一种联合多个mRNA预测胆管癌复发的方法及其应用技术

技术编号:33422796 阅读:17 留言:0更新日期:2022-05-19 00:14
本发明专利技术涉及预测胆管癌术后复发风险的分子模型的构建及其应用评估。具体地,本发明专利技术发现了一种生物标志物集合,所述的集合包括多种CCA手术及化疗治疗后复发的生物标志物,可以用于评估CCA患者术后复发的风险,具有高灵敏性、高特异性、高准确性的优点,具有重要的应用价值。本发明专利技术还首次开发了一种胆管癌术后早期复发的风险预测算法模型和装置本发明专利技术可辅助临床进行胆管癌术后复发的提前预测,早期诊断,实施更为密切的术后随访和进一步的辅助治疗,将极大地改善胆管癌患者的术后预后。将极大地改善胆管癌患者的术后预后。

【技术实现步骤摘要】
一种联合多个mRNA预测胆管癌复发的方法及其应用


[0001]本专利技术属于生物信息学,具体地,本专利技术涉及一种联合多个mRNA预测胆管癌复发的方法及其应用。

技术介绍

[0002]胆管癌(CCA)是一种恶性上皮癌,是世界上仅次于肝细胞癌的最常见的原发性肝脏肿癌,伴随高死亡率和复发率,其源于胆管的不同位置。尽管手术治疗联合其他的放化疗已经应用于临床,但由于复发率高,CCA患者的预后仍然很差。因此,预测复发是一项艰巨而紧迫的任务。
[0003]在过去的几十年中,所有CCA的不良预后与胆管癌的高复发率密切相关。不幸的是,仍然没有很好的方法来准确预测胆管癌的术后复发。尽管美国癌症联合委员会(AJCC)的不同版本的TNM分期有一定的预测价值但仍不足以预测不同亚型CCA的复发。总而言之,目前没有很好的预测胆管癌复发的方法。
[0004]因此,本领域迫切需要开发出一种有效预测胆管癌复发的方法。

技术实现思路

[0005]本专利技术的目的是提供一种有效预测胆管癌复发的方法。
[0006]在本专利技术的第一方面,提供了一种检测试剂组合的用途,用于制备一诊断试剂或试剂盒,所述诊断试剂或试剂盒用于评估某一对象胆管癌复发的风险;
[0007]其中所述的检测试剂组合是一基因组合的检测试剂,所述的基因组合包括:
[0008](A)复发风险增加型标志物,其选自下组:UBASH3B、DBN1、PTTG1、CCNA2、SPATS2,或其组合;
[0009](B)复发风险下降型标志物,其选自下组:CD36、GGCX,或其组合;和/或
[0010](C)选自上述(A)组中的一个或多个基因与选自上述(B)组中的一个或多个基因所构成的组合。
[0011]在另一优选例中,所述的基因组合是包括以下基因的组合:CD36、GGCX、UBASH3B、DBN1、PTTG1、CCNA2和SPATS2。
[0012]在另一优选例中,所述的诊断包括早期诊断、辅助性诊断、或其组合。
[0013]在另一优选例中,所述的对象为人。
[0014]在另一优选例中,所述的对象为经治疗或未经治疗的CCA患者;较佳地,为经治疗的CCA患者。
[0015]在另一优选例中,所述检测是针对离体样本的检测。
[0016]在另一优选例中,所述的离体样本包括:血液样本、血清样本、组织样本、体液样本,或其组合。
[0017]在另一优选例中,所述的检测试剂偶联有或带有可检测标记。
[0018]在另一优选例中,所述可检测标记选自下组:生色团、化学发光基团、荧光团、同位
素或酶。
[0019]在另一优选例中,所述的样本为分离自外周血的单个核细胞样本。
[0020]在另一优选例中,所述组织样本为手术中切下的胆管癌组织。
[0021]在另一优选例中,所述的检测试剂包括对所述基因的核酸表达水平的检测试剂。
[0022]在另一优选例中,所述的检测试剂包括对所述基因的mRNA水平的检测试剂。
[0023]在另一优选例中,对所述基因的mRNA水平的检测试剂包括:引物、探针、核酸芯片,或其组合。
[0024]在另一优选例中,对所述基因的mRNA水平的检测试剂包括:用于对所述基因进行定量实时PCR所用到的引物对。
[0025]在另一优选例中,对所述基因的mRNA水平的检测试剂包括:特异性针对CD36基因的引物对、特异性针对GGCX基因的引物对、特异性针对UBASH3B基因的引物对、特异性针对DBN1基因的引物对、特异性针对PTTG1基因的引物对、特异性针对CCNA2基因的引物对、特异性针对SPATS2基因的引物对,或其组合。
[0026]在另一优选例中,特异性针对CD36基因的引物对的序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示。
[0027]在另一优选例中,特异性针对GGCX基因的引物对的序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示。
[0028]在另一优选例中,特异性针对UBASH3B基因的引物对的序列如SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示。
[0029]在另一优选例中,特异性针对DBN1基因的引物对的序列如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示。
[0030]在另一优选例中,特异性针对PTTG1基因的引物对的序列如SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10所示。
[0031]在另一优选例中,特异性针对CCNA2基因的引物对的序列如SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12所示。
[0032]在另一优选例中,特异性针对SPATS2基因的引物对的序列如SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14所示。
[0033]在另一优选例中,所述试剂盒中还包括18S mRNA的检测试剂。
[0034]在另一优选例中,所述18S mRNA的检测试剂包括特异性针对18S mRNA的引物对,所述的引物对的序列如SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16所示。
[0035]在另一优选例中,在所述试剂盒中还包括说明书,所述说明书中记载了如下内容:
[0036]当满足以下条件时,则提示所述对象为CCA早期复发风险高者:
[0037](i)当所述的基因属于A组,且所述基因的表达水平高于参考值或标准值时;和/或
[0038](ii)当所述的基因属于B组,且所述基因的表达水平低于参考值或标准值时。
[0039]在另一优选例中,所述参考值或标准值为经治疗的CCA患者且早期(治愈后1年内或两年内)无复发人群中相同样本中的所述基因的表达水平。
[0040]在另一优选例中,所述的参考值或标准值为正常人群中相同样本中的所述基因的表达水平。
[0041]在另一优选例中,所述的基因的表达水平是指所述基因的mRNA水平。
[0042]在另一优选例中,所述的基因包括了A组中n个基因所构成的组合,其中n为2

