一种细胞外RNA文库的构建方法及其应用技术

技术编号:35054577 阅读:40 留言:0更新日期:2022-09-28 10:59
本发明专利技术提供了一种细胞外RNA文库的构建方法及其应用,涉及高通量测序以及文库构建技术领域。本发明专利技术的细胞外RNA文库的构建方法包括:(a)裂解体液样本;(b)加入含有标签序列的磁珠捕获样本中的RNA;(c)逆转录;(d)以第一链cDNA为模板,合成第二链cDNA;(e)获得的第二链cDNA经去核糖体RNA后PCR富集获得全转录组检测文库。该方法专门针对细胞外RNA的检测,不需要提取RNA,不需要通过特异性磁珠捕获mRNA的3

【技术实现步骤摘要】
一种细胞外RNA文库的构建方法及其应用


[0001]本专利技术涉及高通量测序以及文库构建
,尤其是涉及一种细胞外RNA文库的构建方法及其应用。

技术介绍

[0002]细胞外RNA(extracellular RNA,exRNA)最早在血浆和血清中被发现,由于细胞外间隙以及体液中存在RNA酶,exRNA的发现并没有引起科学界的关注,当时人们普遍认为exRNA无法稳定存在。直到2006年和2007年,两项开创性的工作分别证明RNA存在于微囊泡(microvesicles)和外泌体(exosomes)中,这些RNA可以被分泌到细胞外,作为信号分子影响受体细胞的行为。这个过程既可以发生在邻近的细胞之间,又能进行长距离的调控。这两项工作揭开了exRNA研究的序幕,也为探索细胞间的信号转导开辟了新的视角。随后,exRNA被发现存在于几乎所有的生物体液(body fluids)中,包括血液、唾液、尿液、母乳、脑脊液、羊水、腹水、胆汁以及胸腔积液中。高通量测序的结果也表明,除了mRNA以外,exRNA还包含多种非编码的RNA类型,如miRNA、piRNA本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种细胞外RNA文库的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:(a)裂解体液样本;(b)加入含有标签序列的磁珠捕获所述体液样本中的RNA;(c)逆转录;(d)以第一链cDNA为模板,合成第二链cDNA;(e)获得的第二链cDNA经去核糖体RNA后进行PCR富集获得全转录组检测文库。2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,使用裂解液裂解体液样本,所述裂解液主要包含以下成分:80~120mM的Tris

HCl;体积浓度0.8%~1.2%的LiDS;450~550mM的LiCl;以及7.5~15mM的DTT,质量体积分数4

6%的Ficoll。3.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,步骤(b)中,含有标签序列的磁珠包括5

通用接头序列

barcode

TTTTTTTTTTTTTTTTNNNNN+N
‑3’
、、5

通用接头序列

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TTTTTTTTTTTTTTTTVN
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、5

通用接头序列

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NNNNNN/SpC6/、5

通用接头序列

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【专利技术属性】
技术研发人员:杨学敏张燕菲
申请(专利权)人:广州表观生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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