鸡TRIM13基因SNP分子标记在鸡生长及屠宰性状改良育种中的应用及育种方法技术

本发明专利技术涉及鸡TRIM13基因SNP分子标记在鸡生长及屠宰性状改良育种中的应用及育种方法，属于生物育种技术领域。本发明专利技术通过研究发现鸡TRIM13基因第3内含子区第87位碱基的1处SNP位点(T

【技术实现步骤摘要】
鸡TRIM13基因SNP分子标记在鸡生长及屠宰性状改良育种中的应用及育种方法


[0001]本专利技术涉及鸡TRIM13基因SNP分子标记在鸡生长及屠宰性状改良育种中的应用及育种方法，属于生物育种


技术介绍

[0002]肉是最有价值的畜产品，尽管发达国家的肉类消费量相对固定，但自1980年以来，发展中国家的人均肉类年消费量翻了一番。人口和收入的增长，以及食品偏好的变化，都增加了对畜产品的需求。纵观全球，鸡肉是仅次于猪肉的世界第二大肉类消费品，鸡肉消费在所有肉类消费总量中比例最高约为35％(猪肉为37％)，且在2012-2014年间鸡肉消费总量每年仍以约1.6％(大于猪肉的1.1％)比例上升(http://www.fao.org/ag/againfo/themes/en/meat/background.html)，提高鸡体重及鸡肉产量是现代育种工作的重要任务。生长性状如体重作为畜禽主要的经济性状，如何在种质特性不改变的情况下提高地方畜禽品种的经济性状，维护地方畜禽的可持续发展是急需解决的问题。因此，有必要开发新的遗传标记，借助分子生物学手段加快遗传改良工作进程，从而缩短育种时间，加快育种进程。

