【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于在复杂生物学或环境样品中鉴定化合物的方法和系统
专利
[0001]本专利技术属于代谢组学领域,其特征是在复杂生物学或环境样品中,比如血浆、尿、组织和废水中分析代谢物和小有机分子。
[0002]专利技术背景
[0003]具有很高分辨率(>40,000FWHM)和质量精确度(<1
‑
5ppm)的现代质谱仪称为HRMS("高分辨率质谱法"的首字母缩写),其非常快速地(数毫秒)施行质量扫描(在MS1或"完全扫描"模式中)从而在复杂生物学或环境样品中分析电离的化合物产生的离子。
[0004]在高分辨率质谱仪与分离技术耦合(称为"联用的MS")例如与液相色谱法耦合(LC
‑
HRMS,"液相色谱法
‑
高分辨率质谱法")或毛细管电泳耦合(CE
‑
HRMS,"毛细管电泳
‑
高分辨率质谱法")用于非靶向代谢组学实验的情况下,原始数据矩阵在复杂样品的情况下能够含有数万或数十万个数据点(也称为扫描)。
[0005] ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.用于在复杂生物学或环境样品中鉴定化合物的方法,特征在于其包括:从施用至样品的与分离技术联用的质谱法分析接收(102)质谱(1),其中所述质谱(1)包含多个数据点(2),所述数据点具有保留时间(RT)、测量质荷比(m/z)和所测信号的强度信息;查阅(104)分子式数据库(10),其包括多个分子式和电离加合物的分子离子的理论质荷比(m/z)
T
;对于质谱(1)的各数据点(2),在注释数据库(12)中注释(106)分子式和电离加合物的组合,其理论质荷比(m/z)
T
在考虑给定质量误差的情况下相应于所述数据点(2)的测量质荷比(m/z),其中各注释包括数据点(2)的保留时间(RT)和所测信号的强度;对于注释数据库(12)中注释的各分子式和电离加合物,检测(108)在保留时间范围(RT0‑
RT1)中定义的关注区,其中所注释的数据点符合表征标准;产生(110)包含列表(14),其包括所检测的关注区的保留时间范围(RT0‑
RT1)和与各关注区关联的分子式和电离加合物的理论质荷比(m/z)
T
;并且将包含列表发送(112)至质谱仪用于通过串联质谱法鉴定样品中的化合物。2.权利要求1的方法,其包括在质谱(1)中检测与所注释的分子式和/或电离加合物关联的同位素类似物,其中同位素类似物的检测包括:在各关注区(28)的保留时间范围(RT0‑
RT1)中搜寻(162)质谱(1)的数据点(2),其测量质荷比(m/z)在考虑质量误差的情况下相应于与关注区(28)关联的分子式和/或电离加合物的同位素类似物的理论质荷比(m/z)
T
;获得(164)所发现的数据点的所测信号的强度;起始自相应于分子式和/或电离加合物的关注区(28)的数据点的所测信号的强度,计算(166)所发现的数据点的理论强度;将测量强度与计算理论强度比较(168);基于所述比较确定(170)同位素类似物的检测。3.前述权利要求中任一项的方法,其中关注区的检测(108)包括:确定(122)在保留时间范围(RT
C0
‑
RT
C1
)中定义的候选区(20),其具有最少个数的数据点和/或最小密度的注释数据点;表征(124)候选区(20),获得表征参数(22);并且选择(128)表征参数(22)符合某些表征标准的那些候选区(20)作为关注区。4.权利要求3的方法,其中候选区(20)的表征(124)包括从候选区(20)中的注释数据点(2)计算(132)线性回归(24)的斜率(m);并且其中表征标准包括验证(142)计算斜率(m)的绝对值大于阈值斜率(m
min
)。5.权利要求3至4中任一项的方法,其中候选区(20)的表征(124)包括从候选区(20)中的注释数据点(2)计算(134,136)所测信号的平均强度(I
avg
)和/或最大强度(I
max
);并且其中表征标准包括验证(144...
【专利技术属性】
技术研发人员:罗杰,
申请(专利权)人:佩雷威尔吉利健康研究所基金会罗维拉威尔吉利大学罗杰,
类型:发明
国别省市:
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