分子训练集的构建方法、训练方法及相关装置制造方法及图纸

本申请公开了一种用于拟合通用力场的分子训练集的构建方法、训练方法及相关装置，该方法包括：获取目标分子库，所述目标分子库中包含多个目标分子；对所述目标分子库中的每个目标分子进行骨架分析，并将具有相同骨架的所述目标分子进行聚类；从每个所述骨架下挑选至少一个所述目标分子以构建所述分子训练集。通过上述方式，本申请能够避免通用力场拟合过程中大量冗余数据带来的噪音，提高了拟合的质量，同时也降低了计算资源和时间的消耗。同时也降低了计算资源和时间的消耗。同时也降低了计算资源和时间的消耗。

【技术实现步骤摘要】
分子训练集的构建方法、训练方法及相关装置


[0001]本申请涉及分子力场
，特别是涉及一种分子训练集的构建方法、训练方法及其相关装置。

技术介绍

[0002]使用分子模拟预测药物分子的理化性质，如结合自由能，透膜性，溶解度，已经成为现代药物设计中的一个强大工具。由于背后严格的物理模型以及能够模拟复杂的生物体系，分子模拟所带来的高精度预测能力已经吸引了人们越来越多的兴趣。在计算机辅助药物设计领域，无论是基于配体的药物设计，还是基于结构的药物设计，分子模拟都提供了完善的解决方案来加速药物发现过程。
[0003]本申请的专利技术人在长期的研发过程中发现复杂分子体系的模拟离不开高精度可靠的分子力场。生物分子体系的模拟往往需要模拟成千上万个原子，并且模拟的时间尺度需要从纳秒级到秒级。即使模拟最小的生物体系，纯量子力学虽然精度较高，但也由于及其昂贵的计算量而难以胜任。因此分子力场的开发是计算生物学及计算化学的重要目标。分子力场通过一些经验性的方程，如谐振子模型模拟键的伸缩，点电荷模型来模拟静电相互作用，来平衡计算精度与高计算量之间的矛盾。这些本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种分子训练集的构建方法，其特征在于，包括：获取目标分子库，所述目标分子库中包含多个目标分子；对所述目标分子库中的每个目标分子进行骨架分析，并将具有相同骨架的所述目标分子进行聚类；从每个所述骨架下挑选至少一个所述目标分子以构建所述分子训练集。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述从每个所述骨架下挑选至少一个所述目标分子以构建所述分子训练集的步骤之后，所述方法还包括：获取在当前通用力场的原子类型定义下所述目标分子库所包含的所有目标分子的第一力场参数合集，以及获取所述分子训练集中所包含的所有目标分子的第二力场参数合集；将所述第二力场参数合集与所述第一力场参数合集进行比较，获取所述第二力场参数合集与所述第一力场参数合集之间的差异力场参数合集，所述差异力场参数合集中包含至少一个差异力场参数；针对每个所述差异力场参数，从所述目标分子库中获取具有所述差异力场参数的目标分子添加至所述分子训练集中，以更新所述分子训练集。3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述第一力场参数合集和所述第二力场参数合集中的力场参数包括二面角、键长和键角中至少一种。4.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述第一力场参数合集包括多个第一力场参数，所述差异力场参数属于所述第一力场参数合集；所述针对每个所述差异力场参数，从所述目标分子库中获取具有所述差异力场参数的目标分子添加至所述分子训练集中，以更新所述分子训练集的步骤之前，所述方法还包括：针对每个所述第一力场参数，从所述目标分子库中获取具有所述第一力场参数的至少一个目标分子形成分子合集；所述针对每个所述差异力场参数，从所述目标分子库中获取具有所述差异力场参数的目标分子添加至所述分子训练集中，以更新所述分子训练集的步骤，包括：针对每个所述差异力场参数，获取与所述差异力场参数对应的分子合集，从所述分子合集中挑选出至少一个目标分子添加至所述分子训练集中。5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述对所述目标分子库中的每个目标分子进行骨架分析的步骤之前，所述方法还包括：对所述目标分...

【专利技术属性】
技术研发人员：薛白，吴楚楠，
申请(专利权)人：深圳晶泰科技有限公司，
类型：发明
国别省市：