检测SNP分子标记的试剂在山羊RBP4基因分型和/或山羊分子标记辅助育种中的应用制造技术

本发明专利技术提供了检测SNP分子标记的试剂在山羊RBP4基因分型和/或山羊分子标记辅助育种中的应用，属于分子标记检测技术领域，根据Ensembl数据库最新版本RBP4的注释(ENSCHIG00000023599)，所述SNP分子标记位于山羊26号染色体的第36491960位碱基，该位置为RBP4基因的5

【技术实现步骤摘要】
检测SNP分子标记的试剂在山羊RBP4基因分型和/或山羊分子标记辅助育种中的应用


[0001]本专利技术涉及分子标记检测
，具体地说，涉及检测SNP分子标 记的试剂在山羊RBP4基因分型和/或山羊分子标记辅助育种中的应用。

技术介绍

[0002]视黄醇结合蛋白4(RBP4)属于脂质运载蛋白家族(lipocalin proteinfamily)的一员，是一种典型的小分泌蛋白，表现出广泛的结构和功能多样 性。视黄醇结合蛋白(Retinol
‑
binding proteins，RBPs)是动物体内一类将维生 素A从肝中转运至靶组织以及实现维生素A的细胞内转运代谢的特异的运 载蛋白、在协助维生素A发挥生理功能中起着不可替代的作用，RBP4是孕 体产生的主要蛋白质之一。RBP4位于山羊26号染色体上，包含6个外显子， 编码区总长612bp，编码蛋白含氨基酸203个。维生素A(视黄醇)是多种组 织正常发育所需的关键营养素，包括那些与生殖性能有关的组织，如卵泡发 育、卵母细胞成熟和胚胎发育等。而视黄醇作用的发挥依赖于其载体蛋白视 黄醇结合蛋白(RBPs)的结合和运输。有研究表明，RBP4在猪妊娠的关键时 期表达，在胚胎发育过程中起着重要作用。
[0003]目前还没有关于RBP4基因在山羊繁殖调控中的研究公开。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的在于提供检测SNP分子标记的试剂在山羊RBP4基因分型 和/或山羊分子标记辅助育种中的应用。
[0005]为了实现上述专利技术目的，本专利技术提供以下技术方案：
[0006]本专利技术提供了检测SNP分子标记的试剂在山羊RBP4基因分型和/或山 羊分子标记辅助育种中的应用，根据Ensembl数据库最新版本RBP4的注释 (ENSCHIG00000023599)，所述SNP分子标记位于山羊26号染色体的第 36491960位碱基，该位置为RBP4基因的5
’
调控区，该处碱基为G或C； 所述SNP分子标记与山羊产羔数具有显著的相关性。
[0007]优选的，所述SNP分子标记的CC或GC基因型对应的山羊产羔数高于GG基因型对应的山羊产羔数。
[0008]优选的，所述山羊分子标记辅助育种包括高产羔数山羊的早期筛选。
[0009]优选的，所述山羊的品种包括云上黑山羊。
[0010]优选的，所述检测SNP分子标记的试剂包括引物组；所述引物组包括 Primer_AlleleFAM、Primer_AlleleHEX和Primer_Common；所述 Primer_AlleleFAM的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示；所述 Primer_AlleleHEX的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示；所述Primer_Common 的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。
[0011]优选的，检测所述SNP分子标记包括以下步骤：
[0012]1)提取待测山羊的基因组DNA；
[0013]2)以待测山羊的基因组DNA为模板，利用权利要求5中所述的引物组 进行KASP分
型，确定所述SNP位点的基因型，当基因型为CC或GC时， 判断山羊产羔数高；当基因型为GG时，判断山羊产羔数低。
[0014]优选的，每个KASP分型的反应体系中DNA模板的用量为5～50ng。
[0015]优选的，每个KASP分型的反应总体系为5.07μl，包括：2.5μl 2xMasterMix、0.07μl Primermix和2.5μl DNA模板。
[0016]本专利技术提供了检测SNP分子标记的试剂在山羊RBP4基因分型和/或山羊 分子标记辅助育种中的应用，根据Ensembl数据库最新版本RBP4的注释 (ENSCHIG00000023599)，所述SNP分子标记位于山羊26号染色体的第 36491960位碱基，该位置为RBP4基因的5
’
调控区，该处碱基为G或C；所述 SNP分子标记与山羊产羔数具有显著的相关性。通过对山羊RBP4基因型进行 选择，将具有高产羔数性状的CC型和较高产羔数的GC型个体选留下来，淘 汰产羔数较低的GG型个体，从而提高山羊的繁殖力，对山羊大规模分子育 种具有潜在的应用价值。
