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使用靶向核酸酶调节微生物群的组成制造技术

技术编号:34596525 阅读:37 留言:0更新日期:2022-08-20 08:57
本文提供了用于重塑复杂的微生物群体的组合物和方法。RNA引导的核酸酶系统被改造为靶向所靶向的原核生物的染色体DNA中的位点,其中可以在混合的原核生物群体中调节所靶向的原核生物的水平。的原核生物的水平。的原核生物的水平。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】使用靶向核酸酶调节微生物群的组成
[0001]相关申请本申请要求于2019年9月30日提交的美国临时申请号62/908,130、以及于2019年10月1日提交的美国临时申请号62/909,078、以及于2020年7月16日提交的美国临时申请号63/052,825的优先权权益,所述美国临时申请各自的整体内容通过引用并入本文。
[0002]序列表本申请包含序列表,所述序列表已经由EFS

Web以ASCII格式提交,并且在此通过引用以其整体并入。于2020年9月29日创建的ASCII副本命名为P19

171_WO

PCT_SL.txt且大小为51,634字节。


[0003]本公开内容涉及用于重塑微生物群的组成的组合物和方法。

技术介绍

[0004]控制微生物群体的组成和表达的功能是医学、生物技术和环境循环的关键方面。虽然经典的抗微生物策略提供了一些控制,但仍然难以捉摸的是通用且可编程的策略,其可以区分甚至密切相关的微生物,并且允许对微生物群体的组成的精细控制。最近的进展指示了本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种蛋白质

核酸复合物,其包含与细菌或古细菌物种的染色体缔合的改造的RNA引导的核酸酶系统,其中所述改造的RNA引导的核酸酶系统靶向微生物的染色体中的位点,并且所述微生物的染色体编码HU家族DNA结合蛋白,其包含与SEQ ID NO: 1具有至少50%序列同一性的氨基酸序列。2.权利要求1的蛋白质

核酸复合物,其中所述改造的RNA引导的核酸酶系统是选自I型CRISPR系统、II型CRISPR系统、III型CRISPR系统、IV型CRISPR系统、V型CRISPR系统或VI型CRISPR系统的CRISPR系统。3.权利要求2的蛋白质

核酸复合物,其中所述CRISPR系统包含CRISPR核酸酶和引导RNA。4.权利要求3的蛋白质

核酸复合物,其中所述CRISPR核酸酶是Cas9、Cas12、Cas13或CasX。5.权利要求1至4中任一项的蛋白质

核酸复合物,其中所述改造的RNA引导的核酸酶系统由核酸表达,所述核酸编码改造的RNA引导的核酸酶系统,并且整合到细菌或古细菌染色体内。6.权利要求1至4中任一项的蛋白质

核酸复合物,其中所述改造的RNA引导的核酸酶系统由核酸表达,所述核酸编码改造的RNA引导的核酸酶系统,并且在染色体外载体上携带。7.权利要求1至6中任一项的蛋白质

核酸复合物,其中所述原核染色体在拟杆菌属(Bacteroides)物种内。8.权利要求7的蛋白质

核酸复合物,其中所述拟杆菌属物种选自多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)、普通拟杆菌(Bacteroides vulgatus)、解纤维素拟杆菌(B.cellulosilyticus)、脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)、溃疡拟杆菌(B. helcogenes)、卵形拟杆菌(B. ovatus)、萨氏拟杆菌(B. salanitronis)、单形拟杆菌(B. uniformis)或解木糖拟杆菌(B. xylanisolvens)。9.一种用于减缓混合的原核生物群体中的靶原核生物生长的方法,所述方法包括在靶原核生物中表达改造的RNA引导的核酸酶系统,其中所述改造的RNA引导的核酸酶系统靶向靶原核生物的染色体中的位点,使得将至少一个双链断裂引入靶原核生物的染色体中,从而减缓所述靶原核生物的...

【专利技术属性】
技术研发人员:E
申请(专利权)人:华盛顿大学
类型:发明
国别省市:

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