筛选分子的方法、装置及其应用制造方法及图纸

本申请涉及了一种筛选分子的方法、装置及其应用。该筛选分子的方法包括：获得M个配体分子的简化分子线性式与N个分子结构之间的第一映射关系；对于M个配体分子的简化分子线性式中的至少部分，分别对简化分子线性式的结构信息进行骨架提取，得到O个分子骨架；聚合O个分子骨架，得到P个分子骨架类；基于第一映射关系确定P个分子骨架类与N个分子结构之间的第二映射关系，以便基于第二映射关系从包括M个配体分子的简化分子线性式的简化分子线性式集合中筛选与目标受体分子匹配的分子。本申请提供的方案，能够提升用户筛选分子的准确度和便捷度。捷度。捷度。

【技术实现步骤摘要】
筛选分子的方法、装置及其应用


[0001]本申请涉及计算模拟
，尤其涉及一种筛选分子的方法、装置及其应用。

技术介绍

[0002]随着计算机技术和基础学科理论的快速发展，分子模拟的计算效率和精度都获得极大提高，使得分子模拟在多学科领域得到广泛应用。其中，筛选分子是分子模拟中的重要部分。
[0003]相关技术为了实现分子筛选，可以基于针对预设指标的阈值进行分子筛选。但是，这可能导致一些对后续开发有帮助的分子被过滤掉。

技术实现思路

[0004]为解决或部分解决相关技术中存在的问题，本申请提供一种筛选分子的方法、装置及其应用，能够降对后续开发有帮助的分子被过滤掉的概率。
[0005]本申请的第一个方面提供了一种筛选分子的方法，上述方法包括：获得M个配体分子的简化分子线性式与N个分子结构之间的第一映射关系，M个配体分子的简化分子线性式各自具有结构信息，M、N是大于或者等于1的整数；对于M个配体分子的简化分子线性式中的至少部分分子中的每个分子，分别对配体分子的结构信息进行骨架提取，得到O个分子骨架，O是大于或者等于本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种筛选分子的方法，其特征在于，所述方法包括：获得M个配体分子的简化分子线性式与N个分子结构之间的第一映射关系，所述M个配体分子的简化分子线性式各自具有结构信息，M、N是大于或者等于1的整数；对于所述M个配体分子的简化分子线性式中的至少部分，分别对所述简化分子线性式的结构信息进行骨架提取，得到O个分子骨架，O是大于或者等于1的整数，并且O小于或者等于M；聚合所述O个分子骨架，得到P个分子骨架类，P是大于或者等于1的整数，并且P小于或者等于O；基于所述第一映射关系确定所述P个分子骨架类与所述N个分子结构之间的第二映射关系，以便基于所述第二映射关系筛选与目标受体分子匹配的配体分子。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，在所述得到P个分子骨架类之后，所述方法还包括：对于所述P个分子骨架类中至少部分骨架类中的每个类，获取与该骨架类对应的至少部分配体分子各自对应的分子结构；基于所述至少部分配体分子各自对应的分子结构确定所述至少部分配体分子两两之间的体积差别；基于所述体积差别对与该骨架类对应的至少部分配体分子进行聚类，得到多个结构类；基于所述第一映射关系确定所述多个结构类与所述分子结构之间的第三映射关系。3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述基于所述至少部分配体分子各自对应的分子结构确定所述至少部分配体分子两两之间的体积差别，包括：将目标受体分子的口袋区域划分为网格；确定所述至少部分配体分子各自对应的分子结构对所述网格的占据比例；基于所述占据比例构建所述至少部分配体分子各自对应的分子结构的网格空间占据向量；基于所述至少部分配体分子各自对应的分子结构的网格空间占据向量确定所述至少部分配体分子两两之间的体积差别。4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述基于所述至少部分配体分子各自对应的分子结构的网格空间占据向量确定所述至少部分配体分子两两之间的体积差别，包括：确定两个配体分子各自对应的分子结构的网格空间占据向量之间的距离；基于所述网格空间占据向量之间的距离确定所述两个配体分子各自对应的分子结构占据空间的体积差别；重复以上操作直至确定所述至少部分配体分子中任意两个配体分子各自对应的分子结构之间的体积差别。5.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，在所述得到多个结构类之后，所述方法还包括：对于所述多个结构类中至少部分结构类中的每个类，获取与该结构类对应的至少部分分子结构各自与目标受体分子之间的第一相互作用特征，和/或，对于所述P个分子骨架类中至少部分骨架类的每个类，获取与该骨架类对应的至少部分分子结构各自与目标受体分
子之间的第二相互作用特征；确定至少部分分子结构各自的第一相互作用特征两两之间的第一相互作用差别，和/或，确定至少部分配体分子各自的第二相互作用特征两两之间的第二相互作用差别；对所述第一相互作用差别进行聚类，得到多个第一相互作用类，和/或，对所述第二相互作用差别进行聚类，得到多个第二相互作用类；至少基于所述第一映射关系确定所述多个第一相互作用类与所述分子结构之间的第四映射关系，和/或，基于所述第一映射关系确定所述多个第二相互作用类与所述分子结构之间的第五映射关系。6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，在所述得到P个分子骨架类之后，所述方法还包括：对于所述P个分子骨架类中至少部分骨架类的每个类，获取与该骨架类对应的至少部分配体分子各自与目标受体分子之间的第二相互作用特征；确定至少部分配体分子各自的第二相互作用特征两两之间的第二相互作用差别；对所述第二相互作用差别进行聚类，得到多个第二相互作用类；至少基于所述第一映射关系确定所述多个第二相互作用类与所述分子结构之间的第五映射关系。7.根据权利要求5或6所述的方法，其特征在于，所述确定至少部分配体分子各自的第二相互作用特征两两之间的第二相互作用差别，包括：确定与所述第二相互作用特征对应的相互作用特征向量；重复以下操作直至确定至少部分配体分子各自的第二相互作用特征中的任意两个之间的相互作用差别：确定与所述第二相互作用特征对应的相互作用特征向量之间的距离；基于与所述第二相互作用特征对应的相互作用特征向量之...

【专利技术属性】
技术研发人员：胡建星，吴楚楠，徐旻，庞丽雪，
申请(专利权)人：深圳晶泰科技有限公司，
类型：发明
国别省市：