【技术实现步骤摘要】
一种乳腺癌代谢生物标志物组合及其指纹模型构建方法与应用
[0001]本专利技术涉及乳腺癌检测
,尤其涉及一种乳腺癌的血清代谢指纹图谱构建 方法及其应用。
技术介绍
[0002]乳腺癌是当前世界上最常见的癌症,全世界每年有超过1300万新病例和45万人 死亡,高性能分析化学方法对于乳腺癌的早期有效诊断和治疗至关重要。目前,临床 上对乳腺癌的诊断仍依赖于常规的组织病理学分类方法和影像学工具,如乳房X线 摄影、磁共振成像和超声等。然而,这些方法需要大型仪器或严格的操作,耗时长且 结果并不可靠。
[0003]近来,越来越多的乳腺癌研究强调了代谢组学在其早期诊断以及治疗和预后预测 中的价值,已开发出诸如核磁共振光谱(NMR)和质谱(MS)等分析技术用于癌症代谢组 的全面筛查。然而,MS在液相和气相检测中的应用依赖于通过色谱法进行样品纯化 和代谢物富集,严重限制了分析速度和分析通量。激光解吸/电离(LDI)
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MS使用纳米 颗粒基质替代色谱法进行固相检测,有助于推动乳腺癌代谢组分析。此外,使用基于 血液样 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种乳腺癌血清代谢指纹模型的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤1、预处理血清样本;步骤2、预处理无机纳米颗粒;步骤3、在质谱靶板上进行样品制备,每个稀释后的血清样本点样1μL,室温下干燥;步骤4、在质谱靶板上进行基质制备,每个基质溶液点样1μL,室温下干燥;步骤5、在纳米颗粒增强激光解吸/电离质谱仪中进行血清代谢指纹采集;步骤6、对血清代谢指纹进行机器学习。2.如权利要求1所述的乳腺癌血清代谢指纹模型的构建方法,其特征在于,步骤1具体为将血清样本用去离子水稀释10倍。3.如权利要求1所述的乳腺癌血清代谢指纹模型的构建方法,其特征在于,步骤2具体为将无机纳米颗粒用去离子水配成1mg/mL的基质溶液。4.如权利要求1所述的乳腺癌血清代谢指纹模型的构建方法,其特征在于,步骤6具体包括:步骤6.1、在MATLAB R2020a上对步骤5采集的血清代谢指纹进行预处理,得到m/z信号;步骤6.2、将指纹图谱划分成训练集和测试集;步骤6.3、在MATLAB R2020a上使用弹性网络算法在训练集上对m/z信号进行特征选择,并设置弹性网络算法中频率参数的阈值,得到m/z特征;步骤6.4、在Orange 3.25.0上使用神经网络在训练集上进行模型训练,得到模型在训练集上的诊断性能;步骤6.5、在Orange 3.25.0上使用步骤6.4中训练好的模型在测试集进行预测,得到神经网络在测试集上的诊断性能。5.如权利...
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