【技术实现步骤摘要】
核酸分子结构筛选方法及装置、计算机设备
[0001]本公开涉及生物
,特别涉及一种核酸分子结构筛选方法及装置、计算机设备。
技术介绍
[0002]核酸是细胞中的基本物质之一,预测核酸的分子结构有助于对于它们功能的研究。
[0003]相关技术提供了一种基于量子力学和分子动力学的核酸分子结构预测方法,该方法基于量子力学和分子动力学进行模拟计算,确定出多个待筛选核酸分子构型,然后根据这多个待筛选核酸分子构型的能量分布,从其中筛选出稳定性符合条件的一个或多个核酸分子构型进行研究。
[0004]但是,相关技术筛选核酸分子构型的方法主要是基于基本的核酸分子能量分布,能量分布的计算是通过物理模拟实验仿真自然世界的一种方法,物理模拟实验本身依靠数学方法来近似求解,导致筛选的结果不够精确。
技术实现思路
[0005]本公开实施例提供了一种核酸分子结构筛选方法及装置、计算机设备,能够提高核酸分子结构筛选的准确性。所述技术方案如下:
[0006]本公开至少一实施例提供了一种核酸分子结构筛选方法,所述方 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种核酸分子结构筛选方法,其特征在于,所述方法包括:获取核酸分子参数,所述核酸分子参数包括:核酸分子序列、核酸分子序列的长度、核酸分子的化学修饰、以及基于量子力学和分子动力学的计算模拟得到的多个待筛选核酸分子构型及对应的能量和实验数据;在核酸库中搜索所述多个待筛选核酸分子构型中每个核酸分子构型的相似核酸分子结构;基于所述相似核酸分子结构的稳定性、所述多个待筛选核酸分子构型对应的能量和实验数据,进行所述多个待筛选核酸分子构型概率分布计算;根据所述多个待筛选核酸分子构型概率分布,筛选所述多个待筛选核酸分子构型中稳定性符合条件的至少一个核酸分子构型。2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述在核酸库中搜索所述多个待筛选核酸分子构型中每个核酸分子构型的相似核酸分子结构,包括:将所述核酸分子序列、核酸分子序列的长度、核酸分子的化学修饰和多个待筛选核酸分子构型输入相似核酸分子搜索模型,所述相似核酸分子搜索模型用于分别确定所述核酸分子序列和所述核酸库中的各个核酸分子序列的第一相似度、确定所述核酸分子序列的长度和所述核酸库中的各个核酸分子序列的长度的差值、确定所述核酸分子的化学修饰和所述核酸库中的各个核酸分子序列的化学修饰的第二相似度,从所述核酸库中选出所述第一相似度、所述差值和所述第二相似度均满足阈值要求的核酸分子,依次确定选出的核酸分子的构型和所述多个待筛选核酸分子构型的距离,基于所述距离得到所述每个核酸分子构型的相似核酸分子结构;获取所述相似核酸分子搜索模型从核酸库中搜索到的所述多个待筛选核酸分子构型中每个核酸分子构型的相似核酸分子结构。3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基于所述相似核酸分子结构的稳定性、所述多个待筛选核酸分子构型对应的能量和实验数据,进行所述多个待筛选核酸分子构型概率分布计算,包括:将所述相似核酸分子结构的稳定性、所述多个待筛选核酸分子构型对应的能量和实验数据输入核酸分子构型概率分布计算模型,所述核酸分子构型概率分布计算模型用于通过对同一所述核酸分子构型的能量、相似核酸分子结构的稳定性和所述核酸分子构型的实验数据的归一化数值进行计算,通过所述计算得到所述每个核酸分子构型的稳定性概率;其中,所述计算过程如下:将所述核酸分子构型的能量、相似核酸分子结构的稳定性和所述核酸分子构型的实验数据的归一化数值组成一个数组,利于训练得到的稳定性概率算法对所述数组进行求解,得到所述每个核酸分子构型的稳定性概率;获取所述核酸分子构型概率分布计算模型计算出的所述多个待筛选核酸分子构型概率分布,所述多个待筛选核酸分子构型概率分布包括所述每个核酸分子构型的稳定性概率。4.根据权利要求1至3任一项所述的方法,其特征在于,所述根据所述多个待筛选核酸分子构型概率分布,筛选所述多个待筛选核酸分子构型中稳定性符合条件的至少一个核酸分子构型,包括:按照所述多个待筛选核酸分子构型的稳定性概率对所述多个待筛选核酸分子构型进
行排序,并将排名转换成第一分数;按照所述多个待筛选核酸分子构型的药物性质对所述多个待筛选核酸分子构型进行排序,并将排名转换成第二分数;综合所述第一分数和所述第二分数,从所述多个待筛选核酸分子构型中筛选出分数高的至少一个核酸分子构型。5.根据权利要求1至3任一项所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:...
【专利技术属性】
技术研发人员:谢禹鑫,陈盛培,陈婉婷,潘小瑜,
申请(专利权)人:深圳市硬核酸生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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