基于外周血ctDNA水平预测DLBCL初治患者预后的装置及计算机可读存储介质制造方法及图纸

本发明专利技术公开了诊断领域基于外周血ctDNA水平预测DLBCL初治患者预后的装置及计算机可读存储介质。本发明专利技术采用靶向区域的NGS方法检测DLBCL患者接受一线标准治疗2周期后的外周血ctDNA中188个与淋巴瘤密切相关基因的突变情况，计算出血浆ctDNA的含量，发现治疗2个周期后的血浆ctDNA含量与患者的临床预后显著相关。本发明专利技术根据ctDNA含量的高低，可以对患者进行预后分层，建立了一种无创、简便易行的预测DLBCL初治患者预后的装置，可在治疗早期识别出可能不能从一线化疗中获益的患者，为临床医生进行治疗方案的调整提供参考信息，有助于推动恶性淋巴瘤个体化治疗的发展。动恶性淋巴瘤个体化治疗的发展。

【技术实现步骤摘要】
基于外周血ctDNA水平预测DLBCL初治患者预后的装置及计算机可读存储介质


[0001]本专利技术涉及诊断领域，具体涉及基于外周血ctDNA水平预测DLBCL初治患者预后的装置及计算机可读存储介质。

技术介绍

[0002]弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）是非霍奇金淋巴瘤（NHL）最常见的亚型，在临床和生物学上具有高度异质性。随着标准R
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CHOP（利妥昔单抗、环磷酰胺、阿霉素、长春新碱和强的松）治疗方案的应用，DLBCL患者的生存率在过去20年中显著提高。尽管如此，30%~40%的患者仍经历复发或难治。因此，对DLBCL患者进行更好的风险分层和预后判定并制定个性化的治疗策略是非常重要的。到目前为止，如何识别高危患者以改善预后仍然是一个挑战，传统的预后分层手段结果都不太令人满意。国际预后指数（IPI）是目前DLBCL患者最常用的预后工具，根据临床参数将患者分为高低不同的风险组，但研究表明并未能有效改善患者的生存，临床实用性受限。据报道，依赖组织活检揭示的分子特征是良好的预后生物标志物，但它具有有创性，且受限于取样偏差。因此，本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.预测或辅助预测弥漫性大B细胞淋巴瘤患者预后的装置，其特征在于：所述装置包括数据接收模块和数据处理模块；所述数据接收模块被配置为接收待测弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的外周血的白细胞的基因组DNA的测序数据和外周血血浆中cfDNA的测序数据及外周血血浆中cfDNA的含量，所述数据处理模块用于将所述测序数据和所述外周血血浆中cfDNA的含量转换为所述待测弥漫性大B细胞淋巴瘤患者预后的风险值，根据所述风险值预测或辅助预测所述待测弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的预后；所述风险值为待测弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的外周血中ctDNA含量。2.根据权利要求1所述的装置，其特征在于：所述外周血为所述待测弥漫性大B细胞淋巴瘤患者治疗期间的外周血。3.根据权利要求1或2所述的装置，其特征在于：所述数据处理模块包括如下模块：A1）cfDNA的体细胞突变数据的获得模块：用于对所述白细胞的测序数据和所述cfDNA的测序数据进行变异分析，获得所述cfDNA的体细胞突变数据；A2）ctDNA含量计算模块：用于根据所述体细胞突变数据计算得到所述患者血浆体细胞突变的平均突变频率；用所述平均突变频率和所述外周血血浆中cfDNA的含量的乘积除以3.3得到单位体积血浆中的单倍染色体当量值，所述单倍染色体当量值为所述外周血中ctDNA含量。4.获取弥漫性大B细胞淋巴瘤患者外周血血浆中ctDNA的含量的方法，其特征在于：所述方法包括获取待测弥漫性大B细胞淋巴瘤患者外周血白细胞的基因组DNA的测序数据和外周血血浆中cfDNA的测序数据及外周血血浆中cfDNA的含量，对所述白细胞的测序数据和所述cfDNA的测序数据进行变异分析，获得所述cfDNA的体细胞突变数据；根据所述体细胞突变数据计算得到所述患者血浆体细胞突变的平均突变频率；用所述平均突变频率和所述外周血血浆中cfDNA的含量的乘积除以3.3得到单位体积血浆中的单倍染色体当量值，所述单倍染色体当量值为所述外周血中ctDNA含量。5.存储有计算机程序的计算机可读存储介质，所述计算机程序使计算机执行...

【专利技术属性】
技术研发人员：马同辉，王晓娟，王春阳，朱建华，赵丹丹，李伟，杨全玉，
申请(专利权)人：北京泛生子基因科技有限公司，
类型：发明
国别省市：