本发明专利技术公开了一种病理细胞的量化方法、系统、装置及存储介质，包括：获取细胞图，并对所述细胞图进行前景和背景分割得到前景掩码图；所述前景掩码图包括细胞核和细胞质信息；对所述前景掩码图进行分割得到细胞核掩码图，根据所述前景掩码图及所述细胞核掩码图得到细胞质掩码图；根据所述前景掩码图、所述细胞核掩码图和/或所述细胞质掩码图计算细胞图的相关特征。本发明专利技术实施能够提取细胞切片图像中需要的有用信息，更好地辅助医生诊断，可广泛应用于生物信息技术领域。于生物信息技术领域。于生物信息技术领域。
【技术实现步骤摘要】
病理细胞的量化方法、系统、装置及存储介质
[0001]本专利技术涉及生物信息
，尤其涉及一种病理细胞的量化方法、系统、装置及存储介质。
技术介绍
[0002]近年，病理细胞切片数字化得到极大普及，各种辅助病理医生分析病理数字图片的技术也得到了极大的研究和应用，包括病变细胞/区域的检测、分割、分类以及切片诊断等，极大地方便了病理医生对病变细胞的分析筛查。目前病变细胞的检测、分类、切片智能诊断更多的是一种定性的分析，还没有对数字图片进行细胞量化分析，量化分析数据将会辅助病理医生更好地做出诊断。
技术实现思路
[0003]有鉴于此，本专利技术实施例的目的是提供一种病理细胞的量化方法、系统、装置及存储介质，能够提取细胞切片图像中需要的有用信息，更好地辅助医生诊断。
[0004]第一方面，本专利技术实施例提供了一种病理细胞的量化方法，包括以下步骤：
[0005]获取细胞图，并对所述细胞图进行前景和背景分割得到前景掩码图；所述前景掩码图包括细胞核和细胞质信息；
[0006]对所述前景掩码图进行分割得到细胞核掩码图，根据所述前景掩码图及所述细胞核掩码图得到细胞质掩码图；
[0007]根据所述前景掩码图、所述细胞核掩码图和/或所述细胞质掩码图计算细胞图的相关特征。
[0008]可选地，所述对所述前景掩码图进行分割得到细胞核掩码图，具体包括：
[0009]将所述前景掩码图输入到训练好的细胞核分割模型；其中，所述细胞核分割模型包括实例分割单元和语义分割单元；
[0010]通过所述实例分割单元得到所述前景掩码图的第一待定细胞核掩码图，通过所述语义分割单元得到所述前景掩码图的第二待定细胞核掩码图；
[0011]比较所述第一待定细胞核掩码图与所述第二待定细胞核掩码图中重叠的细胞核；
[0012]对于重叠的细胞核，选取所述第一待定细胞核掩码图中对应的掩码图作为第一掩码图；
[0013]对于剩余的细胞核，选取所述第二待定细胞核掩码图中对应的掩码图作为第二掩码图；
[0014]融合所述第一掩码图和所述第二掩码图得到细胞核掩码图。
[0015]可选地，所述细胞核分割模型的训练方法如下：
[0016]获取训练样本数据集，所述训练样本数据集包含细胞图样本和所述细胞图样本对应的人工标注的细胞核掩码样本；
[0017]将所述训练样本数据集分成训练集和验证集，采用所述训练集对所述细胞核分割
模型进行训练，采用所述验证集对所述细胞核分割模型进行验证；
[0018]当所述细胞核分割模型满足预设要求，停止训练。
[0019]可选地，所述对所述细胞图进行前景和背景分割得到前景掩码图，具体包括：
[0020]将所述细胞图依次进行灰度化、前景增强及上伪彩色处理得到伪彩色图；
[0021]将所述伪彩色图进行颜色分割得到前景掩码图。
[0022]可选地，所述相关特征包括细胞核分布疏密相关特征，所述细胞核分布疏密相关特征通过以下方法确定：
[0023]根据所述前景掩码图及所述细胞核掩码图计算核面积与前景面积的比例；
[0024]或根据所述前景掩码图计算粘连细胞个数和不粘连的细胞个数。
[0025]可选地，所述相关特征包括细胞核属性相关特征，所述细胞核属性相关特征通过以下方法确定：
[0026]根据所述细胞核掩码图计算细胞核总数；
[0027]或根据所述细胞核掩码图计算细胞核圆度。
[0028]可选地，所述相关特征包括模糊度相关特征，所述模糊度相关特征通过以下方法确定：
[0029]根据所述前景掩码图计算整张细胞图的模糊度；
[0030]或根据所述细胞核掩码图计算每个细胞核的模糊度。
[0031]第二方面，本专利技术实施例提供了一种病理细胞的量化装置，包括：
[0032]至少一个处理器；
[0033]至少一个存储器，用于存储至少一个程序；
[0034]当所述至少一个程序被所述至少一个处理器执行，使得所述至少一个处理器实现上述的方法。
[0035]第三方面，本专利技术实施例提供了一种存储介质，其中存储有处理器可执行的程序，所述处理器可执行的程序在由处理器执行时用于执行上述的方法。
[0036]第四方面，本专利技术实施例提供了一种病理细胞的量化系统，包括图像采集设备以及与所述图像采集设备连接的计算机设备；其中，
[0037]所述图像采集设备，用于采集病理细胞的图像，并将所述病理细胞的图像发送给所述计算机设备；
