一种基于lncRNA测序的玉米耐盐基因发现方法及其应用技术

本发明专利技术涉及植物遗传技术领域，尤其涉及一种基于lncRNA测序的玉米耐盐基因发现方法及其应用，以玉米耐盐自交系LH196为材料，对其开展盐胁迫及对照下的链特异性转录组测序、lncRNA测序及靶基因预测，通过二者联合分析初步确定耐盐候选基因，并对耐盐差异基因进行RT

A method for discovering salt tolerant genes in Maize Based on lncrna sequencing and its application

【技术实现步骤摘要】
一种基于lncRNA测序的玉米耐盐基因发现方法及其应用


[0001]本专利技术涉及植物遗传
，尤其涉及一种基于lncRNA测序的玉米耐盐基因发现方法及其应用。

技术介绍

[0002]玉米是全球最重要的粮食作物，提供了超过一半的卡路里消耗，然而未来玉米的供应遭受多方面的威胁，至2050年玉米产量需要加倍才能满足人们日益增长的需求，粮食安全问题日趋紧张。此外，多种环境因素也在威胁未来玉米的供应，盐胁迫是其中一种影响玉米生长和产量的重要因素。全球有大约4.15
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108公顷土地受盐胁迫影响，我国也有将近1亿公顷土地为盐碱地，约占全国土地面积的10％，是重要的后备土地资源。培育耐盐玉米种质能够充分利用这部分土地，也是保障未来粮食安全的重要举措。而培育耐盐玉米种质的成效取决于对玉米耐盐基因资源的挖掘和玉米耐盐遗传机制的充分了解。
[0003]长链非编码RNA(long non
‑
coding RNA,lncRNA)是一类在不同物种中具有低序列保守性的转录物，长度超过200个核苷酸，并且没有蛋白质编码能力。已发现植物lncRNA可作为转录调节因子或是具有功能的lncRNA直接或间接参与到植物的春化作用、逆境胁迫、生殖发育、开花时间调控、木材形成、果实成熟及光形态建成等生物学过程，对植物生长发育起到重要作用；lncRNA能调控很多抗盐基因，如：和离子运输相关的HKT1和NHX基因，而且具有很高的组织特异性。因此，本申请拟对玉米盐胁迫下的lncRNA及其靶基因开展鉴定，并对其进行功能分析，发掘玉米耐盐基因。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的是为了解决现有技术中存在的缺点，而提出的一种基于lncRNA测序的玉米耐盐基因发现方法及其应用。
[0005]为了实现上述目的，本专利技术采用了如下技术方案：
[0006]一种玉米耐盐基因，所述玉米耐盐基因为玉米耐盐基因Zm00001d010406，且玉米耐盐基因Zm00001d010406位于8号染色体。
[0007]优选地，所述玉米耐盐基因Zm00001d010406的cDNA序列信息如下：
[0008]>Zm00001d010406_T001 Zm00001d010406_T001 cdna Length:5684bp ATGGGGATGGGGCGATTTGTAAGCCCAATCTTTTATTTATTCAGGTTTGAACCGTACTTGAGGAATGCATGCAAGAGGTTTGCGTTGGAGCACCGGGCTGGCGAGAACCGTGCCCCGCTCATCTCAGATGATAGCCCCAACAAAGATATCAACATTGCTTTCTATAACATCCCGATGCTGAAAAAACTGAGAGAGCTTGGGACAGCCGAAATTGGTAAGCTCACATCAGTAATGGGTGTTGTGACACGGACAAGTGAAGTGCGGCCTGAACTATTGCAAGGAACCTTCAAATGTCTCGACTGTGGGAATGTTGTGAAGAATGTGGAGCAGCAGTTCAAGTACACTGAGCCGATAATATGCGTTAATGCAACATGCCAGAACAGAACAAAATGGGCCCTTCTTCGTCAGGAAAGCAAATTCACAGATTGGCAGCGGGTCAGAATGCAGGAGACATCAAAAGAGATACCCGCTGGGTCACTTCCTCGTTCCCTTGATGTCATTCTGCGGCATGAGATTGTTGAGAAGGCCAGAGCTGGGGACACGGTTATATTTACTGGAACTGTTGTTGCAGTTCCTGATGTTATGGCACTAACTTCACCTGGCGAACGAGCAGAGT
