核酸序列测定方法、系统、存储介质和计算机程序产品技术方案

本申请公开了一种测定核酸序列的方法、核酸序列测定系统、计算机可读存储介质和计算机程序产品，测定核酸序列的方法包括：将设有第一流道和第二流道的旋转阀转动至第一阀位置，以连通第一存储器和反应装置；在旋转阀处于第一阀位置的情况下，使第一反应液经过第一流道进入反应装置以进行第一反应；将旋转阀转动至第二阀位置，以连通第二存储器和反应装置；在旋转阀处于第二阀位置的情况下，使第二反应液经过第二流道进入反应装置以进行第二反应，以实现该核酸分子的序列测定。如此，转阀处于不同的位置可以实现对不同液体的流向进行独立控制、操作，使得核酸分子的序列测定更加容易实现。实现。实现。

【技术实现步骤摘要】
核酸序列测定方法、系统、存储介质和计算机程序产品


[0001]本申请涉及核酸序列测定
，更具体而言，涉及一种测定核酸序列的方法、一种核酸序列测定系统、一种存储介质和一种计算机程序产品。

技术介绍

[0002]相关技术中，对置于固相基底上的核酸样本进行核酸检测，例如，基于芯片检测实现核酸序列测定(测序)，通常包括一般所称的上机前的样本处理和上机，所称的上机前的样本处理为处理待测核酸样本使其满足上机要求，例如使待测核酸样本连接到固相基底表面，所称的上机指使处理后的待测核酸样本进入测序仪中进行测序。
[0003]当前商业自动化测序平台通常包括两个或多个独立的或者功能衔接的设备来实现上述样本处理和测序。对于包括两个配套的设备的测序平台，通常地，其中的一个设备用于对待测核酸样本进行处理包括将其连接到反应装置例如芯片上，该设备常被称为杂交仪、进样仪、建库仪、样本处理仪或者样本制备仪；另一个设备对上一个设备输出的连接有待测核酸样本的芯片进行检测，从而实现核酸序列测定，该设备是测序平台最主要的硬件，亦即通常所称的测序仪。/>[0004]当前本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种测定核酸序列的方法，其特征在于，包括：将设有第一流道和第二流道的旋转阀转动至第一阀位置，以连通第一存储器和反应装置，所述第一存储器承载第一反应液，所述第一反应液包含核酸分子；在所述旋转阀处于所述第一阀位置的情况下，使所述第一反应液经过所述第一流道进入所述反应装置以进行第一反应，所述第一反应包括使至少一部分所述核酸分子连接到所述反应装置；将所述旋转阀转动至第二阀位置，以连通第二存储器和所述反应装置，所述第二存储器承载第二反应液，所述第二反应液包含进行核酸测序所需的成分；在所述旋转阀处于所述第二阀位置的情况下，使所述第二反应液经过所述第二流道进入所述反应装置以进行第二反应，所述第二反应包括使进行所述第一反应之后的所述反应装置中的核酸分子与所述第二反应液相互作用发生聚合反应并检测来自该反应的信号，以实现该核酸分子的序列测定；任选地，还包括在进行所述第一反应之后和进行所述第二反应之前：使第三存储器中的第三反应液通过所述第一流道或者所述第二流道进入所述反应装置，以进行第三反应，所述第三反应包括使进行所述第一反应之后的所述反应装置中的核酸分子与所述第三反应液相互作用以实现该核酸分子的扩增，所述第三反应液包含进行扩增所需的成分；任选地，还包括在进行所述第一反应之前：使第四存储器中的洗涤溶液通过所述第一流道进入所述反应装置中；任选地，还包括在进行所述第一反应之前：通过所述第一流道向所述反应装置通入空气；任选地，还包括在进行所述第一反应之前和/或进行所述第二反应之前：使第四存储器中的洗涤溶液通过所述第一流道或所述第二流道进入所述反应装置中。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述反应装置具有固相载体表面，所述固相载体表面上固定有第一测序引物，所述核酸分子的至少一个末端包含至少一部分能够与所述第一测序引物的至少一部分互补配对的序列，所述第一反应包括使至少一部分所述核酸分子与所述第一测序引物互补配对以连接到所述反应装置中；任选地，所述第二反应液包含第一核苷酸、第一聚合酶和切割试剂，所述使所述第二反应液经过所述第二流道进入所述反应装置以进行第二反应，包括：(a)使所述第一核苷酸和所述第一聚合酶通过所述第二流道进入所述反应装置，并且使所述反应装置处于适于聚合反应的条件下，以通过延伸所述第一测序引物使所述第一核苷酸结合到所述核酸分子上，所述第一核苷酸包含碱基、糖单元、可切割的阻断基团和可检测标记；(b)激发所述可检测标记并采集来自所述可检测标记的信号；(c)使所述切割试剂通过所述第二流道进入所述反应装置，以去除所述第一核苷酸的可切割的阻断基团和可检测标记；(d)重复(a)-(c)至少一次；任选地，所述第二反应液还包含第二核苷酸，所述使所述第二反应液经过所述第二流道进入所述反应装置以进行第二反应，还包括在(a)之后，
使所述第二核苷酸和所述第一聚合酶通过所述第二流道进入所述反应装置，并且使所述反应装置置于适于聚合反应的条件下，以通过继续延伸(a)后的产物使所述第二核苷酸结合到所述核酸分子上，所述第二核苷酸包含碱基、糖单元和可切割的阻断基团；任选地，所述第二反应液包含第三核苷酸、第四核苷酸、第二聚合酶、第三聚合酶、切割试剂和第二测序引物，所述核酸分子的至少一个末端包含至少一部分能够与所述第二测序引物的至少一部分互补配对的序列，所述使所述第二反应液经过所述第二流道进入所述反应装置以进行第二反应包括：(i)使所述第三核苷酸和所述第二聚合酶通过所述第二流道进入所述反应装置，并且使所述反应装置处于适于聚合反应的条件下，以通过延伸所述第一测序引物使所述第三核苷酸结合到所述核酸分子上，获得新生链，所述第三核苷酸为既不带有可切割的阻断基团也不带有可检测标记的核苷酸；(ii)使所述第四核苷酸、所述第三聚合酶和所述第二测序引物通过所述第二流道进入所述反应装置，并且使所述反应装置处于适于聚合反应的条件下，以使所述第二测序引物与所述新生链结合并通过延伸所述第二测序引物使所述第四核苷酸结合到所述新生链上，所述第四核苷酸包含碱基、糖单元、可切割的阻断基团和可检测标记；(iii)激发所述可检测标记并采集来自所述可检测标记的信号；(iv)使所述切割试剂通过所述第二流道进入所述反应装置，以去除所述第四核苷酸的可切割的阻断基团和可检测标记；(v)重复进行(ii)-(iv)至少一次；任选地，所述第二反应液还包含第五核苷酸，所述使所述第二反应液经过所述第二流道进入所述反应装置以进行第二反应，还包括在(ii)之后，使所述第五核苷酸和所述第三聚合酶通过所述第二流道进入所述反应装置，并且使所述反应装置置于适于聚合反应的条件下，以通过继续延伸(ii)后的产物使所述第五核苷酸结合到所述新生链上，所述第五核苷酸包含碱基、糖单元和可切割的阻断基团。3.一种核酸序列测定系统，其特征在于，包括连接的液路系统、...

【专利技术属性】
技术研发人员：万雪峰，吴平，姜泽飞，
申请(专利权)人：深圳市真迈生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：