027]优选地,每个乳液液滴包含单个遗传元件或生物实体。
[0028]第二方面,本专利技术还涉及一种用于按照本专利技术的方法捕获分子靶标的试剂盒,其包含:
[0029]‑
功能化的表面活性剂,其包含连接到功能化的亲水头部的至少一个亲脂尾部;和
[0030]‑
化学探针,其包含至少(i)一个能够特异性结合到分子靶标的捕获组成部分,和至少(ii)一个能够直接或间接地结合到所述功能化的表面活性剂的结合结构域本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种功能化的表面活性剂,其包含式(Ib)的组成部分或由式(Ib)的组成部分构成:其中:

a和b是独立地选自1至5的整数,

每个LIPO是亲脂尾部,其独立地选自任选地被一个或多个杂原子中断并任选地被选自C1‑
C3烷基、卤素如F、Cl或Br、

OH、

OMe和

CF3的一个或多个基团取代的饱和或不饱和烃链,全氟聚醚链,全氟化碳链及其组合,

HYDRO是亲水头部,其包含独立地选自二吗啉磷酸酯基团、聚醚、聚醚胺、聚甘油及其组合的组成部分,

每个FUNCT是功能性组成部分,其包含选自以下的基团:生物素、链亲合素、亲和素、以及能够通过点击化学或通过生物偶联反应产生共价键的化学反应性基团例如叠氮基或炔基,并且

一方面LIPO和HYDRO,另一方面HYDRO和FUNCT,直接连接或通过接头基团或连接物连接。2.权利要求1的功能化的表面活性剂,其中:

每个LIPO包含下述组成部分(L1)或由下述组成部分(L1)构成:其中n是25至45、优选地35至40的整数,并且

HYDRO包含一个或多个聚乙二醇链,其包含2至30个、优选地2至10个单体。3.权利要求1

2任一项的功能化的表面活性剂,其包含:

一个或两个LIPO,其包含式(L1)的组成部分或由式(L1)的组成部分构成:其中n是25至45的整数,以及

HYDRO,其带有至少一个式(H2)的组成部分
其中d是1至12的整数。4.权利要求3的功能化的表面活性剂,其具有以下各式之一:

其中e是1至12的整数,并且X1和Y1独立地选自NH、CH2和O;

其中Y2和Y3独立地选自NH、CH2或O,并且X2、X3和X4独立地选自CH和N,以及

其中οX2、X3和X4独立地选自CH和N,οY8是CH或N,οY4、Y5、Y6和Y7独立地选自NH、O和CH2,并且οe1和e2是独立地选自1至12的整数,其中L1和H2如权利要求3中所定义。5.权利要求3或4的功能化的表面活性剂,其选自:
其中n是25至45、优选地35至40的整数,并且d是1至12、优选地2至6的整数。6.权利要求1

2任一项的功能化的表面活性剂,其是式(Ic)的表面活性剂:其中LIPO、HYDRO和FUNCT如权利要求1

2任一项中所定义,并且a是1、2或3。7.权利要求6的功能化的表面活性剂,其是式(II)的二嵌段表面活性剂:其中:

n是25至45、优选地35至40的整数,

p和q是独立地选自1至10、优选地2至8的整数,

Y1和Y2选自

O



NH2、

C(=O)

、OC(=O)、(C=O)O、NHC(=O)、C(=O)NH、NHC(=O)NH、NHC(=O)O和OC(=O)NH,并且

FUNCT包含选自生物素、叠氮基和炔...

【专利技术属性】
技术研发人员:阿兰
申请(专利权)人:法国国家科学研究中心化学前沿国际研究中心
类型:发明
国别省市:

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