【技术实现步骤摘要】
一种快速高效提取大熊猫粪便微生物DNA的方法
[0001]本专利技术涉及细菌DNA提取
,尤其涉及一种快速高效提取大熊猫粪便微生物DNA的方法。
技术介绍
[0002]动物肠道正常菌群中的菌类,因其能产生乳酸,所以归属于乳酸菌类。屎肠球菌是一种益生菌,对维持动物肠道菌群生态平衡起到重要作用。
[0003]由于动物粪便复杂,不仅含有肠道微生物、未消化的食物、消化酶、黏液、胆盐、胆红素等,且食草动物粪便内还存在大量植物多糖等,常规的抽提方法得到的粪便DNA中常伴有共纯化的DNA聚合酶抑制物,对PCR反应有强烈的抑制作用。
[0004]目前国际上一般使用试剂盒抽提粪便DNA,但是价格不菲,因而,分子粪便学的发展需要一种经济而实用的试验方法,对目标DNA成功地进行了PCR扩增和序列测定,为此,我们提出一种快速高效提取大熊猫粪便微生物DNA的方法。
技术实现思路
[0005]本专利技术主要是解决上述现有技术所存在的技术问题,提供一种快速高效提取大熊猫粪便微生物DNA的方法。
[0006]为 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种快速高效提取大熊猫粪便微生物DNA的方法,包括以下工作步骤:第一步:取样与保存;第二步:粪便DNA提取与纯化;第三步:DNA样品质量检测;第四步:PCR扩增;第五步:PCR产物的纯化及序列测定;第六步:粪便DNA模板中背景DNA的检测。2.根据权利要求1所述的一种快速高效提取大熊猫粪便微生物DNA的方法,其特征在于:所述第一步,采集新鲜的大熊猫粪便和大熊猫粪便表面富含黏膜部分,使用2倍体积的100%乙醇保存。3.根据权利要求1所述的一种快速高效提取大熊猫粪便微生物DNA的方法,其特征在于:所述第二步,提取大熊猫粪便中的DNA,制成DNA溶液并保存。4.根据权利要求1所述的一种快速高效提取大熊猫粪便微生物DNA的方法,其特征在于:所述第三步,吸出适量第二步中所得DNA溶液,用NanoDrop检测DNA浓度,较纯的DNA样品A260/A280比值在1.8左右,低于1.5说明样品不纯,含蛋白质较多。5.根据权利要求1所述的一种快速高效提取大熊猫粪便微生物DNA的方法,其特征在于:所述第四步,使用抽提到的DNA模板﹐对大熊猫线粒体基因组不同片断进行扩增,扩增体系:10
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Buffer5ul,4uldNTP(10mmol),4HlMgCl2(20mmol),Taq酶1.25ul,引物各1ul,BSA(1mg/ml)5u1,1
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5u1模板DNA,使用超纯水将反应体系补至50ul。6.根据权利要求5所述的一种快速高效提取大熊猫粪便微生物DNA的方法,其特征在于:所述第四步,循环条件为:95℃预变性4min,95℃变性30s,54
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【专利技术属性】
技术研发人员:李锋,徐忠鲜,张泽均,胡杰,洪明生,杨艳,周琳,
申请(专利权)人:西华师范大学,
类型:发明
国别省市:
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