细胞通讯网络识别方法、装置、设备及存储介质制造方法及图纸

技术编号:34094231 阅读:35 留言:0更新日期:2022-07-11 21:55
本发明专利技术提供了一种细胞通讯网络识别方法、装置、设备及存储介质,涉及基因技术领域。该方法包括:获取单细胞转录组数据,单细胞转录组数据包括多个细胞,每个细胞内包括多个基因。基于基因表达水平计算单细胞转录组数据中每个细胞对之间的相关性,得到细胞相关性矩阵。基于基因调控网络计算单细胞转录组数据中细胞的细胞相似性矩阵,基因调控网络用于表示细胞中不同基因之间的相关关系。根据细胞相关性矩阵和细胞相似性矩阵,识别细胞通讯网络。由于在识别时同时考虑了细胞内基因表达和基因调控两个层面,因此能够更加准确的识别细胞通讯网络,为人类复杂疾病的细胞疗法提供技术支持。持。持。

【技术实现步骤摘要】
细胞通讯网络识别方法、装置、设备及存储介质


[0001]本专利技术涉及基因
,具体而言,涉及一种细胞通讯网络识别方法、装置、设备及存储介质。

技术介绍

[0002]在多细胞生物(例如人类)内,多个细胞往往通过互相通讯并且协调执行重要的生命活动。细胞主要有三种通讯方式:化学信号分子通讯方式、膜表面分子接触方式以及细胞间隙连接方式。细胞通讯能够影响基因表达模式以及参与生物体的发育、分化和再生等。随着单细胞转录组数据的日益增长,使得构建细胞通讯网络以及探究其在人类复杂疾病中的功能角色成为可能。
[0003]现有技术识别细胞通讯网络的解决方法,通常的做法是基于细胞内基因表达水平来衡量细胞间是否存在互作关系,进而识别细胞通讯网络。
[0004]但是,现有技术考虑的不够全面,导致无法准确的识别细胞之间的通讯网络。

技术实现思路

[0005]基于上述现有技术存在的对目标对象经常漏检的问题,本专利技术提供一种细胞通讯网络识别方法、装置、设备及存储介质,可以更加准确地识别细胞之间的通讯网络,改善现有技术考虑的不够全面,导致无本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种细胞通讯网络识别方法,其特征在于,所述方法包括:获取单细胞转录组数据,所述单细胞转录组数据包括多个细胞,每个细胞内包括多个基因;基于基因表达水平计算所述单细胞转录组数据中每个细胞对之间的相关性,得到细胞相关性矩阵;基于基因调控网络计算所述单细胞转录组数据中所述细胞的细胞相似性矩阵,所述基因调控网络用于表示所述细胞中不同基因之间的相关关系;根据所述细胞相关性矩阵和所述细胞相似性矩阵,识别细胞通讯网络。2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基于基因表达水平计算所述单细胞转录组数据中每个细胞对之间的相关性,得到细胞相关性矩阵,包括:基于基因表达水平,获取所述单细胞转录组数据中每个细胞对之间的皮尔逊相关系数值,得到所述细胞相关性矩阵。3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述基于基因调控网络计算所述单细胞转录组数据中所述细胞的细胞相似性矩阵,包括:获取所述单细胞转录组数据中的单细胞的基因调控网络;根据每个细胞对的基因调控网络,计算所述每个细胞对之间的相似性值,得到所述细胞相似性矩阵。4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述获取所述单细胞转录组数据中的单细胞的基因调控网络,包括:获取单细胞中,每两个基因之间的统计相关值并根据所述统计相关值计算所述每两个基因之间的第一显著性值;根据所述每两个基因之间的第一显著性值确定每两个基因之间的相关关系,融合所有的基因之间的相关关系得到所述单细胞的基因调控网络。5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据所述细胞相关性矩阵和所述细胞相似性矩阵,识别细胞通讯网络,包括:获取所述细胞相关性矩阵中,所述每个细胞对的第二显著性值;获取所述细胞相似性矩阵中,所述每个细胞对的第三显著性值;当一个细胞对的所述第二显著性值和所述第三显著性值均符合...

【专利技术属性】
技术研发人员:张俊鹏孙少平赵春文李司婧杨燕婷
申请(专利权)人:玉溪市人民医院
类型:发明
国别省市:

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1