一种区别C57BL/6亚系小鼠的引物、试剂盒和方法技术

本发明专利技术公开了一种区别C57BL/6亚系小鼠的引物、试剂盒和方法，区别C57BL/6亚系小鼠的引物包括9个SNP位点的内部正向引物、内部反向引物、外部正向引物和外部反向引物。区别C57BL/6亚系小鼠的试剂盒包括9个SNP位点的PCR反应体系。区别C57BL/6亚系小鼠的方法，包括步骤选择SNP位点，设计引物序列，制备模板DNA，ARMS

【技术实现步骤摘要】
一种区别C57BL/6亚系小鼠的引物、试剂盒和方法


[0001]本专利技术属于在生物检测的领域，具体涉及一种区别C57BL/6亚系小鼠的引物、试剂盒和方法。

技术介绍

[0002]目前，随着近些年国内外对生命科学的重视，实验动物供应及对实验动物质量的把控也成为了科学研究中关键的一环。C57BL/6小鼠在科学研究中被广泛使用，然而，最常见的两大亚系C57BL/6N与C57BL/6J在诸多方面都存在着差异，而这些差异则会导致实验数据的偏差。除此之外还存在一个C57BL/6By亚系，大约1961年该亚系从C57BL/6N中分离出来。因此在进行动物实验时，一定要根据需求选择合适的亚系。但C57BL/6小鼠在外观上几乎一致，这就导致在购买或同时饲养过程中无法快速分辨。
[0003]C57BL/6各个亚系之间存在许多特异性的单核苷酸多态性(SNP)，这对小鼠的遗传监测和亚系鉴定帮助很大。目前，已有许多能将其区分的SNP位点被报道，同时对于SNP的检测方法也层出不穷，如TaqMan探针法、SNaPshot法、高分辨率熔解曲线分析(HRM)法、PCR<本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种快速区别C57BL/6亚系小鼠的引物，其特征在于，包括三组SNP位点的引物序列：第一组，SNP位点：rs244794780，引物序列为rs244794780
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FI：SEQ ID NO.1，rs244794780
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RI：SEQ ID NO.2，rs244794780
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FO：SEQ ID NO.3，rs244794780
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RO：SEQ ID NO.4；SNP位点：rs228546410，引物序列为rs228546410
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FI：SEQ ID NO.5，rs228546410
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RI：SEQ ID NO.6，rs228546410
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FO：SEQ ID NO.7，rs228546410
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RO：SEQ ID NO.8；SNP位点：rs226310424，引物序列为rs226310424
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FI：SEQ ID NO.9，rs226310424
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RI：SEQ ID NO.10，rs226310424
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FO：SEQ ID NO.11，rs226310424
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RO：SEQ ID NO.12；SNP位点：rs246037535，引物序列为rs246037535
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FI：SEQ ID NO.13，rs246037535
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RI：SEQ ID NO.14，rs246037535
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FO：SEQ ID NO.15，rs246037535
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RO：SEQ ID NO.16；第二组，SNP位点：rs260260338，引物序列为rs260260338
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FI：SEQ ID NO.17，rs260260338
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RI：SEQ ID NO.18，rs260260338
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FO：SEQ ID NO.19，rs260260338
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RO：SEQ ID NO.20；第三组，SNP位点：rs224344563，引物序列为rs224344563
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FI：SEQ ID NO.21，rs224344563
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RI：SEQ ID NO.22，rs224344563
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FO：SEQ ID NO.23，rs224344563
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RO：SEQ ID NO.24；SNP位点：rs222821429，引物序列为rs222821429
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FI：SEQ ID NO.25，rs222821429
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RI：SEQ ID NO.26，rs222821429
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FO：SEQ ID NO.27，rs222821429
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RO：SEQ ID NO.28；SNP位点：rs239219835，引物序列为rs239219835
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FI：SEQ ID NO.29，rs239219835
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RI：SEQ ID NO.30，
rs239219835
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FO：SEQ ID NO.31，rs239219835
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RO：SEQ ID NO.32；SNP位点：rs243500146，引物序列为rs243500146
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FI：SEQ ID NO.33，rs243500146
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RI：SEQ ID NO.34，rs243500146
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FO：SEQ ID NO.35，rs243500146
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RO：SEQ ID NO.36。2.一种快速区别C57BL/6亚系小鼠的试剂盒，其特征在于，包括9个PCR反应体系，每个反应体系包括权利要求1所述的快速区别C57BL/6亚系小鼠的引物中的其中一个SNP位点的引物序列，每一个SNP位点的引物序列包括内部正向引物、内部反向引物、外部正向引物和外部反向引物。3.一种区别C57BL/6亚系小鼠的方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)选择SNP位点，针对所述SNP位点设计引物序列；(2)制备模板DNA，取鼠尾用NaOH溶液裂解并在温度80
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100℃进行加热以释放基因组DNA，冷却后加入Tris
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HCl溶液后混匀并且离心，离心后取上清液，得到模版DNA；(3)ARMS
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PCR扩增，为每个SNP位点对应一个PCR反应体系，PCR反应体系中包含PCR Taq MIX、水、引物序列和模版DNA；(4)凝胶电泳，使用体积分数为2％的琼脂糖凝胶，电泳，之后使用紫外凝胶成像仪显示结果；(5)将步骤(4)的显示结果与C57BL/6亚系小鼠的SNP位点对应的碱基进行比对，进行结果分析。4.根据权利要求3所述的区别C57BL/6亚系小鼠的方法，其特征在于，所述SNP位点包括：第一组的rs244794780、rs228546410、rs226310424、rs246037535，第二组的rs2602...

【专利技术属性】
技术研发人员：张晓晴，王妍，
申请(专利权)人：斯贝福北京生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：