一种快速准确评估大水面生态渔业资源多样性的方法技术

本发明专利技术涉及大水面生态渔业资源评估的技术领域，尤其涉及一种快速准确评估大水面生态渔业资源多样性的方法，包括以下步骤：采样点位布设、样品采集、环境DNA提取与扩增、高通量测序和宏条码检测与渔业资源多样性分析，本发明专利技术能够快速、准确评估大水面生态渔业资源多样性，有效解决了传统的鱼类监测方法具有的生态破坏性、且对调查者专业形态学知识要求高、调查工作量大等问题。查工作量大等问题。

【技术实现步骤摘要】
一种快速准确评估大水面生态渔业资源多样性的方法


[0001]本专利技术涉及大水面生态渔业资源评估的
，尤其涉及一种快速准确评估大水面生态渔业资源多样性的方法。

技术介绍

[0002]大水面渔业在我国水产养殖领域具有重要地位，其面积、产量分别占全国淡水渔业的46％、15.42％。然而，当前大水面渔业面临着投苗靠经验和缺乏有效生态调控的问题可能导致水库、湖泊生态失衡，甚至蓝藻爆发等问题。而大水面生态渔业生产过程中无论是合理投苗还是生态调控，都需要快速、准确的评估渔业资源多样性。当前，大水面生态渔业资源评估主要采用现场捕捞和形态学鉴定，不仅费时费力而且准确度不高，难以快速准确评估渔业资源多样性。