附图说明
[0017]图1为Mix工作液分装示意图；
[0018]图2为本专利技术实施例1中利用KASP技术对RBP4基因进行分型检测的结 果，存在GG、GC和CC三种基因型。
具体实施方式
[0019]本专利技术提供了检测SNP分子标记的试剂在山羊RBP4基因分型和/或山 羊分子标记辅助育种中的应用，根据Ensembl数据库最新版本RBP4的注释 (ENSCHIG00000023599)，所述SNP分子标记位于山羊26号染色体的第 36491960位碱基，该位置为RBP4基因的5
’
调控区，该处碱基为G或C； 所述SNP分子标记与山羊产羔数具有显著的相关性。
[0020]在本专利技术中，所述SNP分子标记的CC或GC基因型对应的山羊产羔数 高于GG基因型对应的山羊产羔数。
[0021]在本专利技术中，所述山羊分子标记辅助育种优选的包括高产羔数山羊的早 期筛选。
[0022]在本专利技术中，所述检测SNP分子标记的试剂优选的包括基于KASP技 术开发的用于检测所述SNP分子标记的引物组；所述引物组包括 Primer_AlleleFAM、Primer_AlleleHEX和Primer_Common；所述 Primer_AlleleFAM的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，具体为： gaaggtgaccaagttcatgctCTCCCGACAGTGAGCGGCGGCCG；所述 Primer_AlleleHEX的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示，具体为： gaaggtcggagtcaacggattCTCCCGACAGTGAGCGGCGGCCC；所述 Primer_Common的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示，具体为： CGGTCCCCAGGCTCCATCTTGCC。
[0023]在本专利技术中，用于检测所述SNP分子标记的引物组基于核苷酸序列如 SEQ ID No.4所示的RBP4基因设计得到，具体为： GCGTTATGCAAGTGCTGGCCCGCCGGCCCCGGCGCCTCCCCCTCGGTC TTTCACCCCGCGCCGTTACGAAAGCGCGACCCCCTCCCCCCGGAGCTA TAAAGCCGCCCGGCGGCCCCCGCGGCGCGCTCGCCTTGCTGGCTCCAC GCGCGCTCGGACCCGCGGCCAGGCTTGCGCGCAGCTCCCGACAGTGA GCGGCGGCCSGGCGGGATGGGGGGCCGGCGCGGGAGGGATGGGGGCC CGGGATGGGTGTGATGAGGCTCTGGGGGCGGGCGGGATGGGAAGCCG GGGGGCTGGCGGGAGGAGGGC本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.检测SNP分子标记的试剂在山羊RBP4基因分型和/或山羊分子标记辅助育种中的应用，根据Ensembl数据库最新版本RBP4的注释(ENSCHIG00000023599)，所述SNP分子标记位于山羊26号染色体的第36491960位碱基，该位置为RBP4基因的5
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调控区，该处碱基为G或C；所述SNP分子标记与山羊产羔数具有显著的相关性。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述SNP分子标记的CC或GC基因型对应的山羊产羔数高于GG基因型对应的山羊产羔数。3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述山羊分子标记辅助育种包括高产羔数山羊的早期筛选。4.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述山羊的品种包括云上黑山羊。5.根据权利要求1～4中任意一项所述的应用，其特征在于，所述检测SNP分子标记的试剂包括引物组；所述引物组包括Primer_AlleleFAM、Primer_AlleleHEX和Primer...

【专利技术属性】
技术研发人员：储明星，李昆谕，郭思武，刘玉芳，洪琼花，
申请(专利权)人：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，
类型：发明
国别省市：