【技术实现步骤摘要】
基于微孔恒温反应检测肠道RNA病毒核酸的引物组、试剂盒及其应用
[0001]本专利技术属于分子生物
,尤其是涉及一种基于微孔恒温反应检测肠道 RNA病毒核酸的引物组、试剂盒及其应用。
技术介绍
[0002]诺如病毒(Norovirus,NV)属于杯状病毒科诺如病毒属,无包膜单股正链的 RNA病毒。感染人的诺如病毒包括GⅠ、GⅡ、GⅣ、G
Ⅷ
及G
Ⅸ
,而最为常见的为GⅠ和GⅡ。诺如病毒是导致儿童急性病毒性腹泻的第2位病原,尚无有效的疫苗。而诺如病毒具有高变异性,对诺如病毒的检测和监测有助于诺如病毒感染的预防和控制。
[0003]甲型肝炎病毒(Hepatitis A virus,HAV)属于小核糖核酸科肝病毒属,基因组由一个7.5千碱基的无包膜单股正链RNA分子组成。甲型肝炎病毒的传播途径为粪口传播,主要通过摄入受污染的食物或水,或直接在人与人之间传播。与甲型肝炎病毒相关的食物包括牡蛎和蛤蜊、草莓等。对食品、环境、粪便等样品中的HAV 检测有助于HAV的预防和控制。
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【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.用于检测肠道RNA病毒核酸的引物组,其特征在于,选自用于检测诺如病毒GⅠ、诺如病毒GⅡ、甲型肝炎病毒、CA16或EV71的引物组中的一组或几组;其中,用于检测诺如病毒GⅠ的引物组包括检测引物Ft
‑Ⅰ
和Bt
‑Ⅰ
,Ft
‑Ⅰ
的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,Bt
‑Ⅰ
的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;用于检测诺如病毒GⅡ的引物组包括检测引物Ft
‑Ⅱ
和Bt
‑Ⅱ
,Ft
‑Ⅱ
的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示,Bt
‑Ⅱ
的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示;用于检测甲型肝炎病毒的引物组包括检测引物Ft
‑
h和Bt
‑
h,Ft
‑
h的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示,Bt
‑
h的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示;用于检测CA16的引物组包括检测引物Ft
‑
c和Bt
‑
c,Ft
‑
c的核苷酸序列如SEQ ID NO.13所示,Bt
‑
c的核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示;用于检测EV71的引物组包括检测引物Ft
‑
e和Bt
‑
e,Ft
‑
e的核苷酸序列如SEQ ID NO.17所示,Bt
‑
e的核苷酸序列如SEQ ID NO.18所示。2.根据权利要求1所述用于检测肠道RNA病毒核酸的引物组,其特征在于,用于检测肠道RNA病毒核酸的引物组,除了包括用于检测诺如病毒GΙ、诺如病毒GΠ、甲型肝炎病毒、CA16或EV71的引物组中的一组或几组作为基本检测引物以外,还包括加速引物,用于检测诺如病毒GⅠ的引物组还包括加速引物为IF
‑Ⅰ
和IB
‑Ⅰ
,IF
‑Ⅰ
的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,IB
‑Ⅰ
的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;用于检测诺如病毒GⅡ的引物组还包括加速引物为IF
‑Ⅱ
和IB
‑Ⅱ
,IF
‑Ⅱ
的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示,IB
‑Ⅱ
的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示;用于检测甲型肝炎病毒的引物组还包括加速引物为IF
‑
h和IB
‑
h,IF
‑
h的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示,IB
‑
h的核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示;用于检测CA16的引物组还包括加速引物为IF
‑
c和IB
‑
c,IF
‑
c的核苷酸序列如SEQ ID NO.15所示,IB
‑
c的核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示;用于检测EV71的引物组还包括加速引物为IF
‑
e和IB
‑
e,IF
‑
e的核苷酸序列如SEQ ID NO.19所示,IB
‑
e的核苷酸序列如SEQ ID NO.20所示。3.用于检测肠道RNA病毒核酸的的试剂盒,其特征在于,包括有检测诺如病毒GⅠ、诺如病毒GⅡ、甲型肝炎病毒、CA16或EV71的引物组中的一组或几组;其中,用于检测诺如病毒GΙ的引物组包括检测引物Ft
‑Ⅰ
和Bt
‑Ⅰ
,Ft
‑Ⅰ
的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,Bt
‑Ⅰ
的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;用于检测诺如病毒GⅡ的引物组包括检测引物Ft
‑Ⅱ
和Bt
‑Ⅱ
,Ft
‑Ⅱ
的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示,Bt
‑Ⅱ
的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示;用于检测甲型肝炎病毒的引物组包括检测引物Ft
‑
h和Bt
‑
h,Ft
‑
h的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示,Bt
‑
h的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示;用于检测CA16的引物组包括检测引物Ft
‑
c和Bt
‑
c,Ft
‑
c的核苷酸序列如SEQ ID NO.13所示,Bt
‑
c的核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示;用于检测EV71的引物组包括检测引物Ft
‑
e和Bt
‑
e,Ft
‑
e的核苷酸序列如SEQ ID NO.17所示,Bt
‑
e的核苷酸序列如SEQ ID NO.18所示。4.根据权利要求3所述用于检测肠道RNA病毒核酸的的试剂盒,其特征在于,除了包括有检测诺如病毒GⅠ、诺如病毒GⅡ、甲型肝炎病毒、CA16或EV71的引物组中的一组或几组以
外,还包括有检测诺如病毒GⅠ、诺如病毒GⅡ、甲型肝炎病毒、CA16或EV71的加速引物;用于检测诺如病毒GΙ的引物组还包括加速引物为IF
‑Ⅰ
和IB
‑Ⅰ
,IF
‑Ⅰ
的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,IB
‑Ⅰ
的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;用于检测诺如病毒GΠ的引物组还包括加速引物为IF
‑Ⅱ
和IB
‑Ⅱ
,IF
‑Ⅱ
的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示,IB
‑Ⅱ
的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示;用于检测甲型肝炎病毒的引物组还包括加速引物为IF
‑
h和IB
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