技术实现思路

[0003]本专利技术的目的是为了解决
技术介绍
中存在的缺点，而提出的一种快速准确评估大水面生态渔业资源多样性的方法。
[0004]为达到以上目的，本专利技术采用的技术方案为：一种快速准确评估大水面生态渔业资源多样性的方法，包括以下步骤：采样点位布设、样品采集、环境DNA提取与扩增、高通量测序和宏条码检测与渔业资源多样性分析。
[0005]优选的，采样点位布设应该选取水库/湖泊典型水域5个以上采集样品。
[0006]优选的，典型水域包括具有异质性的水域、水库进水口、出水口、近岸和近中心区域。
[0007]优选的，样品采集的样品包括水样和沉积物样品。
[0008]优选的，采集水库中的水包括上层水，且取水量为0.5
‑
1L，现场用0.45um的混合纤维素酯膜滤膜抽滤或冷藏后24h内实验室抽滤。
[0009]优选的，沉积物样品采集中使用采泥器在采水样的地点采集沉积物，沉积物通过晒卷滤池中的大颗粒物质后分别保存于无菌的可密封广口瓶中，所述大颗粒物质包括大块石头与者植物枝干。
[0010]优选的，样品采集中采样器材每次使用前均需要清洗避免交叉感染。
[0011]优选的，环境DNA提取与扩增中分别向样品组织中加入裂解缓冲液和蛋白酶K，56℃水浴裂解后，使用DNA提取试剂盒提取水样或沉积物样品DNA；NDA提取试剂盒包括Power Water DNA提取试剂盒与 DNeasy Blood and Tissue DNA提取试剂盒中的任意一种；样品DNA 利用当地水域物种线粒体细胞色素b，12S、16S或者COI中的任意一个序列设计引物进行扩增。
[0012]优选的，高通量测序和宏条码检测：扩增后的序列经液氮冷冻后加干冰速运到生物公司进行高通量测序和宏条码检测，注释每个序列所代表的物种信息。
[0013]优选的，渔业资源多样性分析：根据比对的物种信息，进行物种相对丰富度、Alpha
多样性、Shannon
‑
Wiener指数、Simpson指数和 Chaol指数分析渔业资源多样性。
[0014]与现有技术相比，本专利技术具有以下有益效果：
[0015]本专利技术能够快速、准确评估大水面生态渔业资源多样性，有效解决了传统的鱼类监测方法具有的生态破坏性、且对调查者专业形态学知识要求高、调查工作量大等问题。
具体实施方式
[0016]以下描述用于揭露本专利技术以使本领域技术人员能够实现本专利技术。以下描述中的优选实施例只作为举例，本领域技术人员可以想到其他显而易见的变型。
[0017]一种快速准确评估大水面生态渔业资源多样性的方法，包括以下步骤：
[0018]S1、采样点位布设：选取水库/湖泊典型水域5个以上采集样品。典型水域包括具有异质性的水域、水库进水口、出水口、近岸和近中心区域。
[0019]S2、样品采集：采集水样和沉积物样品，其中：
[0020]采集水库中的水包括上层水，且取水量为0.5
‑
1L，现场用0.45um 的混合纤维素酯膜滤膜抽滤或冷藏后24h内实验室抽滤。
[0021]沉积物样品采集中使用采泥器在采水样的地点采集沉积物，沉积物通过晒卷滤池中的大颗粒物质后分别保存于无菌的可密封广口瓶中，所述大颗粒物质包括大块石头与者植物枝干。
[0022]在上述的样品采集中采样器材每次使用前均需要清洗避免交叉感染。
[0023]S3、环境DNA提取与扩增中：分别向样品组织中加入裂解缓冲液和蛋白酶K，56℃水浴裂解后，使用DNA提取试剂盒提取水样或沉积物样品DNA；NDA提取试剂盒包括Power Water DNA提取试剂盒与 DNeasy Blood and Tissue DNA提取试剂盒中的任意一种；样品DNA 利用当地水域物种线粒体细胞色素b，12S、16S或者COI中的任意一个序列设计引物进行扩增。
[0024]S4、高通量测序和宏条码检测：扩增后的序列经液氮冷冻后加干冰速运到生物公司进行高通量测序和宏条码检测，注释每个序列所代表的物种信息。
[0025]S5、渔业资源多样性分析：根据比对的物种信息，进行物种相对丰富度、Alpha多样性、Shannon
‑
Wiener指数、Simpson指数和Chaol 指数分析渔业资源多样性。
[0026]本方案能够快速、准确评估大水面生态渔业资源多样性，有效解决了传统的鱼类监测方法具有生态破坏性、且对调查者专业形态学知识要求高、调查工作量大等问题。
[0027]以上显示和描述了本专利技术的基本原理、主要特征和本专利技术的优点。本行业的技术人员应该了解，本专利技术不受上述实施例的限制，上述实施例和说明书中描述的只是本专利技术的原理，在不脱离本专利技术精神和范围的前提下本专利技术还会有各种变化和改进，这些变化和改进都落入要求保护的本专利技术的范围内。本专利技术要求的保护范围由所附的权利要求书及其等同物界定。
本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种快速准确评估大水面生态渔业资源多样性的方法，其特征在于：包括以下步骤：采样点位布设、样品采集、环境DNA提取与扩增、高通量测序和宏条码检测与渔业资源多样性分析。2.根据权利要求1所述的一种快速准确评估大水面生态渔业资源多样性的方法，其特征在于：采样点位布设应该选取水库/湖泊典型水域5个以上采集样品。3.根据权利要求2所述的一种快速准确评估大水面生态渔业资源多样性的方法，其特征在于：典型水域包括具有异质性的水域、水库进水口、出水口、近岸和近中心区域。4.根据权利要求1所述的一种快速准确评估大水面生态渔业资源多样性的方法，其特征在于：样品采集的样品包括水样和沉积物样品。5.根据权利要求4所述的一种快速准确评估大水面生态渔业资源多样性的方法，其特征在于：采集水库中的水包括上层水，且取水量为0.5
‑
1L，现场用0.45um的混合纤维素酯膜滤膜抽滤或冷藏后24h内实验室抽滤。6.根据权利要求4所述的一种快速准确评估大水面生态渔业资源多样性的方法，其特征在于：沉积物样品采集中使用采泥器在采水样的地点采集沉积物，沉积物通过晒卷滤池中的大颗粒物质后分别保存于无菌的可密封广口瓶中，所述大颗粒物质包括大块石头与者植物枝干。7.根据权利要求1所...

【专利技术属性】
技术研发人员：葛红星，董志国，尼倩，李前方，窦强，
申请(专利权)人：江苏海洋大学，
类型：发明
国别省市：