GTCGCAGGGAAGCTCCTCAGCGAAAAAACGGAGGTGTTCAAGAAGGTGTAAAGGGCTTGAAGTCCCTTGGAGTTAGGGATCTGTCTTATCGCCTTGCCTTTGTAGCAAATTCAGTGCAGGTCGCAGATGGTAGGAGAGAAGTGGACATCAGGGAACGGGACACAGATGGTGATGACAGTGAGAGACAGAAATTCACAGAAGAAGAGGAAGATGAAGTTGTTAGGATGAGGAACACTCCTGATTTCTTTAATAAGATAGTTGATAGCATATGTCCTACCGTATTTGGTCATCAAGAAATTAAGAGGGCCGTGCTTCTTATGCTTTTGGGTGGTGTTCATAAGATAACACATGAAGGGATCAACCTTAGAGGTGACATCAATGTCTGTATTGTTGGTGACCCAAGCTGTGCAAAGTCTCAGTTCCTAAAATATACTGCTGGTATTGTTCCAAGATCTGTTTACACGTCAGGGAAGTCATCATCAGCTGCTGGTCTGACAGCAACTGTTGCTAAAGAACCAGAGACTGGTGAATTCTGTATTGAGGCTGGTGCCCTGATGCTAGCTGATAATGGTGTTTGTTGTATCGATGAATTTGATAAAATGGACATTAAGGATCAGGTCGCTATACATGAAGCAATGGAACAGCAAACAATTAGCATTACCAAAGCAGGAATACAGGCAACTTTGAATGCACGAACATCAATTTTAGCTGCAGCAAATCCGACCGGAGGCCGTTATGACAAGTCAAAACCACTTAAGTACAATGTTGCATTGCCCCCAGCTATTCTTTCAAGATTTGATCTGGTCTACATCATGATCGATGAACCTGATGAAAACACTGACTACCACATTGCTCATCACATTGTAAGAGTCCATCAGAAACGTGAAGAAGCACTTGCCCCTGCATTTAGCACCGCACAACTGAAGCGTTATATTTCTTTTGCAAAATCTTTGAAACCTCAGCTTAGTTCAGAAGCAAAGAAAGTTCTGGTGGAGTCGTATGTTACGCTTCGTAGGGGGGACAGTACTCCTGGAACTAGGGTTGCTTATAGGATGACAGTTCGGCAATTGGAAGCATTGATTCGGCTGTCAGAAGCTATTGCTCGAAGCCATTTAGAAAGAGTTGTAAGTATATTAATTCACTTTATCGTGGATCATGTTCTCCCAGCTCATGTCCGCCTGGCAGTTAAATTGCTCAAGACATCCATCATCAGTGTTGAGTCAAGTGAAGTTGATCTCTCTGACTTCCAAGATGCTGAAGATGGAACAAATGTACCTTCTGAGAGTGACGCCGGACAGCCAGCTGAAGAAGATGCTGCTCCTCAGCAGCAGGGTGCAGAAAATGACCAAGCAGCGGATAATGGTA本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种玉米耐盐基因，其特征在于，所述玉米耐盐基因为玉米耐盐基因Zm00001d010406，且玉米耐盐基因Zm00001d010406位于8号染色体。2.