本发明专利技术的目的是提供一种基于原位PCR技术简便、快捷克隆植物基因的方法。本发明专利技术基于原位PCR技术,采用碱溶液与表面活性剂混合作为裂解液,比较了两种碱溶液和三种表面活性剂的裂解效果,从中选出了一种最佳的裂解液条件。相比传统PCR技术通过CTAB法和SDS法的繁琐步骤去除细胞内蛋白、多糖、RNA、盐类等杂质,提纯DNA或RNA进行扩增,程序复杂、耗时长,每次提取DNA时都需要大量实验材料与接触有害试剂,无法减少耗材与人力资源,且在提取过程中会造成DNA的损伤。本研究所用的方法无需提DNA或RNA,使用少量烟草叶片与常见实验试剂,即可短时高效裂解烟草叶片内表面细胞壁,使DNA分子裸露,为分子生物学提供了简便、快捷的提取方法,更为经济、高效。高效。
【技术实现步骤摘要】
一种简易快速克隆植物基因的原位PCR技术
[0001]本专利技术涉及基因工程领域,具体涉及一种简易快速克隆植物基因的原位PCR技术。
技术介绍
[0002]原位PCR技术是指结合了传统PCR技术和原位杂交技术的原位多聚酶链式反应技术,兼有二者的优点,该实验技术可以在保持组织细胞形态结构的基础上,增加细胞膜的通透性,以细胞膜作为反应场所,通过前处理使得PCR体系中的引物、探针、酶系、游离核苷酸等进入核膜,与暴露的拟扩增目的DNA或RNA进行PCR反应,且具有较高的敏感性,可以检测出组织或细胞内的微量DNA或RNA并进行大量扩增,又可揭示出扩增的目的片段与目的组织之间的形态结构关系,具有良好的组织定位的能力。
[0003]随着原位PCR技术的广泛运用,该实验技术也在动植物方面受到人们的重视与不断完善,与此同时研究方法有着相应的提高,不同的反应条件也会影响该实验技术的成败,应根据不同的实验材料、不同类型的标本等各种因素,优化出适宜的原位PCR的实验体系,才能获得理想的结果。
技术实现思路
[0004]本专利技术的目的是提供一种基于原位PCR技术简便、快捷克隆植物基因方法。
[0005]本专利技术基于原位PCR技术,采用碱溶液与表面活性剂混合作为裂解液,比较了两种碱溶液和三种表面活性剂的裂解效果,从中选出了一种最佳的裂解液条件。相比传统PCR技术通过CTAB法和SDS法的繁琐步骤去除细胞内蛋白、多糖、RNA、盐类等杂质,提纯DNA或RNA进行扩增,程序复杂、耗时长,每次提取DNA时都需要大量实验材料与接触有害试剂,无法减少耗材与人力资源,且在提取过程中会造成DNA的损伤。本研究所用的方法无需提DNA或RNA,使用少量烟草叶片与常见实验试剂,即可短时高效裂解烟草叶片内表面细胞壁,使DNA分子裸露,为分子生物学提供了简便、快捷的提取方法,更为经济、高效。
[0006]为此本专利技术的技术方案如下:种基于原位PCR技术简便、快捷提取植物叶片内DNA或RNA方法,其特征是,将采集的植物叶片碾磨并浸泡于A液中,短暂离心后在PCR仪上95℃保持15min,取出加入等体积的B液,混匀后即可作PCR反应体系的模板。
[0007]其中A液为:50μL 1mol/L KOH溶液(或NaOH溶液),置于1.5mL Eppendorf管中,然后加入100μL 10%Triton X
‑
100溶液,加入850μL一级超纯水补足终体积至1000μL。B液:50μL含0.5mol/L Tris
‑
HCl(pH 8.0)和2mmol/L EDTA混合的TE中和液。
附图说明
[0008]图1为碱溶液优化PCR体系电泳图;
[0009]图2为表面活性剂优化PCR体系电泳图;
具体实施方式
[0010]下面以烟草的叶片作为试验材料详细说明制备方法。
[0011]实施例1
[0012]碱溶液对烟草叶片DNA的提取的影响
[0013]1烟草叶片DNA的提取
[0014]1)50μL 1.5mol/L KOH溶液,置于1.5mL Eppendorf管中,然后加入100μL 10%Triton X
‑
100溶液,加入850μL灭菌双蒸水补足终体积至1000μL;
[0015]2)用一次性刀片切取烟草的鲜嫩叶片约20mm2(4mm
×
5mm),用灭菌过的剪刀剪碎并置于0.2mL的PCR薄壁管中,向其中加入50μL裂解液,使叶片充分浸泡在裂解液中,经过短暂离心后,在PCR仪上95℃保持15min,使其皂化,裂解破碎细胞;
[0016]3)取出PCR薄壁管置于冰上,加入50μL含0.5mol/L Tris
‑
HCl(pH 8.0)和2mmol/L EDTA混合的TE中和液,混匀,可直接用作PCR反应模板。
[0017]实施例2
[0018]表面活性剂对烟草叶片DNA的提取的影响
[0019]1烟草叶片DNA的提取
[0020]2)50μL 1.5mol/L KOH溶液,置于1.5mL Eppendorf管中,然后加入100μL 6%Triton X
‑
100溶液,加入850μL灭菌双蒸水补足终体积至1000μL;
[0021]4)用一次性刀片切取烟草的鲜嫩叶片约20mm2(4mm
×
5mm),用灭菌过的剪刀剪碎并置于0.2mL的PCR薄壁管中,向其中加入50μL裂解液,使叶片充分浸泡在裂解液中,经过短暂离心后,在PCR仪上95℃保持15min,使其皂化,裂解破碎细胞;
[0022]5)取出PCR薄壁管置于冰上,加入50μL含0.5mol/L Tris
‑
HCl(pH 8.0)和2mmol/L EDTA混合的TE中和液,混匀,可直接用作PCR反应模板。
[0023]本实验PCR扩增
[0024]1)PCR体系:5μLDNA模板+12.5μLTaq PCR Master Mix+0.5μL上游引物+0.5μL下游引物+6.5μLddH2O
[0025]2)反应程序为:94℃,3min总变性后,以下设置步骤进行30个循环,94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min45s,循环反应结束后再在72℃总延伸8min,扩增产物保存于4℃冰箱。
[0026]3)引物见表1。
[0027]表1 PCR引物设计
[0028][0029]3结果检测
[0030]制得一块含琼脂糖浓度0.7%、GenGreen核酸染液2μL的凝胶,取4μLDNA Marker III作为标准分子量对照,用移液枪吸取PCR扩增产物各10μL,依次在加样口点样,设置电泳仪电压120V,电泳时间30min,254nm紫外灯下观察并拍照记录,见图1、2。
[0031]以上对本专利技术的一个实施例进行了详细说明,但所述内容仅为本专利技术的较佳实施例,不能被认为用于限定本专利技术的实施范围。凡依本专利技术申请范围所作的均等变化与改进等,均应仍归属于本专利技术的专利涵盖范围之内。
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【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种裂解液表面活性剂,Triton X
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100,其特征在于是一种比较温和的去垢剂,用作裂解液时可以提高真核细胞细胞膜的...
【专利技术属性】
技术研发人员:吴疆,周灵美,谢晓东,
申请(专利权)人:天津农学院,
类型:发明
国别省市:
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