免疫肽的鉴定方法、终端设备和可读存储介质技术

本申请公开了免疫肽的鉴定方法Alpha

【技术实现步骤摘要】
免疫肽的鉴定方法、终端设备和可读存储介质


[0001]本专利技术涉及生物信息学
，尤其涉及一种免疫肽的鉴定方法、终端设备和可读存储介质。

技术介绍

[0002]目前，最常见的预测鉴定新生抗原的方法是在全外显子组、转录组等基因水平上将肿瘤患者的正常细胞测序结果和肿瘤细胞测序结果比对到人类参考基因组，从比对结果中鉴定出肿瘤细胞特有的体细胞突变，再根据这些突变信息预测可能存在于肿瘤细胞表面的新生抗原。然后利用亲和力预测模型等算法分析这些预测得到的新生抗原与患者自身的I型人主要组织相容性复合体——人类白细胞抗原(human leukocyte antigen，简称HLA)的结合能力，筛选出与HLA结合能力好的新生抗原，用于肿瘤治疗。但是这类预测筛选新生抗原的方法暂未能提供直接证据来证明预测的新生抗原是否真实存在。
[0003]随着高分辨率质谱技术的发展，质谱仪扫描速度的增快，谱图数据信息的采集更全面，使直接鉴定能与HLA特异性结合的抗原表位成为可能。采用质谱技术能够通过一次实验即鉴定得到数千个MHC结合肽。目前主要通过借助理论参考谱图库对本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种免疫肽的鉴定方法，其特征在于，包括：将所述免疫肽质谱数据与蛋白库理论谱图进行匹配打分，筛选与所述免疫肽质谱数据匹配的理论谱图对应的肽段作为数据集，所述数据集中的每一条肽段具有肽段谱图匹配分值；计算所述数据集中的每一条肽段的保留时间偏差分值和离子定性特征分值；将包括所述肽段谱图匹配分值、保留时间偏差分值和离子定性特征分值在内的特征输入集成学习器模型中得到归并后的总分值；基于所述总分值计算FDR，根据FDR阈值从所述数据集中筛选得到免疫肽结果。2.根据权利要求1所述的鉴定方法，其特征在于，所述计算所述数据集中的每一条肽段的保留时间偏差分值，包括：获取所述免疫肽质谱数据中的每一条肽段的实际保留时间；计算所述数据集中的每一条肽段的预测保留时间；根据所述实际保留时间和所述预测保留时间计算得到所述保留时间偏差分值；优选地，所述保留时间偏差分值的计算公式为：其中Experimental_RT为所述实际保留时间，Predicted_RT为所述预测保留时间。3.根据权利要求2所述的鉴定方法，其特征在于，所述计算所述数据集中的每一条肽段的预测保留时间，包括：使用保留时间预测模型软件计算所述数据集中的每一条肽段的保留时间；以所述保留时间作为训练数据，利用线性模型对所述数据集进行线性预测，得到所述数据集中的每一条肽段的预测保留时间。4.根据权利要求1所述的鉴定方法，其特征在于，所述计算所述数据集中的每一条肽段的离子定性特征分值，包括：获取所述免疫肽质谱数据中的每一条肽段的实际离子集合；计算所述数据集中的每一条肽段的预测离子集合；根据所述实际离子集合和所述预测离子集合计算得到所述离子定性特征分值。5.根据权利要求4所述的鉴定方法，其特征在于，根据所述实际离子集合和所述预测离子集合计算得到所述离子定性特征分值，包括：计算所述实际离子集合和所述预测离子集合的交集数目、并集数目、差集数目、交并比作为所述...

【专利技术属性】
技术研发人员：莫凡，符芳妮，
申请(专利权)人：杭州纽安津生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：