根据权利要求1所述的一种玉米耐盐基因，其特征在于，所述玉米耐盐基因Zm00001d010406的cDNA序列信息如下：>Zm00001d010406_T001 Zm00001d010406_T001 cdna Length:5684bpATGGGGATGGGGCGATTTGTAAGCCCAATCTTTTATTTATTCAGGTTTGAACCGTACTTGAGGAATGCATGCAAGAGGTTTGCGTTGGAGCACCGGGCTGGCGAGAACCGTGCCCCGCTCATCTCAGATGATAGCCCCAACAAAGATATCAACATTGCTTTCTATAACATCCCGATGCTGAAAAAACTGAGAGAGCTTGGGACAGCCGAAATTGGTAAGCTCACATCAGTAATGGGTGTTGTGACACGGACAAGTGAAGTGCGGCCTGAACTATTGCAAGGAACCTTCAAATGTCTCGACTGTGGGAATGTTGTGAAGAATGTGGAGCAGCAGTTCAAGTACACTGAGCCGATAATATGCGTTAATGCAACATGCCAGAACAGAACAAAATGGGCCCTTCTTCGTCAGGAAAGCAAATTCACAGATTGGCAGCGGGTCAGAATGCAGGAGACATCAAAAGAGATACCCGCTGGGTCACTTCCTCGTTCCCTTGATGTCATTCTGCGGCATGAGATTGTTGAGAAGGCCAGAGCTGGGGACACGGTTATATTTACTGGAACTGTTGTTGCAGTTCCTGATGTTATGGCACTAACTTCACCTGGCGAACGAGCAGAGTGTCGCAGGGAAGCTCCTCAGCGAAAAAACGGAGGTGTTCAAGAAGGTGTAAAGGGCTTGAAGTCCCTTGGAGTTAGGGATCTGTCTTATCGCCTTGCCTTTGTAGCAAATTCAGTGCAGGTCGCAGATGGTAGGAGAGAAGTGGACATCAGGGAACGGGACACAGATGGTGATGACAGTGAGAGACAGAAATTCACAGAAGAAGAGGAAGATGAAGTTGTTAGGATGAGGAACACTCCTGATTTCTTTAATAAGATAGTTGATAGCATATGTCCTACCGTATTTGGTCATCAAGAAATTAAGAGGGCCGTGCTTCTTATGCTTTTGGGTGGTGTTCATAAGATAACACATGAAGGGATCAACCTTAGAGGTGACATCAATGTCTGTATTGTTGGTGACCCAAGCTGTGCAAAGTCTCAGTTCCTAAAATATACTGCTGGTATTGTTCCAAGATCTGTTTACACGTCAGGGAAGTCATCATCAGCTGCTGGTCTGACAGCAACTGTTGCTAAAGAACCAGAGACTGGTGAATTCTGTATTGAGGCTGGTGCCCTGATGCTAGCTGATAATGGTGTTTGTTGTATCGATGAATTTGATAAAATGGACATTAAGGATCAGGTCGCTATACATGAAGCAATGGAACAGCAAACAATTAGCATTACCAAAGCAGGAATACAGGCAACTTTGAATGCACGAACATCAATTTTAGCTGCAGCAAATCCGACCGGAGGCCGTTATGACAAGTCAAAACCACTTAAGTACAATGTTGCATTGCCCCCAGCTATTCTTTCAAGATTTGATCTGGTCTACATCATGATCGATGAACCTGATGAAAACACTGACTACCACATTGCTCATCACATTGTAAGAGTCCATCAGAAACGTGAAGAAGCACTTGCCCCTGCATTTAGCACCGCACAACTGAAGCGTTATATTTCTTTTGCAAAATCTTTGAAACCTCAGCTTAGTTCAGAAGCAAAGAAAGTTCTGGTGGAGTCGTATGTTACGCTTCGTAGGGGGGACAGTACTCCTGGAACTAGGGTTGCTTATAGGATGACAGTTCGGCAATTGGAAGCATTGATTCGGCTGTCAGAAGCTATTGCTCGA...

【专利技术属性】
技术研发人员：汪保华，方辉，单婷玉，李平，王凯，曹云英，韩金磊，
申请(专利权)人：南通大学，
类型：发明
国别省市：