【技术实现步骤摘要】
大豆NLP基因的编辑位点及其应用
[0001]本专利技术涉及生物
,涉及大豆NLP基因的编辑位点,尤其涉及其大豆GmNLP4a/b、GmNLP5a/b基因编辑位点及其应用。
技术介绍
[0002]氮是植物体内的必需大量元素,是蛋白质、核苷酸的必要成分,在多方面影响着植物的代谢过程和生长发育,是植物生命活动的基础。植物获取氮的途径主要包括大气中N2的固定、土壤中N的吸收等(罗绪强等,2007)。虽然空气中含有约78.1%的N2,但是植物不能直接吸收利用,且土壤中的氮有限,不能满足植物氮的需求。为此,人们大量使用化学氮肥,以谋求植物的产量增加。氮肥的生产及运输成本昂贵,且随着氮肥使用量的增加,引发了一系列的环境问题,包括水体、大气、土壤甚至整个生态系统的氮富集污染现象,严重破坏地球的生态化学循环,影响人类健康(陆宇燕等,2014)。生物固氮,尤其是豆科植物与根瘤菌的共生固氮,是自然界中固氮效率最高(罗振鹏等,2019),降低对化学氮肥的依赖,增加植物产量最为有效的途径之一。
[0003]大豆(Glycine max ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种大豆NLP基因的编辑位点,其特征在于,所述NLP基因包括:NLP4a、NLP4b、NLP5a和NLP5b;所述NLP4a基因的基因编辑位点为:三段23个脱氧核糖核苷酸的DNA序列,核苷酸序列分别为SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4,其在大豆基因组的准确定位分别是10号染色体NLP4a基因CDS的118
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140、170
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192、235
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257处,染色体的坐标分别为46384350
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46384328、46384298
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46384276、46384233
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46384211;无效基因编辑位点为一段23个脱氧核糖核苷酸的DNA序列,核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示;所述NLP4b基因的基因编辑位点为:两段23个脱氧核糖核苷酸的DNA序列,核苷酸序列分别为SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2,其在大豆基因组的准确定位分别是20号染色体NLP4b基因CDS的112
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134、164
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186处,染色体的坐标分别为39832266
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39832288、39832318
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39832340;所述NLP5a基因的基因编辑位点为:两段23个脱氧核糖核苷酸的DNA序列,核苷酸序列分别为SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6,其在大豆基因组的准确定位分别是9号染色体NLP5a基因CDS的184
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206、678
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700处,染色体的坐标分别为34817746
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34817724、34816595
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34816573;无效基因编辑位点为两段23个脱氧核糖核苷酸的DNA序列,核苷酸序列如SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8所示;所述NLP5b基因的基因编辑位点为:两段23个脱氧核糖核苷酸的DNA序列,核苷酸序列分别如为SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6,其在大豆基因组的准确定位分别是16号染色体NLP5b基因CDS的184
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206、675
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697处,染色体的坐标分别为34544795
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34544773、34543570
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34543548。2.一种权利要求1所述大豆NLP基因的编辑位点的应用,其特征在于,所述大豆NLP基因的编辑位点3
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端含有NGG,通过sgRNA与基因组PAM位点附近的DNA碱基互补配对,介导Cas9核酸内切酶靶向识别基因组并实现基因组DNA的双链断裂,诱发DNA损伤修复机制,在修复过程中随机引入或删除核苷酸对,导致目标靶点核苷酸对的删除或插入,造成目标靶点附近的突变。3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,用于培育改变结瘤性状和/或产量的大豆突变体。4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,具体包括以下步骤:(1)按照SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:8的大豆NLP4a/b、NLP5a/b基因编辑位点的序列合成sgRNA;(2)在SEQ ID NO:1sgRNA的5
’
端添加碱基接头,获得SEQ ID NO:9的正向核苷酸序列引物,将其反向互补得到sgRNA的反向序列,在其5
’
端同样添加碱基接头,获得SEQ ID NO:10的反向核苷酸序列引物;将SEQ ID NO:9与SEQ ID NO:10退火,形成双链DNA;将SEQ ID NO:2sgRNA反向后在5
’
端添加碱基接头,获得SEQ ID NO:11的正向核苷酸序列引物,将其反向互补得到sgRNA的反向序列,在其5
’
端同样添加碱基接头,获得SEQ ID NO:12的反向核苷酸序列引物;将SEQ ID NO:11与SEQ ID NO:12退火,形成双链DNA;将SEQ ID NO:3sgR...
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