用于样品收集的方法与系统技术方案

本文提出了收集和保存生物样品的方法和系统。所述方法和系统包括使用可溶解的收集膜来收集所述样品并将所述膜溶解于在可密封容器中所含的缓冲溶液或稳定化溶液中。器中所含的缓冲溶液或稳定化溶液中。器中所含的缓冲溶液或稳定化溶液中。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于样品收集的方法与系统
相关申请的交叉引用
[0001]本申请要求于2018年6月1日提交的美国临时专利申请62/679,695的权益，该美国临时专利申请的内容在此整体并入本文。

技术介绍

[0002]从样品中检测和鉴定生物分子，例如微生物组和代谢产物，被广泛用于疾病的诊断和监测。这种分析通常需要生物分子的稳定运输和递送。低成本且有效的生物分子的收集、储存和递送适用于医学诊断领域。本文提出了用于收集和稳定生物样品的方法和系统以及用于有效处理所收集样品的方法。

技术实现思路

[0003]在一些方面，本文提供了保存生物样品的方法，包括在可溶解膜(例如，水溶性膜、乙醇可溶性膜等)上收集生物样品；以及将包含所述生物样品的所述可溶解膜溶解在稳定化溶液中，其中所述稳定化溶液被放置在可密封容器中。在一些实施方案中，所述方法还包括分析所述生物样品。
[0004]在一些实施方案中，所述生物样品包含微生物组群体。在一些实施方案中，所述生物样品包含代谢产物群体。在一些实施方案中，所述生物样品包括粪便样品、皮肤样品、阴道样品、耳朵样品或口腔样品。
[0005]在一些实施方案中，所述可溶解膜包含聚乙烯醇聚合物。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含纤维素。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含聚乙烯醇缩丁醛(PVB)聚合物。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含按重量计1％至30％的PVB。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含按重量计30％至50％的PVB。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含按重量计50％至100％的PVB。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含PVB和聚合物增塑剂(例如，PVB和增塑剂的组合)。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含聚乙烯醇聚合物、聚合物增容剂和聚合物增塑剂或糖醇增塑剂的组合。在一些实施方案中，所述聚合物增容剂包含纤维素醚聚合物、羧甲基纤维素钠、改性淀粉或其组合。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含按重量计10％至30％的聚合物增容剂和聚合物增塑剂或糖醇增塑剂。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含按重量计1％至30％的聚乙烯醇聚合物。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含按重量计30％至50％的聚乙烯醇聚合物。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含按重量计50％至100％的聚乙烯醇聚合物。在一些实施方案中，所述可溶解膜在低于37℃下基本可溶于所述稳定化溶液中。在一些实施方案中，所述可溶解膜是可食用的、食品级的、化妆品级的、药物级的或适合皮肤接触的。
[0006]在一些实施方案中，所述稳定化溶液包含防腐剂或稳定化试剂。在一些实施方案中，所述防腐剂或所述稳定化试剂是高盐试剂或乙醇基试剂。在一些实施方案中，所述稳定化溶液包含抗菌剂。在一些实施方案中，所述稳定化溶液包含溴化N
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辛基吡啶溶液。在一些实施方案中，所述稳定化溶液包含氯化锂、三氨基甲烷、乙醇、TCEP
‑
HCl或其组合。
[0007]在一些实施方案中，所述可密封容器的体积大于5ml。在一些实施方案中，所述可密封容器的体积小于150ml。
[0008]在一些实施方案中，所述稳定化溶液在室温下将所述生物样品稳定长达15天。在一些实施方案中，所述稳定化溶液在室温下将所述生物样品的核酸内容物稳定长达30天或在
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20℃下稳定长达3个月。在一些实施方案中，所述稳定化溶液在室温下将所述生物样品的蛋白质内容物稳定长达15天。在一些实施方案中，所述稳定化溶液在室温下将所述生物样品的代谢产物稳定长达7天或在
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80℃下稳定长达3个月。
[0009]在一些实施方案中，所述方法还包括将包含所述稳定化溶液和所述生物样品的所述可密封容器运输或递送至实验室或测试中心。在一些实施方案中，所述可密封容器在室温下运输或递送。在一些实施方案中，所述可密封容器在干冰上、在冰箱中、在冷藏箱(例如，箱)中或用冰袋运输或递送。在一些实施方案中，在任何进一步处理之前，不将包含所述稳定化溶液和所述生物样品的所述可密封容器进行冷冻。
[0010]在一些实施方案中，所述可溶解膜的表面积为3cm
