豌豆中性SNaPshot标记及其在群体遗传多样性分析中的应用制造技术

本发明专利技术公开了一套豌豆中性SNaPshot标记及其在群体遗传多样性分析中的应用。本发明专利技术以432份豌豆种质为试验材料，通过一套豌豆中性SNaPshot标记(46个中性标记)，对豌豆进行遗传多样性和群体遗传结构分析，由于中性标记与耐热等功能基因无关，可以更好地将豌豆种质按照地理来源予以分组，且与播期类型一致度较高。实验表明，本发明专利技术的中性标记选择科学，在染色体上的分布均匀。体上的分布均匀。体上的分布均匀。

【技术实现步骤摘要】
豌豆中性SNaPshot标记及其在群体遗传多样性分析中的应用


[0001]本专利技术涉及一套豌豆中性SNaPshot标记及其在群体遗传多样性分析中的应用，属于植物遗传学


技术介绍

[0002]豌豆(Pisum sativum L.，2n＝14)是一种广泛种植于温带地区的冷季食用豆类作物，其营养价值丰富，是蛋白质、淀粉、糖类、粗纤维、维生素和低脂肪的重要来源。同时，豌豆根系中的根瘤菌可以固定大气中的氮，以便增加土壤肥力，减少环境污染。豌豆是粮、菜、饲、肥兼用的优良作物。中国的干豌豆产量居世界第三位，青豌豆产量居世界第一位，无疑是世界豌豆生产大国，但是每年仍需从加拿大等国进口大量的豌豆来满足日益增长的消费需求，因此，了解各份豌豆种质之间的遗传多样性和群体遗传关系对于豌豆遗传改良研究和在育种中选择合适的亲本至关重要。
[0003]近年来，随着单核苷酸多态性标记(SNPs)的兴起，在豌豆诸多研究领域如关联作图、全基因组关联分析(GWAS)、QTL鉴定、候选基因挖掘、遗传连锁图谱构建等得到广泛应用。 SnaPshot(微测序技术)，是由本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一套豌豆中性SNaPshot标记，其特征是，其由下表所示的46个中性SNaPshot标记组成：
2.如权利要求1所述的一套豌豆中性SNaPshot标记，其特征是，所述46个中性SNaPshot标记的外围扩增引物序列和单碱基延伸引物序列如下表所示：
3.权利要求1或2所述的一套豌豆中性SNaPshot标记在豌豆群体遗传多样性分析中的应用。4.权利要求1或2所述的一套豌豆中性SNaPshot标记在豌豆群体遗传结构分析中的应用。5.采用权利要求2所述的一套豌豆中性SNaPshot标记进行豌豆遗传多样性分析的方法，其特征是，1)SNaPshot PCR反应以待测豌豆种质群体的DNA作为PCR模板，进行外围扩增，每个位点进行单一扩增，PCR产物纯化后再采用单碱基延伸引物进行SNaPshot PCR，SNaPshot PCR反应产物通过ABI3730XL DNA分析仪进行毛细管电泳检测；2)数据分析利用Gene mapper 4.1进行SNP位点数据分析，每个样品按照SNP位点对应峰值进行基因分型，所得分析结果为Excel格式文件和PDF格式峰图；利用PowerMarker 3.25计算两组SNP标记的遗传多样性参数。6.如权利要求5所述的豌豆遗传多样性分析的方法，其特征是，所述两组SNP标记的遗传多样性参数包括基因型数NG、主要等位基因频率MAF、等位基因数NA、基因多样性GD、期望杂合度He、多态信息含量PIC。7.如...

【专利技术属性】
技术研发人员：丁汉凤，宗绪晓，王栋，杨涛，李娜娜，刘荣，张小燕，
申请(专利权)人：中国农业科学院作物科学研究所，
类型：发明
国别省市：