【技术实现步骤摘要】
裸花紫珠SSR分子标记及其核心引物对、试剂盒和应用
[0001]本专利技术涉及分子生物学
，具体涉及裸花紫珠SSR分子标记及其核心引物对、试剂盒和应用。
技术介绍
[0002]裸花紫珠为马鞭草科紫珠属植物，干燥叶入药，具有消炎、止血、抗菌、解肿毒之功效，收载于2020年版《中国药典》，也是《中国药典》2015年版增补本收录品种。裸花紫珠主产于海南、广东、广西等省份，国外主要分布于印度、越南和马来西亚。裸花紫珠中含有黄酮、苯乙醇苷、萜类等化学成分，作为国家医保乙类、中药保护品种以及多省地方的基药，其市场需求量较大，应用前景广阔。
[0003]目前药农种植的裸花紫珠均为野生驯化的栽培种，优良品种缺乏的现状仍未改变，裸花紫珠产业的品种需求与种质资源发掘利用明显滞后的矛盾突出。裸花紫珠种质资源群体变异丰富，不同产地的裸花紫珠有效成分差异较大，且品质性状均为数量性状，由多基因控制，易受环境影响。因此，建立一套简便、快速、可靠的裸花紫珠种质资源鉴定技术体系应用于育种和品种鉴定，对于提高育种效率，加快育种进程，保障裸花紫珠产业的健康快速发展等具有重要意义。
[0004]SSR分子标记技术以其多态性高、重复性好、检验简便等优点，在种质资源分子标记研究中应用广泛。目前于福来等对裸花紫珠进行了基因组调研及SSR特征分析，提示裸花紫珠为高杂合、高重复的复杂基因组，研究发现单、双、三核苷酸重复基序占比较高。彭云露等对6份不同地区的裸花紫珠进行了转录组测序，同时开发了部分SSR标记，但标记的多样性较差，22对标记引物中只...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种裸花紫珠SSR分子标记，其特征在于，包括14个SSR分子标记，具体包括：
其中，n≥5。2.一种裸花紫珠SSR分子标记的核心引物对，其特征在于，包括使用权利要求1的SSR分子标记扩增出的引物对：所述针对SSR分子标记LHZZCnH147扩增的引物序列(5'
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3')为：F:CCGAGGCAAAGTTCCAACCA；R:CCACTGATAAACCAACGAGCC；所述针对SSR分子标记LHZZCnH138扩增的引物序列(5'
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3')为：F:GGCTGTGGTCCAAGAAAGGT；R:AGAAGTTACAGAGCCAAACCA；所述针对SSR分子标记LHZZCnH182扩增的引物序列(5'
‑
3')为：F:ATCTCTGTCTCACAAGCGCC；R:CACCGGAACCCTGCATGTAA；所述针对SSR分子标记LHZZCnH107扩增的引物序列(5'
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3')为：F:ACGCCTTCCATTATGCACGA；R:GCCCGAGTTTGTAGTGGTGA；所述针对SSR分子标记LHZZCnH220扩增的引物序列(5'
‑
3')为：F:CCCAAGAAGAGCTGTCCACA；R:CCTCAGCATGCAGAAACTGG；所述针对SSR分子标记LHZZCnH205扩增的引物序列(5'
‑
3')为：F:GGTATGTCTCATGTCGCCGA；
R:TTGCGTTCACGATGCTTTGG；所述针对SSR分子标记LHZZCnH078扩增的引物序列(5'
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3')为：F:AGGCACCTAGCTAGACACCA；R:ACGCTCAGGTAGTTGGTGTG；所述针对SSR分子标记LHZZCnH275扩增的引物序列(5'
‑
3')为：F:GAGGCTGGTTTGGAGTGGAA；R:TGTGTCCAAAGGCATCGTGA；所述针对SSR分子标记LHZZCnH080扩增的引物序列(5'
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3')为：F:ACATCCGGTGCATCCTTTCT；R:TTCCTTCAAGCACCTGTCCC；所述针对SSR分子标记LHZZCnH357扩增的引物序列(5'
‑
3')为：F:CCCACCAGTGAAAGGCTTCT；R:CGATGTGGGCTGTGATCGTA；所述针对SSR分子标记LHZZCnH155扩增的引物序列(5'
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3')为：F:CACAGAAACAACACGGCCAG；R:GCGTTTCGACTGCATTCGAT；所述针对SSR分子标记LHZZCnH305扩增的引物序列(5'
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3')为：F:CAGCGC...
【专利技术属性】
技术研发人员：黄梅，于福来，李鑫，陈振夏，张红瑞，胡璇，王凯，王丹，陈晓鹭，谢小丽，官玲亮，
申请(专利权)人：中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所，
类型：发明
国别省市：
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