×
3cm至40cm
×
40cm。
[0011]在一些方面，本文提供了采样试剂盒，其包括：用于收集生物样品的可溶解膜和可密封容器中的稳定化溶液，所述稳定化溶液能够溶解包含所述生物样品的所述可溶解膜。
[0012]在一些实施方案中，所述试剂盒还包括用于将所述生物样品收集到所述可溶解膜上并将所述可溶解膜溶解在所述稳定化溶液中的说明书。
[0013]在一些实施方案中，所述可溶解膜是单独包装的。在一些实施方案中，所述可溶解膜以在包装中的一组堆叠片材形式提供。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含聚乙烯醇。在一些实施方案中，所述可溶解膜包含聚乙烯醇缩丁醛。在一些实施方案中，所述可溶解膜是干燥的。
[0014]在一些实施方案中，所述可密封容器是条形码化的。在一些实施方案中，所述稳定化溶液包含DMSO
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EDTA二钠饱和盐(DMSO
‑
disodium EDTA
‑
saturated salt，DESS)。在一些实施方案中，所述稳定化溶液包含乙醇。
[0015]在一些方面，本文提供了从溶液中鉴定微生物组群体的方法，所述方法包括：对包含生物样品和溶解的可溶解膜的稳定化溶液进行核酸内容物分析，并基于所述核酸内容物分析，鉴定存在于包含所述生物样品的所述稳定化溶液中的至少一种微生物。在一些实施方案中，将所述生物样品收集到所述可溶解膜上，并在进行所述核酸内容物分析之前，将所述可溶解膜溶解在所述稳定化溶液中。
[0016]在一些实施方案中，所述可溶解膜可以是水溶性膜，并且所述稳定化溶液可以是水基的，使得所述水溶性膜可溶解在所述水基稳定化溶液中。在一些实施方案中，所述可溶解膜可以是乙醇可溶性膜，并且所述稳定化溶液可以是乙醇基的，使得所述乙醇可溶性膜可溶解在所述乙醇基稳定化溶液中。
[0017]一些实施方案还包括确定所述生物样品的微生物组谱(microbiome profile)。在一些实施方案中，确定所述微生物组谱包括在所述生物样品中鉴定至少5种微生物、至少10种微生物、至少20种微生物或至少30种微生物。
[0018]一些实施方案还包括生成鉴定存在于所述微生物组群体中的至少一种微生物的报告。
[0019]在一些实施方案中，所述核酸内容物分析包括对所述生物样品的所述核酸内容物
进行测序。在一些实施方案中，对所述核酸内容物的测序包括下一代测序、长读测序、Sanger测序、高通量测序、基于荧光的测序、基于聚合酶链反应的测序或纳米孔测序。在一些实施方案中，对所述核酸内容物进行测序包括对针对细菌的16S V1
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V2、V3
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V4或V4
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V5序列；针对真菌的ITS1区域；或针对真核微生物的18S区域进行测序。在一些实施方案中，对所述核酸内容物进行测序包括对微生物的所述本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种保存生物样品的方法，所述方法包括：a.在可溶解膜上收集生物样品；以及b.在稳定化溶液中溶解包含所述生物样品的所述可溶解膜，其中所述稳定化溶液被放置在可密封容器中。2.根据权利要求1所述的方法，还包括分析所述生物样品。3.根据权利要求1或权利要求2所述的方法，其中所述生物样品包含微生物组群体。4.根据权利要求1或权利要求2所述的方法，其中所述生物样品包含代谢产物群体。5.根据权利要求1
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4中任一项所述的方法，其中所述生物样品包括粪便样品、皮肤样品、阴道样品、耳朵样品或口腔样品。6.根据权利要求1
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5中任一项所述的方法，其中所述可溶解膜是水溶性的。7.根据权利要求1
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5中任一项所述的方法，其中所述可溶解膜是乙醇可溶性的。8.根据权利要求1
‑
5中任一项所述的方法，其中所述可溶解膜包含聚乙烯醇缩丁醛聚合物。9.根据权利要求1
‑
5中任一项所述的方法，其中所述可溶解膜包含聚乙烯醇聚合物。10.根据权利要求1
‑
5中任一项所述的方法，其中所述可溶解膜包含纤维素。11.根据权利要求1
‑
5中任一项所述的方法，其中所述可溶解膜包含聚乙烯醇缩丁醛聚合物、聚合物增容剂和增塑剂的组合。12.根据权利要求1
‑
5中任一项所述的方法，其中所述可溶解膜包含聚乙烯醇聚合物、聚合物增容剂和糖醇增塑剂的组合。13.根据权利要求11或权利要求12所述的方法，其中所述聚合物增容剂包含纤维素醚聚合物、羧甲基纤维素钠、改性淀粉或其组合。14.根据权利要求11
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13中任一项所述的方法，其中所述可溶解膜包含按重量计10％至30％的聚合物增容剂和糖醇增塑剂。15.根据权利要求8或11
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14中任一项所述的方法，其中所述可溶解膜包含按重量计1％至30％的聚乙烯醇缩丁醛聚合物。16.根据权利要求8或11
