预测线粒体DNA突变阈值、生育风险和取卵数的方法技术

本发明专利技术公开预测线粒体DNA突变阈值、生育风险和取卵数的方法，包括以下步骤：先建立线粒体突变发病概率预测模型并估算突变阈值s，再建立生育风险预测模型并预测突变携带者的生育风险p，然后利用二项分布建立卵母细胞提取预测模型并计算突变携带者的PGT取卵数；本发明专利技术使用发病概率预测模型估算常见mtDNA突变的阈值，并预测母亲的生育风险和PGT取卵数，在建立的生育风险预测模型和取卵预测模型的基础上，只需要知道突变携带者的线粒体DNA突变比例就可以计算其生育风险与生育一个健康子代所需的最小PGT取卵数，有助于临床医生对携带mtDNA异质突变的家庭进行遗传管理并提供遗传咨询，并提供PGT的标准指南。并提供PGT的标准指南。并提供PGT的标准指南。

【技术实现步骤摘要】
预测线粒体DNA突变阈值、生育风险和取卵数的方法


[0001]本专利技术涉及线粒体疾病预测
，尤其涉及预测线粒体DNA突变阈值、生育风险和取卵数的方法。

技术介绍

[0002]线粒体疾病是最常见和最严重的遗传疾病之一，估计发病率为1:4300，线粒体DNA(mtDNA)突变是线粒体疾病的常见原因，由于缺乏保护性组蛋白和DNA修复机制不完善，mtDNA突变率高于核DNA，鉴于线粒体可以包含多个DNA拷贝，mtDNA突变可以同时影响所有基因拷贝(称为同源性)或部分拷贝(称为异质性)，一般来说，同质突变通常相对较轻，仅影响一个器官或组织，而异质突变可影响多个器官系统，导致严重的系统性线粒体遗传疾病，目前，据估计全球约0.5％的人群携带致病性mtDNA突变，已报道的致病性mtDNA突变超过300个，然而，目前还没有针对线粒体突变的有效治疗方法，由于mtDNA突变仅从母体传递给后代，因此，研究防止线粒体突变母系传播的方法迫在眉睫。
[0003]一个人卵母细胞含有大约10万个mtDNA分子，由于线粒体的遗传瓶颈，在卵子发生过程中只有少量的mt本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.预测线粒体DNA突变阈值、生育风险和取卵数的方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤一：先以m.8993T>G、m.8344A>G和m.3243A>G三种特定的mtDNA异质突变为基础，建立线粒体家系数据库，作为线粒体常见突变数据库，再基于突变水平采用二元logistic回归预测发病概率，并建立线粒体突变发病概率预测模型，接着利用发病概率预测模型估算突变阈值s；步骤二：基于母体多种细胞线粒体异质性数组和囊胚滋养层细胞线粒体异质性数组，先采用简化Sewell
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Wright公式和Kimura公式建立后代mtDNA突变水平的分布模型，即生育风险预测模型，再根据估算的突变阈值s和后代mtDNA突变水平的分布模型计算出0％到突变阈值s之间，mtDNA分布中受影响的累积概率，累积概率即生育风险p；步骤三：假设待取卵母细胞为X，以确保至少A个胚胎的突变水平低于突变阈值s的概率大于95％，受精卵发育成正常胚胎的比例为K，基于生育风险和假设条件，利用二项分布建立卵母细胞提取预测模型，即取卵预测模型，通过取卵预测模型计算突变携带者的PGT取卵数；步骤四：先通过拟合已报道的突变数据得到通用的突变阈值和参数b，再采用通用的突变阈值和参数b建立通用的生育风险和PGT取卵预测模型，接着利用通用的生育风险和取卵预测模型，在得知突变携带者突变水平的情况下预测突变携带者的生育风险和PGT取卵数。2.根据权利要求1所述的预测线粒体DNA突变阈值、生育风险和取卵数的方法，其特征在于：所述步骤一中，线粒体家系数据库的家系被分为“家族性的”、“新发的”和“信息不足的”三种类型，线粒体家系数据库的家族史数据来源于Mitomap和医院，若家族史呈阳性，则该家系为“家族性的”，若家族史呈阴性，且先证者母亲的mtDNA突变水平和所有被检测的母系亲属的mtDNA突变水平均为0％，则该家系为“新发的”，其余的家系由于信息不足而被认为是“信息不足的”。3.根据权利要求1所述的预测线粒体...

【专利技术属性】
技术研发人员：曹云霞，纪冬梅，杜忆南，张宁，张智康，刘卓立，邹薇薇，宗凯，
申请(专利权)人：安徽医科大学第一附属医院，
类型：发明
国别省市：