【技术实现步骤摘要】
一种数字PCR荧光图像的像素级别识别方法
[0001]本专利技术属于图像识别领域,涉及到一种数字PCR荧光图像的像素级别识别方法。
技术介绍
[0002]数字PCR(Polymerase Chain Reaction,PCR)是一种核酸分子绝对定量技术。数字PCR基于单分子PCR方法来进行计数的核酸定量。主要采用微流控或微滴化方法将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应腔室或微滴中,每个微反应腔室或微滴的核酸模板数不多于1个。经过PCR循环后有一个核酸分子模板的微反应腔室或微滴就会发出荧光信号,没有核酸分子模板的微反应腔室或微滴则不发出荧光信号。目前数字PCR的检测方式可分为流式检测和成像检测,流式检测通过将液滴逐个推到激光点进行照射根据是否激发出荧光值,流式检测存在液滴稳定性不足和检测用时长等问题。成像检测为检测扩增终点的数字荧光图像中荧光亮点(阳性点)的情况。快速准确地识别荧光图像中的阳性点对于保证检测的准确性非常重要。目前荧光图像分析主要包括:荧光图像去噪、荧光图像倾斜校正、荧光图像微反应腔室或微滴定位、荧光图像分割、 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种数字PCR荧光图像的像素级别识别方法,其特征在于,所述方法包括:S1,获取数字PCR荧光图像;S2,预处理数字PCR荧光图像;S3,获取荧光图像所有灰度为白色的像素点位置信息;S4,获取一个未被标记的白色像素并以该白色像素为起点;S5,获取白色像素的白色临近像素点至边缘白色像素的临近像素点均为黑色,对本次获取的白色像素标记并统计数量;S6,判断是否存在未被标记的白色像素,如存在则返回步骤S4;S7,统计每次执行步骤S5获取的白色像素数量并于预设数据对比;S8,根据对比结果,得出阳性点数量。2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述预处理数字PCR荧光图像,包括:图像去噪、图像倾斜校正、图像二值化和图像矩阵化处理。3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述获取荧光图像所有灰度为白色的像素点位置信息包括:通过图像矩阵获取荧光图像中所有灰度为白色的像素点位置信息。4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述获取任一未被标记的白色像素包括:采用顺序或随机方式获取任一未被标记的白色像素,并以该白色像素为起点。5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,获取白色像素的白色临近像素点至边缘白色像素的临近像素点均为黑色,对本次获取的白色像素标记并统计数量包括:S501,获取未被标记的白色像素并标记,若被标记的白色像素位置表示为X
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【专利技术属性】
技术研发人员:王莹,
申请(专利权)人:深圳市第二人民医院深圳市转化医学研究院,
类型:发明
国别省市:
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