‑
14中任一项所述的方法，其中所述可溶解膜包含按重量计30％至50％的聚乙烯醇缩丁醛聚合物。17.根据权利要求8或11
‑
14中任一项所述的方法，其中所述可溶解膜包含按重量计50％至100％的聚乙烯醇缩丁醛聚合物。18.根据权利要求9或11
‑
14中任一项所述的方法，其中所述可溶解膜包含按重量计1％至30％的聚乙烯醇聚合物。19.根据权利要求9或11
‑
14中任一项所述的方法，其中所述可溶解膜包含按重量计30％至50％的聚乙烯醇聚合物。20.根据权利要求9或11
‑
14中任一项所述的方法，其中所述可溶解膜包含按重量计50％至100％的聚乙烯醇聚合物。21.根据权利要求1
‑
20中任一项所述的方法，其中所述可溶解膜在低于37℃下基本可溶于所述稳定化溶液中。22.根据权利要求1
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20中任一项所述的方法，其中所述可溶解膜是可食用的、食品级的、化妆品级的、药物级的或适合皮肤接触的。
23.根据权利要求1
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22中任一项所述的方法，其中所述稳定化溶液包含防腐剂或稳定化试剂。24.根据权利要求23所述的方法，其中所述防腐剂或所述稳定化试剂是高盐试剂或乙醇基试剂。25.根据权利要求1
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24中任一项所述的方法，其中所述稳定化溶液包含抗菌剂。26.根据权利要求1
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25中任一项所述的方法，其中所述稳定化溶液包括溴化N
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辛基吡啶溶液。27.根据权利要求1
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26中任一项所述的方法，其中所述稳定化溶液包含氯化锂、三氨基甲烷、乙醇、TCEP
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HCl或其组合。28.根据权利要求1
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27中任一项所述的方法，其中所述可密封容器的体积大于5ml。29.根据权利要求1
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28中任一项所述的方法，其中所述可密封容器的体积小于150ml。30.根据权利要求1
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29中任一项所述的方法，其中所述稳定化溶液在室温下将所述生物样品稳定长达15天。31.根据权利要求1
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30中任一项所述的方法，其中所述稳定化溶液将所述生物样品的核酸内容物在室温下稳定长达30天或在
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20℃下稳定长达3个月。32.根据权利要求1
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31中任一项所述的方法，其中所述稳定化溶液将所述生物样品的蛋白质内容物在室温下稳定长达15天。33.根据权利要求1
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32中任一项所述的方法，其中所述稳定化溶液将所述生物样品的代谢产物在室温下稳定长达7天或在
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80℃下稳定长达3个月。34.根据权利要求1
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33中任一项所述的方法，还包括将包含所述稳定化溶液和所述生物样品的所述可密封容器运输或递送至实验室或测试中心。35.根据权利要求34所述的方法，其中将所述可密封容器在室温下运输或递送。36.根据权利要求34所述的方法，其中将所述可密封容器在干冰上、在冰箱中、在冷藏箱中或用冰袋运输或递送。37.根据权利要求1
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35中任一项所述的方法，其中在任何进一步处理之前不将包含所述稳定化溶液和所述生物样品的所述可密封容器进行冷冻。38.根据权利要求1
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37中任一项所述的方法，其中所述可溶解膜的表面积为3cm
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3cm至40cm
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【专利技术属性】
技术研发人员：华卉，乔尔，
申请(专利权)人：温杰维帝健康有限责任公司，
类型：发明
国别省市：