5的任一正整数(即2、3、4、5),优选地为5。
[0043]在另一优选例中,所述的基因包括了B组中的1或2个基因,优选地为2个基因。
[0044]在另一优选例中,所述的基因包括A组的5个基因和B组的2个基因所构成的7个基因的组合。
[0045]在本专利技术的第二方面,提供了一种试剂盒,所述试剂盒含有一检测试剂组合,所述检测试剂组合是一基因组合的检测试剂,所述的基因组合包括:
[0046](A)复发风险增加型标志物,其选自下组:UBASH3B、DBN1、PTTG1、CCNA2、SPATS2,或其组合;
[0047](B)复发风险下降型标志物,其选自下组:CD36、GGCX,或其组合;和/或
[0048](C)选自上述(A)组中的一个或多个基因与选自上述(B)组中的一个或多个基因所构成的组合。
[0049]在另一优选例中,所述的基因组合包本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种检测试剂组合的用途,其特征在于,用于制备一诊断试剂或试剂盒,所述诊断试剂或试剂盒用于评估某一对象胆管癌复发的风险;其中所述的检测试剂组合是一基因组合的检测试剂,所述的基因组合包括:(A)复发风险增加型标志物,其选自下组:UBASH3B、DBN1、PTTG1、CCNA2、SPATS2,或其组合;(B)复发风险下降型标志物,其选自下组:CD36、GGCX,或其组合;和/或(C)选自上述(A)组中的一个或多个基因与选自上述(B)组中的一个或多个基因所构成的组合。2.如权利要求1所述的用途,其特征在于,所述的基因组合是包括以下基因的组合:CD36、GGCX、UBASH3B、DBN1、PTTG1、CCNA2和SPATS2。3.如权利要求1所述的用途,其特征在于,所述检测是针对离体样本的检测,所述的离体样本包括组织样本,所述组织样本为手术中切下的胆管癌组织。4.如权利要求1所述的用途,其特征在于,所述检测试剂组合包括:特异性针对CD36基因的引物对、特异性针对GGCX基因的引物对、特异性针对UBASH3B基因的引物对、特异性针对DBN1基因的引物对、特异性针对PTTG1基因的引物对、特异性针对CCNA2基因的引物对、特异性针对SPATS2基因的引物对,或其组合。5.如权利要求1所述的用途,其特征在于,所述的检测是指对所述基因的mRNA水平的检测。6.一种试剂盒,其特征在于,所述试剂盒含有一检测试剂组合,所述检测试剂组合是一基因组合的检测试剂,所述的基因组合包括:(A)复发风险增加型标志物,其选自下组:UBASH3B、DBN1、PTTG1、CCNA2、SPATS2,或其组合;(B)复发风险下降型标志物,其选自下组:CD36、GGCX,或其组合;和/或(C)选自上述(A)组中的一个或多个基因与选自上述(B)组中的一个或多个基因所构成的组合。7.一种预测胆管癌复发的方法,其特征在于,包括步骤:(i)从一对象中获得一样品;和(ii)使用如权...

【专利技术属性】
技术研发人员:孔晓妮夏强孔宪明邬海龙郭晗
申请(专利权)人:上海交通大学医学院附属仁济医院
类型:发明
国别省市:

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