[0038]所述计算机设备包括：
[0039]至少一个处理器；
[0040]至少一个存储器，用于存储至少一个程序；
[0041]当所述至少一个程序被所述至少一个处理器执行，使得所述至少一个处理器实现上述的方法。
[0042]实施本专利技术实施例包括以下有益效果：本实施例中首先对病理的细胞图进行前景后背景分割得到前景掩码图，然后对前景掩码图再进行分割得到细胞核掩码图和细胞质掩码图，最后根据前景掩码图、细胞核掩码图和/或细胞质掩码图计算细胞图的相关特征，从而提取细胞图中需要的有用信息，更好地辅助医生诊断。
附图说明
[0043]图1是本专利技术实施例提供的一种病理细胞的量化方法的步骤流程示意图；
[0044]图2是本专利技术实施例提供的一种对细胞图进行处理得到的灰度图、增强灰度图及伪彩色；
[0045]图3是本专利技术实施例提供的一种前景掩码图、细胞核掩码图及细胞质掩码图；
[0046]图4是本专利技术实施例提供的一种细胞图及对应的人工标注的细胞核掩码图；
[0047]图5是本专利技术实施例提供的一种细胞图及对应的不同方式拟合的细胞核轮廓图；
[0048]图6是本专利技术实施例提供的一种实例分割单元的训练流程图；
[0049]图7是本专利技术实施例提供的一种细胞核分割模型的结构示意图；
[0050]图8是本专利技术实施例提供的一种通过不同方式获得的细胞核掩码图；
[0051]图9是本专利技术实施例提供的一种病理细胞的量化装置的结构框图；
[0052]图10是本专利技术实施例提供的一种病理细胞的量化系统的另一种结构框图。
具体实施方式
[0053]下面结合附图和具体实施例对本专利技术做进一步的详细说明。对于以下实施例中的步骤编号，其仅为了便于阐述说明而设置，对步骤之间的顺序不做任何限定，实施例中的各步骤的执行顺序均可根据本领域技术人员的理解来进行适应性调整。
[0054]如图1所示，本专利技术实施例提供了一种病理细胞的量化方法，其包括的步骤如下所示。
[0055]S100、获取细胞图，并对所述细胞图进行前景和背景分割得到前景掩码图；所述前景掩码图包括细胞核和细胞质信息。具体包括步骤S110
‑
120。
[0056]可选地，所述对所述细胞图进行前景和背景分割得到前景掩码图，具体包括：
[0057]S110本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种病理细胞的量化方法，其特征在于，包括：获取细胞图，并对所述细胞图进行前景和背景分割得到前景掩码图；所述前景掩码图包括细胞核和细胞质信息；对所述前景掩码图进行分割得到细胞核掩码图，根据所述前景掩码图及所述细胞核掩码图得到细胞质掩码图；根据所述前景掩码图、所述细胞核掩码图和/或所述细胞质掩码图计算细胞图的相关特征。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述对所述前景掩码图进行分割得到细胞核掩码图，具体包括：将所述前景掩码图输入到训练好的细胞核分割模型；其中，所述细胞核分割模型包括实例分割单元和语义分割单元；通过所述实例分割单元得到所述前景掩码图的第一待定细胞核掩码图，通过所述语义分割单元得到所述前景掩码图的第二待定细胞核掩码图；比较所述第一待定细胞核掩码图与所述第二待定细胞核掩码图中重叠的细胞核；对于重叠的细胞核，选取所述第一待定细胞核掩码图中对应的掩码图作为第一掩码图；对于剩余的细胞核，选取所述第二待定细胞核掩码图中对应的掩码图作为第二掩码图；融合所述第一掩码图和所述第二掩码图得到细胞核掩码图。3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述细胞核分割模型的训练方法如下：获取训练样本数据集，所述训练样本数据集包含细胞图样本和所述细胞图样本对应的人工标注的细胞核掩码样本；将所述训练样本数据集分成训练集和验证集，采用所述训练集对所述细胞核分割模型进行训练，采用所述验证集对所述细胞核分割模型进行验证；当所述细胞核分割模型满足预设要求，停止训练。4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述对所述细胞图进行前景和背景分割得到前景掩码图，具体包括：将所述细胞图依次进行灰度化、前景增强及上伪彩色处理得到伪彩色图；将所述伪彩色图进行颜色分割得到前景掩码图。5.根据权利要求1
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4...
【专利技术属性】
技术研发人员：李胜男，尚滨，彭铃淦，
申请(专利权)人：广州锟元方青医疗科技有限公司，
类型：发明
国别省市：
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