本发明专利技术公开了一种指纹谱图数据库的构建方法，该方法包括：获取复合群中多个不同菌种分别对应的谱图数据；提取多个所述谱图数据中的共有峰信息，提取每个所述菌种对应的谱图数据中区别于其他菌种的特征峰信息；合并所述共有峰信息和多个所述菌种对应的多个特征峰信息形成所述复合群的标准指纹谱图，并将所述标准指纹谱图录入所述复合群的指纹谱图数据库。本发明专利技术还公开了一种指纹谱图数据库的构建装置和计算机可读存储介质。本发明专利技术旨在提高复合群鉴定的准确性和鉴定成功率。群鉴定的准确性和鉴定成功率。群鉴定的准确性和鉴定成功率。
【技术实现步骤摘要】
指纹谱图数据库的构建方法、装置以及可读存储介质
[0001]本专利技术涉及生物
，尤其涉及指纹谱图数据库的构建方法、指纹谱图数据库的构建装置和计算机可读存储介质。
技术介绍
[0002]在微生物病原菌鉴定过程中，一般通过检测样本的蛋白组成获得特征峰，与数据库中细菌指纹图谱进行比较，达到鉴定细菌属、种的目的。其中，在数据库建库的方法是不同菌种的菌株进行纯培养，再通过标准化的前处理后上机采集谱图，将采集的谱图经过一定的质量筛选后进行预建库，验证合格可作为菌株的标准数据库图谱进行入库。
[0003]目前复合群在建库的过程中，不同菌种是进行单独建库的，也就是，每个菌种会分别建立一张标准谱图进行入库。然而，单独建库存在复合群中不同菌种的谱图的相似性较高导致入库数据出现混淆、建库过程容易出现入库菌株谱图信息不全的结果、数据库仅能包含复合群中部分已知菌种的谱图等问题，这容易导致数据库应用于复合群鉴定时存在鉴定准确性和鉴定成功率不佳的问题。
技术实现思路
[0004]本专利技术的主要目的在于提供一种指纹谱图数据库的构建方法、指纹谱图数据库的构建装置以及计算机可读存储介质，旨在提高复合群鉴定的准确性和鉴定成功率。
[0005]为实现上述目的，本专利技术提供一种指纹谱图数据库的构建方法，所述指纹谱图数据库的构建方法包括以下步骤：
[0006]获取复合群中多个不同菌种分别对应的谱图数据；
[0007]提取多个所述谱图数据中的共有峰信息，提取每个所述菌种对应的谱图数据中区别于其他菌种的特征峰信息；
[0008]合并所述共有峰信息和多个所述菌种对应的多个特征峰信息形成所述复合群的标准指纹谱图，并将所述标准指纹谱图录入所述复合群的指纹谱图数据库。
[0009]可选地，所述提取多个所述谱图数据中的共有峰信息，提取每个所述菌种对应的谱图数据中区别于其他菌种的特征峰信息的步骤包括：
[0010]对所述多个不同菌种对应的全部谱图数据进行聚类分析，获得聚类分析结果；
[0011]根据所述聚类分析结果确定每个所述菌种对应的所述特征峰信息的目标数量；
[0012]根据每个所述菌种对应的所述特征峰信息的目标数量提取每个所述菌种对应的所述特征峰信息。
[0013]可选地，所述聚类分析结果包括每个所述菌种的聚类距离，所述根据所述聚类分析结果确定每个所述菌种对应的所述特征峰信息的目标数量的步骤包括：
[0014]根据每个所述菌种的聚类距离对应确定每个菌种对应的所述特征峰信息的目标数量。
[0015]可选地，所述根据每个所述菌种的聚类距离对应确定每个菌种对应的所述特征峰
信息的目标数量的步骤包括：
[0016]根据每个所述菌种的聚类距离与特征距离之间的数量关系，将每个所述菌种的聚类距离转换成每个菌种对应的距离表征值，所述距离表征值为大于1的数值；
[0017]根据每个菌种对应的距离表征值的对数值确定每个菌种对应的所述特征峰信息的目标数量。
[0018]可选地，所述根据每个菌种对应的距离表征值的对数值确定每个菌种对应的所述特征峰信息的目标数量的步骤包括：
[0019]按照以下公式计算每个菌种对应的目标数量：
[0020]m
i
＝a*logd
i
+b；
[0021]其中，m
i
为每个菌种对应的所述特征峰信息的目标数量，a和b均为预设值，d
i
为每个菌种对应的距离表征值，log d
i
为每个菌种对应的距离表征值的对数值。
[0022]可选地，所述聚类分析结果还包括所述复合群中的菌种数量，所述根据所述聚类分析结果确定每个所述菌种对应的所述特征峰信息的目标数量的步骤包括：
[0023]当所述菌种数量多于两种时，执行所述根据每个所述菌种的聚类距离对应确定每个菌种对应的所述特征峰信息的目标数量的步骤；
[0024]当所述菌种数量为两种时，确定每个所述菌种对应的谱图数据中区别于其他菌种的信号峰的总数，根据两个所述总数确定每个所述菌种对应的所述特征峰信息的目标数量。
[0025]可选地，所述根据两个所述总数确定每个所述菌种对应的所述特征峰信息的目标数量的步骤包括：
[0026]确定两个所述总数中的最小数值为每个所述菌种对应的目标数量。
[0027]可选地，所述获取复合群中多个不同菌种分别对应的谱图数据的步骤包括：
[0028]按照标准提取法提取所述复合群的样本获得每个所述菌种分别对应的菌株，并采集每个菌种的菌株的多个谱图；