技术实现思路

[0003]本专利技术的目的是提供鸡TRIM13基因SNP分子标记在鸡生长及屠宰性状改良育种中的应用。
[0004]本专利技术的另一个目的是提供一种基于鸡TRIM13基因SNP分子标记的鸡生长及屠宰性状改良育种的方法，该方法能够用于选育高体重或大体型鸡种。
[0005]为了实现上述目的，本专利技术采用以下技术方案：
[0006]本专利技术提供鸡TRIM13基因SNP分子标记在鸡生长及屠宰性状改良育种中的应用，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，5
’
端起第123位碱基为C或T；所述应用为对鸡TRIM13基因SNP分子标记的基因型进行检测，当SNP分子标记的基因型为CC时，待测鸡为高体重、大体型个体，当SNP分子标记的基因型为TT时，待测鸡为低体重、小体型个体。
[0007]具体的，通过试剂盒检测鸡TRIM13基因SNP分子标记的基因型。
[0008]所述试剂盒包含如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的引物对，以及限制性内切酶Bsp1286I。
[0009]优选的，所述试剂盒还包括dNTPs、PCR反应缓冲液、DNA聚合酶中的一种或几种。
[0010]本专利技术提供一种基于鸡TRIM13基因SNP分子标记的鸡生长及屠宰性状改良育种的方法，该方法包括以下步骤：以待测鸡的基因组DNA为模板，用SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的引物对进行PCR扩增，对PCR产物用Bsp1286I内切酶进行酶切反应，若酶切产物为189bp，突变处碱基为纯合TT型，若酶切产物为122/67bp，则突变处碱基为纯合CC型，若酶切产物为189/122/67bp，则突变处碱基为杂合CT型；当SNP分子标记的基因型为CC时，待测鸡为高体重、大体型个体，当SNP分子标记的基因型为TT时，待测鸡为低体重、小体型个体；选
留CC基因型的鸡个体。
[0011]优选的，所述PCR扩增的反应体系为：2
×
Taq PCR MasterMix 10μL，ddH2O 6μL，上游引物P-F 1μL，下游引物P-R 1μL，DNA模板2μL。
[0012]优选的，所述PCR扩增的反应程序为：95℃5min；95℃15s，60℃15s，72℃5s，共35个循环；72℃5min，4℃保存。
[0013]优选的，所述酶切反应的体系为25uL，包括PCR产物22.5uL、10
×
Buffer 2uL以及Bsp1286I 0.5uL。
[0014]优选的，通过琼脂糖凝胶电泳检测所述酶切产物的大小，以判断SNP分子标记的基因型。
[0015]优选的，所述琼脂糖凝胶电泳检测采用的琼脂的质量分数为2.0％，电压为120V，电泳时间为30min。
[0016]上述基于鸡TRIM13基因SNP分子标记的鸡生长及屠宰性状改良育种方法，能够应用于选育高体重或大体型鸡种。
[0017]本专利技术的有益效果在于：
[0018]本专利技术提供了鸡TRIM13基因SNP分子标记在鸡生长及屠宰性状改良育种中的应用：首先以766个表型数据记录完整的固始-安卡F2资源群鸡为研究对象进行全基因组关联分析，然后对表型记录详细的F2资源群TRIM13基因第3内含子区第87位碱基进行了大规模的SNP分型工作以验证以上SNP位点的准确性。本专利技术证明了位于鸡TRIM13基因第3内含子区第87位碱基存在的1处SNP分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，5
’
端起第123位碱基为C或T；(T-C，rs732405671)，与鸡生长性状(体重、胫长、胫围、胸深、胸宽、胸骨长、体斜长、盆骨宽)及屠宰性状(全净膛、肝脏重、心脏重、脾重、爪重)显著相关。该SNP位点的等位基因T与低体重性状正相关，等位基因C与高体重性状正相关，杂合等位基因CT的表型性状处于中间值。体重是鸡的重要经济性状，而胫围和胸骨长等性状与鸡体型大小强相关，该SNP位点为筛选出纯合高品质的地方鸡群体奠定基础。对该SNP分子标记基因型进行检测，能够早期、有效的预测鸡成熟期体重，可作为鸡品种遗传改良的分子标记，从而缩短育种时间，加快育种进程，具有很大的经济应用价值和科研价值。
[0019]本专利技术进一步提供了基于鸡TRIM13基因SNP分子标记的鸡生长及屠宰性状改良育种方法：在鸡TRIM13基因第3内含子区第87位碱基SNP位点上下游设计引物，并利用Bsp1286I酶采用PCR-RFLP方法检测SNP分子标记的基因型。本专利技术提供了引物核苷酸序列、PCR扩增反应体系及反应条件、PCR扩增程序、酶切反应体系以及酶切产物电泳条件，并明确了SNP分子标记基因型与鸡生长性状的对应关系，即当SNP分子标记的基因型为CC时，待测鸡为高体重、大体型个体，当SNP分子标记的基因型为TT时，待测鸡为低体重、小体型个体。选留CC纯合基因型的鸡个体进行培育，弃去TT、CT基因型的鸡个体，即可获得具有高体重、大体型的优良生长性状的鸡种质资源。该方法可操作性强，不需要特殊的仪器，易推广普及，能够早期、快速、低成本、有效的预测鸡的体重和体型大小，可以用于鸡的辅助选择和分子育种，在鸡种质资源改良方面具有广阔的应用前景。
附图说明
[0020]图1是不同基因型突变位置序列峰图；
[0021]图2是Bsp1286I内切酶分析示意图；
[0022]图3是三种基因型Bsp1286I酶切后琼脂糖电泳结果图。
具体实施方式
[0023]下面结合具体实施方式对本专利技术作进一步描述，但本专利技术的保护范围并不仅限于此；若未特别指明，实施例中所用的设备和试剂均常规市售可得。
[0024]实施例1：与鸡生长及屠宰性状相关的SNP分子标本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种鸡TRIM13基因SNP分子标记在鸡生长及屠宰性状改良育种中的应用，其特征在于，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，5
’
端起第123位碱基为C或T。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，对鸡TRIM13基因SNP分子标记的基因型进行检测，当SNP分子标记的基因型为CC时，待测鸡为高体重、大体型个体，当SNP分子标记的基因型为TT时，待测鸡为低体重、小体型个体。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，通过试剂盒检测鸡TRIM13基因SNP分子标记的基因型，所述试剂盒包含如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的引物对，以及限制性内切酶Bsp1286I。4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述试剂盒还包括dNTPs、PCR反应缓冲液、DNA聚合酶中的一种或几种。5.一种基于鸡TRIM13基因SNP分子标记的鸡生长及屠宰性状改良育种方法，其特征在于：包括以下步骤：以待测鸡的基因组DNA为模板，用SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的引物对进行PCR扩增，对PCR产物用Bsp1286I内切酶进行酶切反应，若酶切产物为189bp，突变处碱基为纯合TT型，若酶切产物为122/67bp，则突变处碱...

【专利技术属性】
技术研发人员：康相涛，张彦华，李转见，韩瑞丽，李东华，孙桂荣，田亚东，闫峰宾，蒋瑞瑞，李红，李国喜，刘小军，王彦彬，李文婷，黄河天，宋素芳，
申请(专利权)人：河南农业大学，
类型：发明
国别省市：