[0029]在每个菌种对应的多个谱图中删除满足预设条件的预设个谱图，获得每个菌种对应的多个目标谱图，所述预设条件包括主峰的基线漂移量小于预设漂移量、且谱图内多个特征峰的强度偏差值大于预设差值；
[0030]将每个菌种的多个目标谱图与对应的菌种的属性信息关联，获得所复合群中每个菌种对应的谱图数据；
[0031]且/或，所述合并所述共有峰信息和多个所述菌种对应的多个特征峰信息形成所述复合群的标准指纹谱图的步骤之后，还包括：
[0032]根据每个所述谱图数据与所述标准指纹谱图的比对结果，确定每个谱图数据对应的鉴定分值；
[0033]若每个所述鉴定分值均大于设定分值，则执行所述将所述标准指纹谱图录入所述复合群的指纹谱图数据库的步骤。
[0034]此外，为了实现上述目的，本申请还提出一种指纹谱图数据库的构建装置，所述指纹谱图数据库的构建装置包括：存储器、处理器及存储在所述存储器上并可在所述处理器上运行的指纹谱图数据库的构建程序，所述指纹谱图数据库的构建程序被所述处理器执行时实现如上任一项所述的指纹谱图数据库的构建方法的步骤。
[0035]此外，为了实现上述目的，本申请还提出一种计算机可读存储介质，所述计算机可读存储介质上存储有指纹谱图数据库的构建程序，所述指纹谱图数据库的构建程序被处理器执行时实现如上任一项所述的指纹谱图数据库的构建方法的步骤。
[0036]本专利技术提出的一种指纹谱图数据库的构建方法，该方法在获得复合群中多个不同菌种分别对应的谱图数据后，提取不同菌种在多个谱图数据中的共有峰信息，提取每个菌种在其谱图数据中特有的特征峰信息，将提取得到的共有峰信息和多个特征峰信息合并形成复合群的标准指纹谱图进行入库。基于此，通过将复合群中不同菌种在谱图数据中共有和特有的峰信息进行合并形成标准谱图，有利于避免单独建库时不同菌种的谱图相似性导致菌种的鉴定结果混淆的问题，也有利于避免单一菌种的谱图信息不全导致的鉴定分数过低或与其他菌种的鉴定结果出现混淆，还有利于数据库应用于鉴定复合群内未入库的菌种时避免出现假阳性或鉴定不出的结果，可提高复合群的鉴定分数、鉴定成功率以及未入库的复合群中其他菌种的检出率，从而有效提高复合群鉴定的准确性和鉴定成功率。
附图说明
[0037]图1为本专利技术指纹谱图数据库的构建装置一实施例运行涉及的硬件结构示意图；<本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种指纹谱图数据库的构建方法，其特征在于，所述指纹谱图数据库的构建方法包括以下步骤：获取复合群中多个不同菌种分别对应的谱图数据；提取多个所述谱图数据中的共有峰信息，提取每个所述菌种对应的谱图数据中区别于其他菌种的特征峰信息；合并所述共有峰信息和多个所述菌种对应的多个特征峰信息形成所述复合群的标准指纹谱图，并将所述标准指纹谱图录入所述复合群的指纹谱图数据库。2.如权利要求1所述的指纹谱图数据库的构建方法，其特征在于，所述提取多个所述谱图数据中的共有峰信息，提取每个所述菌种对应的谱图数据中区别于其他菌种的特征峰信息的步骤包括：对所述多个不同菌种对应的全部谱图数据进行聚类分析，获得聚类分析结果；根据所述聚类分析结果确定每个所述菌种对应的所述特征峰信息的目标数量；根据每个所述菌种对应的所述特征峰信息的目标数量提取每个所述菌种对应的所述特征峰信息。3.如权利要求2所述的指纹谱图数据库的构建方法，其特征在于，所述聚类分析结果包括每个所述菌种的聚类距离，所述根据所述聚类分析结果确定每个所述菌种对应的所述特征峰信息的目标数量的步骤包括：根据每个所述菌种的聚类距离对应确定每个菌种对应的所述特征峰信息的目标数量。4.如权利要求3所述的指纹谱图数据库的构建方法，其特征在于，所述根据每个所述菌种的聚类距离对应确定每个菌种对应的所述特征峰信息的目标数量的步骤包括：根据每个所述菌种的聚类距离与特征距离之间的数量关系，将每个所述菌种的聚类距离转换成每个菌种对应的距离表征值，所述距离表征值为大于1的数值；根据每个菌种对应的距离表征值的对数值确定每个菌种对应的所述特征峰信息的目标数量。5.如权利要求4所述的指纹谱图数据库的构建方法，其特征在于，所述根据每个菌种对应的距离表征值的对数值确定每个菌种对应的所述特征峰信息的目标数量的步骤包括：按照以下公式计算每个菌种对应的目标数量：m
i
＝a*log d
i
+b；其中，m
i
为每个菌种对应的所述特征峰信息的目标数量，a和b均为预设值，d
i
为每个菌种对应的距离表征值，log d
i
为每个菌种对应的距离表征值的对数值。6.如权利要求3所述的指纹谱图...
【专利技术属性】
技术研发人员：裴华，钟业腾，余纯纯，
申请(专利权)人：海南医学院第二附属医院，
类型：发明
国别省市：
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